PRKRA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DIX

Ідентифікатори

Символи

PRKRA, DYT16, PACT, RAX, HSD14, protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2

Зовнішні ІД

OMIM: 603424 MGI: 1344375 HomoloGene: 2738 GeneCards: PRKRA

Пов'язані генетичні захворювання

dystonia 16^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • double-stranded RNA binding • GO:0010577 enzyme activator activity • RNA binding • pre-miRNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • RISC-loading complex
Біологічний процес	• skeletal system morphogenesis • response to virus • outer ear morphogenesis • pre-miRNA processing • protein phosphorylation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • middle ear morphogenesis • cellular response to oxidative stress • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • protein stabilization • GO:0061715 miRNA metabolic process • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • Сайленсинг генів • GO:0022415 viral process • ear development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8575


23992

Ensembl


ENSG00000180228


ENSMUSG00000002731

UniProt


O75569


Q9WTX2

RefSeq (мРНК)


NM_001139517 NM_001139518 NM_001316362 NM_003690


NM_011871

RefSeq (білок)


NP_001132989 NP_001132990 NP_001303291 NP_003681


NP_036001

Локус (UCSC)

Хр. 2: 178.43 – 178.45 Mb

Хр. 2: 76.46 – 76.48 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PRKRA (англ. Protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 404^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQSRHRAEA	PPLEREDSGT	FSLGKMITAK	PGKTPIQVLH	EYGMKTKNIP
VYECERSDVQ	IHVPTFTFRV	TVGDITCTGE	GTSKKLAKHR	AAEAAINILK
ANASICFAVP	DPLMPDPSKQ	PKNQLNPIGS	LQELAIHHGW	RLPEYTLSQE
GGPAHKREYT	TICRLESFME	TGKGASKKQA	KRNAAEKFLA	KFSNISPENH
ISLTNVVGHS	LGCTWHSLRN	SPGEKINLLK	RSLLSIPNTD	YIQLLSEIAK
EQGFNITYLD	IDELSANGQY	QCLAELSTSP	ITVCHGSGIS	CGNAQSDAAH
NALQYLKIIA	ERK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Patel R.C., Sen G.C. (1998). PACT, a protein activator of the interferon-induced protein kinase, PKR. EMBO J. 17: 4379—4390. PMID 9687506 DOI:10.1093/emboj/17.15.4379
Ito T., Yang M., May W.S. (1999). RAX, a cellular activator for double-stranded RNA-dependent protein kinase during stress signaling. J. Biol. Chem. 274: 15427—15432. PMID 10336432 DOI:10.1074/jbc.274.22.15427
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Peters G.A., Hartmann R., Qin J., Sen G.C. (2001). Modular structure of PACT: distinct domains for binding and activating PKR. Mol. Cell. Biol. 21: 1908—1920. PMID 11238927 DOI:10.1128/MCB.21.6.1908-1920.2001
Peters G.A., Li S., Sen G.C. (2006). Phosphorylation of specific serine residues in the PKR activation domain of PACT is essential for its ability to mediate apoptosis. J. Biol. Chem. 281: 35129—35136. PMID 16982605 DOI:10.1074/jbc.M607714200
Kok K.H., Ng M.-H., Ching Y.-P., Jin D.-Y. (2007). Human TRBP and PACT directly interact with each other and associate with dicer to facilitate the production of small interfering RNA. J. Biol. Chem. 282: 17649—17657. PMID 17452327 DOI:10.1074/jbc.M611768200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRKRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9438 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75569 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.