PRX |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PRX, CMT4F, periaxin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605725 MGI: 108176 HomoloGene: 76542 GeneCards: PRX |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Dejerine–Sottas disease[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • T-tubule |
---|
Біологічний процес | • axon ensheathment • regulation of RNA splicing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 40.39 – 40.41 Mb | Хр. 7: 27.2 – 27.22 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PRX (англ. Periaxin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 154 905[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEARSRSAEE | | LRRAELVEII | | VETEAQTGVS | | GINVAGGGKE | | GIFVRELRED |
SPAARSLSLQ | | EGDQLLSARV | | FFENFKYEDA | | LRLLQCAEPY | | KVSFCLKRTV |
PTGDLALRPG | | TVSGYEIKGP | | RAKVAKLNIQ | | SLSPVKKKKM | | VPGALGVPAD |
LAPVDVEFSF | | PKFSRLRRGL | | KAEAVKGPVP | | AAPARRRLQL | | PRLRVREVAE |
EAQAARLAAA | | APPPRKAKVE | | AEVAAGARFT | | APQVELVGPR | | LPGAEVGVPQ |
VSAPKAAPSA | | EAAGGFALHL | | PTLGLGAPAP | | PAVEAPAVGI | | QVPQVELPAL |
PSLPTLPTLP | | CLETREGAVS | | VVVPTLDVAA | | PTVGVDLALP | | GAEVEARGEA |
PEVALKMPRL | | SFPRFGARAK | | EVAEAKVAKV | | SPEARVKGPR | | LRMPTFGLSL |
LEPRPAAPEV | | VESKLKLPTI | | KMPSLGIGVS | | GPEVKVPKGP | | EVKLPKAPEV |
KLPKVPEAAL | | PEVRLPEVEL | | PKVSEMKLPK | | VPEMAVPEVR | | LPEVELPKVS |
EMKLPKVPEM | | AVPEVRLPEV | | QLLKVSEMKL | | PKVPEMAVPE | | VRLPEVQLPK |
VSEMKLPEVS | | EVAVPEVRLP | | EVQLPKVPEM | | KVPEMKLPKV | | PEMKLPEMKL |
PEVQLPKVPE | | MAVPDVHLPE | | VQLPKVPEMK | | LPEMKLPEVK | | LPKVPEMAVP |
DVHLPEVQLP | | KVPEMKLPKM | | PEMAVPEVRL | | PEVQLPKVSE | | MKLPKVPEMA |
VPDVHLPEVQ | | LPKVCEMKVP | | DMKLPEIKLP | | KVPEMAVPDV | | HLPEVQLPKV |
SEIRLPEMQV | | PKVPDVHLPK | | APEVKLPRAP | | EVQLKATKAE | | QAEGMEFGFK |
MPKMTMPKLG | | RAESPSRGKP | | GEAGAEVSGK | | LVTLPCLQPE | | VDGEAHVGVP |
SLTLPSVELD | | LPGALGLQGQ | | VPAAKMGKGE | | RVEGPEVAAG | | VREVGFRVPS |
VEIVTPQLPA | | VEIEEGRLEM | | IETKVKPSSK | | FSLPKFGLSG | | PKVAKAEAEG |
AGRATKLKVS | | KFAISLPKAR | | VGAEAEAKGA | | GEAGLLPALD | | LSIPQLSLDA |
HLPSGKVEVA | | GADLKFKGPR | | FALPKFGVRG | | RDTEAAELVP | | GVAELEGKGW |
GWDGRVKMPK | | LKMPSFGLAR | | GKEAEVQGDR | | ASPGEKAEST | | AVQLKIPEVE |
LVTLGAQEEG | | RAEGAVAVSG | | MQLSGLKVST | | AGQVVTEGHD | | AGLRMPPLGI |
SLPQVELTGF | | GEAGTPGQQA | | QSTVPSAEGT | | AGYRVQVPQV | | TLSLPGAQVA |
GGELLVGEGV | | FKMPTVTVPQ | | LELDVGLSRE | | AQAGEAATGE | | GGLRLKLPTL |
GARARVGGEG | | AEEQPPGAER | | TFCLSLPDVE | | LSPSGGNHAE | | YQVAEGEGEA |
GHKLKVRLPR | | FGLVRAKEGA | | EEGEKAKSPK | | LRLPRVGFSQ | | SEMVTGEGSP |
SPEEEEEEEE | | EGSGEGASGR | | RGRVRVRLPR | | VGLAAPSKAS | | RGQEGDAAPK |
SPVREKSPKF | | RFPRVSLSPK | | ARSGSGDQEE | | GGLRVRLPSV | | GFSETGAPGP |
ARMEGAQAAA | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shi Y., Zhang L., Yang T. (2014). Nuclear export of L-periaxin, mediated by its nuclear export signal in the PDZ domain. PLoS ONE. 9: E91953—E91953. PMID 24633211 DOI:10.1371/journal.pone.0091953
- Han H., Kursula P. (2014). Periaxin and AHNAK nucleoprotein 2 form intertwined homodimers through domain swapping. J. Biol. Chem. 289: 14121—14131. PMID 24675079 DOI:10.1074/jbc.M114.554816
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13797 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BXM0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |