PYCARD

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UCP, 2KN6, 3J63, 5H8O

Ідентифікатори

Символи

PYCARD, ASC, CARD5, TMS, TMS-1, TMS1, PYD and CARD domain containing

Зовнішні ІД

OMIM: 606838 MGI: 1931465 HomoloGene: 8307 GeneCards: PYCARD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • interleukin-6 receptor binding • BMP receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • Pyrin domain binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • myosin I binding • tropomyosin binding • protease binding • transmembrane transporter binding • protein dimerization activity • cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • NLRP3 inflammasome complex • NLRP1 inflammasome complex • AIM2 inflammasome complex • ядерце • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • IkappaB kinase complex • клітинне ядро • secretory granule lumen • azurophil granule lumen • extracellular region • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • neuronal cell body • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана
Біологічний процес	• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity • regulation of apoptotic process • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of adaptive immune response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • процес імунної системи • cellular response to tumor necrosis factor • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • myeloid dendritic cell activation • positive regulation of T cell activation • defense response to virus • cellular response to interleukin-1 • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • вроджений імунітет • neutrophil degranulation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • activation of innate immune response • myeloid dendritic cell activation involved in immune response • positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of actin filament polymerization • regulation of protein stability • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of activated T cell proliferation • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • macropinocytosis • positive regulation of phagocytosis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of T cell migration • positive regulation of defense response to virus by host • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • response to bacterium • regulation of autophagy • interleukin-1 beta production • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of inflammatory response • protein homooligomerization • activation of cysteine-type endopeptidase activity • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • протеоліз • positive regulation of interleukin-1 beta production
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29108


66824

Ensembl


ENSG00000103490


ENSMUSG00000030793

UniProt


Q9ULZ3


Q9EPB4

RefSeq (мРНК)


NM_145183 NM_013258 NM_145182


NM_023258

RefSeq (білок)


NP_037390 NP_660183


NP_075747

Локус (UCSC)

Хр. 16: 31.2 – 31.2 Mb

Хр. 7: 127.59 – 127.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PYCARD (англ. PYD and CARD domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 21 627^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRARDAILD	ALENLTAEEL	KKFKLKLLSV	PLREGYGRIP	RGALLSMDAL
DLTDKLVSFY	LETYGAELTA	NVLRDMGLQE	MAGQLQAATH	QGSGAAPAGI
QAPPQSAAKP	GLHFIDQHRA	ALIARVTNVE	WLLDALYGKV	LTDEQYQAVR
AEPTNPSKMR	KLFSFTPAWN	WTCKDLLLQA	LRESQSYLVE	DLERS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martinon F., Burns K., Tschopp J. (2002). The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. Mol. Cell. 10: 417—426. PMID 12191486 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00599-3
Dowds T.A., Masumoto J., Zhu L., Inohara N., Nunez G. (2004). Cryopyrin-induced interleukin 1beta secretion in monocytic cells: enhanced activity of disease-associated mutants and requirement for ASC. J. Biol. Chem. 279: 21924—21928. PMID 15020601 DOI:10.1074/jbc.M401178200
Bedoya F., Sandler L.L., Harton J.A. (2007). Pyrin-only protein 2 modulates NF-kappaB and disrupts ASC:CLR interactions. J. Immunol. 178: 3837—3845. PMID 17339483 DOI:10.4049/jimmunol.178.6.3837
Bryan N.B., Dorfleutner A., Rojanasakul Y., Stehlik C. (2009). Activation of inflammasomes requires intracellular redistribution of the apoptotic speck-like protein containing a caspase recruitment domain. J. Immunol. 182: 3173—3182. PMID 19234215 DOI:10.4049/jimmunol.0802367
Fernandes-Alnemri T., Yu J.W., Datta P., Wu J., Alnemri E.S. (2009). AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA. Nature. 458: 509—513. PMID 19158676 DOI:10.1038/nature07710

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16608 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULZ3 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.