PHC3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PZN, 4PZO

Ідентифікатори

Символи

PHC3, EDR3, HPH3, polyhomeotic homolog 3

Зовнішні ІД

MGI: 2181434 HomoloGene: 69390 GeneCards: PHC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• PcG protein complex • PRC1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• multicellular organism development • negative regulation of G0 to G1 transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80012


241915

Ensembl


ENSG00000173889


ENSMUSG00000037652

UniProt


Q8NDX5


Q8CHP6

RefSeq (мРНК)


NM_001308116 NM_024947


NM_001165954 NM_001165955 NM_001165956 NM_153421

RefSeq (білок)


NP_001295045 NP_079223


NP_001159426 NP_001159427 NP_001159428 NP_700470

Локус (UCSC)

Хр. 3: 170.09 – 170.18 Mb

Хр. 3: 30.95 – 31.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PHC3 (англ. Polyhomeotic homolog 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 983 амінокислот, а молекулярна маса — 106 162^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTEPNPGTS	SVSTTTSSTT	TTTITTSSSR	MQQPQISVYS	GSDRHAVQVI
QQALHRPPSS	AAQYLQQMYA	AQQQHLMLHT	AALQQQHLSS	SQLQSLAAVQ
ASLSSGRPST	SPTGSVTQQS	SMSQTSINLS	TSPTPAQLIS	RSQASSSTSG
SITQQTMLLG	STSPTLTASQ	AQMYLRAQML	IFTPATTVAA	VQSDIPVVSS
SSSSSCQSAA	TQVQNLTLRS	QKLGVLSSSQ	NGPPKSTSQT	QSLTICHNKT
TVTSSKISQR	DPSPESNKKG	ESPSLESRST	AVTRTSSIHQ	LIAPASYSPI
QPHSLIKHQQ	IPLHSPPSKV	SHHQLILQQQ	QQQIQPITLQ	NSTQDPPPSQ
HCIPLQNHGL	PPAPSNAQSQ	HCSPIQSHPS	PLTVSPNQSQ	SAQQSVVVSP
PPPHSPSQSP	TIIIHPQALI	QPHPLVSSAL	QPGPNLQQST	ANQVQATAQL
NLPSHLPLPA	SPVVHIGPVQ	QSALVSPGQQ	IVSPSHQQYS	SLQSSPIPIA
SPPQMSTSPP	AQIPPLPLQS	MQSLQVQPEI	LSQGQVLVQN	ALVSEEELPA
AEALVQLPFQ	TLPPPQTVAV	NLQVQPPAPV	DPPVVYQVED	VCEEEMPEES
DECVRMDRTP	PPPTLSPAAI	TVGRGEDLTS	EHPLLEQVEL	PAVASVSASV
IKSPSDPSHV	SVPPPPLLLP	AATTRSNSTS	MHSSIPSIEN	KPPQAIVKPQ
ILTHVIEGFV	IQEGLEPFPV	SRSSLLIEQP	VKKRPLLDNQ	VINSVCVQPE
LQNNTKHADN	SSDTEMEDMI	AEETLEEMDS	ELLKCEFCGK	MGYANEFLRS
KRFCTMSCAK	RYNVSCSKKF	ALSRWNRKPD	NQSLGHRGRR	PSGPDGAARE
HILRQLPITY	PSAEEDLASH	EDSVPSAMTT	RLRRQSERER	ERELRDVRIR
KMPENSDLLP	VAQTEPSIWT	VDDVWAFIHS	LPGCQDIADE	FRAQEIDGQA
LLLLKEDHLM	SAMNIKLGPA	LKICARINSL	KES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Tonkin E., Hagan D.-M., Li W., Strachan T. (2002). Identification and characterisation of novel mammalian homologues of Drosophila polyhomeotic permits new insights into relationships between members of the polyhomeotic family. Hum. Genet. 111: 435—442. PMID 12384788 DOI:10.1007/s00439-002-0814-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15682 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NDX5 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.