PSMC6

Ідентифікатори

Символи

PSMC6, CADP44, HEL-S-73, P44, SUG2, p42, proteasome 26S subunit, ATPase 6, RPT5

Зовнішні ІД

OMIM: 602708 MGI: 1914339 HomoloGene: 100630 GeneCards: PSMC6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein-macromolecule adaptor activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TBP-class protein binding • ATP binding • hydrolase activity • identical protein binding • proteasome-activating activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear proteasome complex • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • мембрана • proteasome accessory complex • нуклеоплазма • cytosolic proteasome complex • Протеасома • екзосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • ubiquitin-dependent ERAD pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5706


67089

Ensembl


ENSG00000100519


ENSMUSG00000021832

UniProt


P62333


P62334

RefSeq (мРНК)


NM_002806 NM_001366414


NM_025959

RefSeq (білок)


NP_002797 NP_001353343


NP_080235

Локус (UCSC)

Хр. 14: 52.71 – 52.73 Mb

Хр. 14: 45.57 – 45.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMC6 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 44 173^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADPRDKALQ	DYRKKLLEHK	EIDGRLKELR	EQLKELTKQY	EKSENDLKAL
QSVGQIVGEV	LKQLTEEKFI	VKATNGPRYV	VGCRRQLDKS	KLKPGTRVAL
DMTTLTIMRY	LPREVDPLVY	NMSHEDPGNV	SYSEIGGLSE	QIRELREVIE
LPLTNPELFQ	RVGIIPPKGC	LLYGPPGTGK	TLLARAVASQ	LDCNFLKVVS
SSIVDKYIGE	SARLIREMFN	YARDHQPCII	FMDEIDAIGG	RRFSEGTSAD
REIQRTLMEL	LNQMDGFDTL	HRVKMIMATN	RPDTLDPALL	RPGRLDRKIH
IDLPNEQARL	DILKIHAGPI	TKHGEIDYEA	IVKLSDGFNG	ADLRNVCTEA
GMFAIRADHD	FVVQEDFMKA	VRKVADSKKL	ESKLDYKPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Fujiwara T., Watanabe T.K., Tanaka K., Slaughter C.A., Demartino G.N. (1996). cDNA cloning of p42, a shared subunit of two proteasome regulatory proteins, reveals a novel member of the AAA protein family. FEBS Lett. 387: 184—188. PMID 8674546 DOI:10.1016/0014-5793(96)00489-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9553 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P62333 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.