PIWIL1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2L5C, 2L5D, 3O3I, 3O6E, 3O7V | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PIWIL1, CT80.1, HIWI, MIWI, PIWI, piwi like RNA-mediated gene silencing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605571 MGI: 1928897 HomoloGene: 37963 GeneCards: PIWIL1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein kinase binding • RNA binding • single-stranded RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • piRNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • polysome binding • mRNA cap binding complex binding |
---|
Клітинна компонента | • Полісома • клітинне ядро • mRNA cap binding complex • dense body • P granule • цитоплазма • chromatoid body |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • regulation of translation • GO:0007126 мейоз • диференціація клітин • Сайленсинг генів • Сперматогенез • negative regulation of transposition • piRNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • spermatid development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000275051 ENSG00000125207 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 130.34 – 130.37 Mb | Хр. 5: 128.78 – 128.83 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PIWIL1 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 861 амінокислот, а молекулярна маса — 98 603[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTGRARARAR | | GRARGQETAQ | | LVGSTASQQP | | GYIQPRPQPP | | PAEGELFGRG |
RQRGTAGGTA | | KSQGLQISAG | | FQELSLAERG | | GRRRDFHDLG | | VNTRQNLDHV |
KESKTGSSGI | | IVRLSTNHFR | | LTSRPQWALY | | QYHIDYNPLM | | EARRLRSALL |
FQHEDLIGKC | | HAFDGTILFL | | PKRLQQKVTE | | VFSKTRNGED | | VRITITLTNE |
LPPTSPTCLQ | | FYNIIFRRLL | | KIMNLQQIGR | | NYYNPNDPID | | IPSHRLVIWP |
GFTTSILQYE | | NSIMLCTDVS | | HKVLRSETVL | | DFMFNFYHQT | | EEHKFQEQVS |
KELIGLVVLT | | KYNNKTYRVD | | DIDWDQNPKS | | TFKKADGSEV | | SFLEYYRKQY |
NQEITDLKQP | | VLVSQPKRRR | | GPGGTLPGPA | | MLIPELCYLT | | GLTDKMRNDF |
NVMKDLAVHT | | RLTPEQRQRE | | VGRLIDYIHK | | NDNVQRELRD | | WGLSFDSNLL |
SFSGRILQTE | | KIHQGGKTFD | | YNPQFADWSK | | ETRGAPLISV | | KPLDNWLLIY |
TRRNYEAANS | | LIQNLFKVTP | | AMGMQMRKAI | | MIEVDDRTEA | | YLRVLQQKVT |
ADTQIVVCLL | | SSNRKDKYDA | | IKKYLCTDCP | | TPSQCVVART | | LGKQQTVMAI |
ATKIALQMNC | | KMGGELWRVD | | IPLKLVMIVG | | IDCYHDMTAG | | RRSIAGFVAS |
INEGMTRWFS | | RCIFQDRGQE | | LVDGLKVCLQ | | AALRAWNSCN | | EYMPSRIIVY |
RDGVGDGQLK | | TLVNYEVPQF | | LDCLKSIGRG | | YNPRLTVIVV | | KKRVNTRFFA |
QSGGRLQNPL | | PGTVIDVEVT | | RPEWYDFFIV | | SQAVRSGSVS | | PTHYNVIYDN |
SGLKPDHIQR | | LTYKLCHIYY | | NWPGVIRVPA | | PCQYAHKLAF | | LVGQSIHREP |
NLSLSNRLYY | | L |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Qiao D., Zeeman A.-M., Deng W., Looijenga L.H.J., Lin H. (2002). Molecular characterization of hiwi, a human member of the piwi gene family whose overexpression is correlated to seminomas. Oncogene. 21: 3988—3999. PMID 12037681 DOI:10.1038/sj.onc.1205505
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome. Genomics. 82: 323—330. PMID 12906857 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
- Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903—910. PMID 21193640 DOI:10.1073/pnas.1017762108
- Zeng L., Zhang Q., Yan K., Zhou M.M. (2011). Structural insights into piRNA recognition by the human PIWI-like 1 PAZ domain. Proteins. 79: 2004—2009. PMID 21465557 DOI:10.1002/prot.23003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9007 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96J94 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |