PICK1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PICK1, PICK, PRKCABP, protein interacting with PRKCA 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605926 MGI: 894645 HomoloGene: 7470 GeneCards: PICK1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein domain specific binding • Arp2/3 complex binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • actin binding • signaling receptor binding • G protein-coupled receptor binding • protein kinase C binding • phospholipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • endocytic vesicle membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • цитоскелет • presynaptic membrane • мітохондрія • гіалоплазма • aggresome • Синаптичні бульбашки • trans-Golgi network membrane • postsynaptic early endosome |
---|
Біологічний процес | • cellular response to glucose starvation • glial cell development • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • positive regulation of receptor internalization • neuronal ion channel clustering • regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • monoamine transport • receptor clustering • DNA methylation involved in gamete generation • negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • dendritic spine organization • dendritic spine maintenance • protein phosphorylation • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • Довготривале пригнічення • cellular response to decreased oxygen levels • DNA methylation involved in embryo development • intracellular protein transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001039583 NM_001039584 NM_012407 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001034672 NP_001034673 NP_036539 NP_001034672.1 NP_001034673.1
| NP_036539.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 38.06 – 38.08 Mb | Хр. 15: 79.11 – 79.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PICK1 (англ. Protein interacting with PRKCA 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот, а молекулярна маса — 46 600[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFADLDYDIE | | EDKLGIPTVP | | GKVTLQKDAQ | | NLIGISIGGG | | AQYCPCLYIV |
QVFDNTPAAL | | DGTVAAGDEI | | TGVNGRSIKG | | KTKVEVAKMI | | QEVKGEVTIH |
YNKLQADPKQ | | GMSLDIVLKK | | VKHRLVENMS | | SGTADALGLS | | RAILCNDGLV |
KRLEELERTA | | ELYKGMTEHT | | KNLLRAFYEL | | SQTHRAFGDV | | FSVIGVREPQ |
PAASEAFVKF | | ADAHRSIEKF | | GIRLLKTIKP | | MLTDLNTYLN | | KAIPDTRLTI |
KKYLDVKFEY | | LSYCLKVKEM | | DDEEYSCIAL | | GEPLYRVSTG | | NYEYRLILRC |
RQEARARFSQ | | MRKDVLEKME | | LLDQKHVQDI | | VFQLQRLVST | | MSKYYNDCYA |
VLRDADVFPI | | EVDLAHTTLA | | YGLNQEEFTD | | GEEEEEEEDT | | AAGEPSRDTR |
GAAGPLDKGG | | SWCDS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах[en].
Література
- Takeya R., Takeshige K., Sumimoto H. (2000). Interaction of the PDZ domain of human PICK1 with class I ADP-ribosylation factors. Biochem. Biophys. Res. Commun. 267: 149—155. PMID 10623590 DOI:10.1006/bbrc.1999.1932
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hruska-Hageman A.M., Wemmie J.A., Price M.P., Welsh M.J. (2002). Interaction of the synaptic protein PICK1 (protein interacting with C kinase 1) with the non-voltage gated sodium channels BNC1 (brain Na+ channel 1) and ASIC (acid-sensing ion channel). Biochem. J. 361: 443—450. PMID 11802773 DOI:10.1042/0264-6021:3610443
- Ashbourne-Excoffon K.J.D., Hruska-Hageman A.M., Klotz M., Traver G.L., Zabner J. (2004). A role for the PDZ-binding domain of the coxsackie B virus and adenovirus receptor (CAR) in cell adhesion and growth. J. Cell Sci. 117: 4401—4409. PMID 15304526 DOI:10.1242/jcs.01300
- Dev K.K., Nakanishi S., Henley J.M. (2004). The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C-alpha and GluR2 as interacting ligands. J. Biol. Chem. 279: 41393—41397. PMID 15247289 DOI:10.1074/jbc.M404499200
- Lin S.H.S., Arai A.C., Wang Z., Nothacker H.-P., Civelli O. (2001). The carboxyl terminus of the prolactin-releasing peptide receptor interacts with PDZ domain proteins involved in alpha-amino-3-hydroxy-5-methylisoxazole-4-propionic acid receptor clustering. Mol. Pharmacol. 60: 916—923. PMID 11641419
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9394 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NRD5 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |