PLXNB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JPH, 2OS6, 2R2O, 2REX, 3HM6, 3OL2, 3SU8, 3SUA

Ідентифікатори

Символи

PLXNB1, PLEXIN-B1, PLXN5, SEP, plexin B1

Зовнішні ІД

OMIM: 601053 MGI: 2154238 HomoloGene: 130508 GeneCards: PLXNB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTPase activating protein binding • semaphorin receptor activity • semaphorin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • semaphorin receptor complex • integral component of plasma membrane • extracellular region • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• ossification involved in bone maturation • negative regulation of cell adhesion • neuron projection morphogenesis • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of axonogenesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of cell shape • axon extension • negative regulation of osteoblast proliferation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • cell migration • regulation of cytoskeleton organization • semaphorin-plexin signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • inhibitory synapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5364


235611

Ensembl


ENSG00000164050


ENSMUSG00000053646

UniProt


O43157


Q8CJH3

RefSeq (мРНК)


NM_001130082 NM_002673


NM_172775

RefSeq (білок)


NP_001123554 NP_002664


NP_766363

Локус (UCSC)

Хр. 3: 48.4 – 48.43 Mb

Хр. 9: 108.92 – 108.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PLXNB1 (англ. Plexin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 135 амінокислот, а молекулярна маса — 232 298^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPALGPALLQ	ALWAGWVLTL	QPLPPTAFTP	NGTYLQHLAR	DPTSGTLYLG
ATNFLFQLSP	GLQLEATVST	GPVLDSRDCL	PPVMPDECPQ	AQPTNNPNQL
LLVSPGALVV	CGSVHQGVCE	QRRLGQLEQL	LLRPERPGDT	QYVAANDPAV
STVGLVAQGL	AGEPLLFVGR	GYTSRGVGGG	IPPITTRALW	PPDPQAAFSY
EETAKLAVGR	LSEYSHHFVS	AFARGASAYF	LFLRRDLQAQ	SRAFRAYVSR
VCLRDQHYYS	YVELPLACEG	GRYGLIQAAA	VATSREVAHG	EVLFAAFSSA
APPTVGRPPS	AAAGASGASA	LCAFPLDEVD	RLANRTRDAC	YTREGRAEDG
TEVAYIEYDV	NSDCAQLPVD	TLDAYPCGSD	HTPSPMASRV	PLEATPILEW
PGIQLTAVAV	TMEDGHTIAF	LGDSQGQLHR	VYLGPGSDGH	PYSTQSIQQG
SAVSRDLTFD	GTFEHLYVMT	QSTLLKVPVA	SCAQHLDCAS	CLAHRDPYCG
WCVLLGRCSR	RSECSRGQGP	EQWLWSFQPE	LGCLQVAAMS	PANISREETR
EVFLSVPDLP	PLWPGESYSC	HFGEHQSPAL	LTGSGVMCPS	PDPSEAPVLP
RGADYVSVSV	ELRFGAVVIA	KTSLSFYDCV	AVTELRPSAQ	CQACVSSRWG
CNWCVWQHLC	THKASCDAGP	MVASHQSPLV	SPDPPARGGP	SPSPPTAPKA
LATPAPDTLP	VEPGAPSTAT	ASDISPGASP	SLLSPWGPWA	GSGSISSPGS
TGSPLHEEPS	PPSPQNGPGT	AVPAPTDFRP	SATPEDLLAS	PLSPSEVAAV
PPADPGPEAL	HPTVPLDLPP	ATVPATTFPG	AMGSVKPALD	WLTREGGELP
EADEWTGGDA	PAFSTSTLLS	GDGDSAELEG	PPAPLILPSS	LDYQYDTPGL
WELEEATLGA	SSCPCVESVQ	GSTLMPVHVE	REIRLLGRNL	HLFQDGPGDN
ECVMELEGLE	VVVEARVECE	PPPDTQCHVT	CQQHQLSYEA	LQPELRVGLF
