PDLIM4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2EEG, 2V1W, 4Q2O | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDLIM4, RIL, PDZ and LIM domain 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603422 MGI: 1353470 HomoloGene: 2735 GeneCards: PDLIM4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • protein homodimerization activity • alpha-actinin binding • actin binding • muscle alpha-actinin binding |
---|
Клітинна компонента | • stress fiber • early endosome lumen • filamentous actin • recycling endosome lumen • postsynaptic membrane • клітинне ядро • цитоплазма • ендосома • цитоскелет • мембрана • lamellipodium • міжклітинні контакти • early endosome membrane • cell projection • neuron projection • dendritic spine • синапс • perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome membrane • Z discdkac |
---|
Біологічний процес | • actin cytoskeleton reorganization • excitatory chemical synaptic transmission • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 132.26 – 132.27 Mb | Хр. 11: 53.95 – 53.96 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDLIM4 (англ. PDZ and LIM domain 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 398[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPHSVTLRGP | | SPWGFRLVGG | | RDFSAPLTIS | | RVHAGSKAAL | | AALCPGDLIQ |
AINGESTELM | | THLEAQNRIK | | GCHDHLTLSV | | SRPEGRSWPS | | APDDSKAQAH |
RIHIDPEIQD | | GSPTTSRRPS | | GTGTGPEDGR | | PSLGSPYGQP | | PRFPVPHNGS |
SEATLPAQMS | | TLHVSPPPSA | | DPARGLPRSR | | DCRVDLGSEV | | YRMLREPAEP |
VAAEPKQSGS | | FRYLQGMLEA | | GEGGDWPGPG | | GPRNLKPTAS | | KLGAPLSGLQ |
GLPECTRCGH | | GIVGTIVKAR | | DKLYHPECFM | | CSDCGLNLKQ | | RGYFFLDERL |
YCESHAKARV | | KPPEGYDVVA | | VYPNAKVELV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16501 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P50479 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |