PSMD5

Ідентифікатори

Символи

PSMD5, S5B, proteasome 26S subunit, non-ATPase 5

Зовнішні ІД

OMIM: 604452 MGI: 1914248 HomoloGene: 37999 GeneCards: PSMD5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome accessory complex • нуклеоплазма • Протеасома
Біологічний процес	• proteasome regulatory particle assembly • proteasome assembly • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • MAPK cascade • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of cellular amino acid metabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • T cell receptor signaling pathway • трансмембранний транспорт • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • interleukin-1-mediated signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5711


66998

Ensembl


ENSG00000095261


ENSMUSG00000026869

UniProt


Q16401


Q8BJY1

RefSeq (мРНК)


NM_001270427 NM_005047


NM_080554 NM_001355544

RefSeq (білок)


NP_001257356 NP_005038


NP_542121 NP_001342473

Локус (UCSC)

Хр. 9: 120.82 – 120.84 Mb

Хр. 2: 34.74 – 34.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMD5 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 56 196^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAQALALLR	EVARLEAPLE	ELRALHSVLQ	AVPLNELRQQ	AAELRLGPLF
SLLNENHREK	TTLCVSILER	LLQAMEPVHV	ARNLRVDLQR	GLIHPDDSVK
ILTLSQIGRI	VENSDAVTEI	LNNAELLKQI	VYCIGGENLS	VAKAAIKSLS
RISLTQAGLE	ALFESNLLDD	LKSVMKTNDI	VRYRVYELII	EISSVSPESL
NYCTTSGLVT	QLLRELTGED	VLVRATCIEM	VTSLAYTHHG	RQYLAQEGVI
DQISNIIVGA	DSDPFSSFYL	PGFVKFFGNL	AVMDSPQQIC	ERYPIFVEKV
FEMIESQDPT	MIGVAVDTVG	ILGSNVEGKQ	VLQKTGTRFE	RLLMRIGHQS
KNAPVELKIR	CLDAISSLLY	LPPEQQTDDL	LRMTESWFSS	LSRDPLELFR
GISSQPFPEL	HCAALKVFTA	IANQPWAQKL	MFNSPGFVEY	VVDRSVEHDK
ASKDAKYELV	KALANSKTIA	EIFGNPNYLR	LRTYLSEGPY	YVKPVSTTAV
EGAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Deveraux Q., Jensen C., Rechsteiner M. (1995). Molecular cloning and expression of a 26 S protease subunit enriched in dileucine repeats. J. Biol. Chem. 270: 23726—23729. PMID 7559544 DOI:10.1074/jbc.270.40.23726
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Le Tallec B., Barrault M.B., Guerois R., Carre T., Peyroche A. (2009). Hsm3/S5b participates in the assembly pathway of the 19S regulatory particle of the proteasome. Mol. Cell. 33: 389—399. PMID 19217412 DOI:10.1016/j.molcel.2009.01.010

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9563 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16401 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.