LRRAGRLRVD	SAEGLHVVLY	DCSVGHGDCS	RCQTAMPQYG	CVWCEGERPR
CVTREACGEA	EAVATQCPAP	LIHSVEPLTG	PVDGGTRVTI	RGSNLGQHVQ
DVLGMVTVAG	VPCAVDAQEY	EVSSSLVCIT	GASGEEVAGA	TAVEVPGRGR
GVSEHDFAYQ	DPKVHSIFPA	RGPRAGGTRL	TLNGSKLLTG	RLEDIRVVVG
DQPCHLLPEQ	QSEQLRCETS	PRPTPATLPV	AVWFGATERR	LQRGQFKYTL
DPNITSAGPT	KSFLSGGREI	CVRGQNLDVV	QTPRIRVTVV	SRMLQPSQGL
GRRRRVVPET	ACSLGPSCSS	QQFEEPCHVN	SSQLITCRTP	ALPGLPEDPW
VRVEFILDNL	VFDFATLNPT	PFSYEADPTL	QPLNPEDPTM	PFRHKPGSVF
SVEGENLDLA	MSKEEVVAMI	GDGPCVVKTL	TRHHLYCEPP	VEQPLPRHHA
LREAPDSLPE	FTVQMGNLRF	SLGHVQYDGE	SPGAFPVAAQ	VGLGVGTSLL
ALGVIIIVLM	YRRKSKQALR	DYKKVQIQLE	NLESSVRDRC	KKEFTDLMTE
MTDLTSDLLG	SGIPFLDYKV	YAERIFFPGH	RESPLHRDLG	VPESRRPTVE
QGLGQLSNLL	NSKLFLTKFI	HTLESQRTFS	ARDRAYVASL	LTVALHGKLE
YFTDILRTLL	SDLVAQYVAK	NPKLMLRRTE	TVVEKLLTNW	MSICLYTFVR
DSVGEPLYML	FRGIKHQVDK	GPVDSVTGKA	KYTLNDNRLL	REDVEYRPLT
LNALLAVGPG	AGEAQGVPVK	VLDCDTISQA	KEKMLDQLYK	GVPLTQRPDP
RTLDVEWRSG	VAGHLILSDE	DVTSEVQGLW	RRLNTLQHYK	VPDGATVALV
PCLTKHVLRE	NQDYVPGERT	PMLEDVDEGG	IRPWHLVKPS	DEPEPPRPRR
GSLRGGERER	AKAIPEIYLT	RLLSMKGTLQ	KFVDDLFQVI	LSTSRPVPLA
VKYFFDLLDE	QAQQHGISDQ	DTIHIWKTNS	LPLRFWINII	KNPQFVFDVQ
TSDNMDAVLL	VIAQTFMDAC	TLADHKLGRD	SPINKLLYAR	DIPRYKRMVE
RYYADIRQTV	PASDQEMNSV	LAELSWNYSG	DLGARVALHE	LYKYINKYYD
QIITALEEDG	TAQKMQLGYR	LQQIAAAVEN	KVTDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vikis H.G., Li W., He Z., Guan K.-L. (2000). The semaphorin receptor plexin-B1 specifically interacts with active Rac in a ligand-dependent manner. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 12457—12462. PMID 11035813 DOI:10.1073/pnas.220421797
Aurandt J., Vikis H.G., Gutkind J.S., Ahn N., Guan K.-L. (2002). The semaphorin receptor plexin-B1 signals through a direct interaction with the Rho-specific nucleotide exchange factor, LARG. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12085—12090. PMID 12196628 DOI:10.1073/pnas.142433199
Oinuma I., Katoh H., Harada A., Negishi M. (2003). Direct interaction of Rnd1 with Plexin-B1 regulates PDZ-RhoGEF-mediated Rho activation by Plexin-B1 and induces cell contraction in COS-7 cells. J. Biol. Chem. 278: 25671—25677. PMID 12730235 DOI:10.1074/jbc.M303047200
Swiercz J.M., Kuner R., Offermanns S. (2004). Plexin-B1/RhoGEF-mediated RhoA activation involves the receptor tyrosine kinase ErbB-2. J. Cell Biol. 165: 869—880. PMID 15210733 DOI:10.1083/jcb.200312094
Conrotto P., Corso S., Gamberini S., Comoglio P.M., Giordano S. (2004). Interplay between scatter factor receptors and B plexins controls invasive growth. Oncogene. 23: 5131—5137. PMID 15184888 DOI:10.1038/sj.onc.1207650

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9103 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43157 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.