PDLIM2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2PA1, 3PDV | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDLIM2, MYSTIQUE, SLIM, PDZ and LIM domain 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609722 MGI: 2384850 HomoloGene: 11006 GeneCards: PDLIM2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • Z discdkac • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_198042 NM_021630 NM_176871 NM_001368120 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_067643 NP_789847 NP_932159 NP_001355049 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 22.58 – 22.6 Mb | Хр. 14: 70.4 – 70.42 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDLIM2 (англ. PDZ and LIM domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 37 459[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALTVDVAGP | | APWGFRITGG | | RDFHTPIMVT | | KVAERGKAKD | | ADLRPGDIIV |
AINGESAEGM | | LHAEAQSKIR | | QSPSPLRLQL | | DRSQATSPGQ | | TNGDSSLEVL |
ATRFQGSVRT | | YTESQSSLRS | | SYSSPTSLSP | | RAGSPFSPPP | | SSSSLTGEAA |
ISRSFQSLAC | | SPGLPAADRL | | SYSGRPGSRQ | | AGLGRAGDSA | | VLVLPPSPGP |
RSSRPSMDSE | | GGSLLLDEDS | | EVFKMLQENR | | EGRAAPRQSS | | SFRLLQEALE |
AEERGGTPAF | | LPSSLSPQSS | | LPASRALATP | | PKLHTCEKCS | | TSIANQAVRI |
QEGRYRHPGC | | YTCADCGLNL | | KMRGHFWVGD | | ELYCEKHARQ | | RYSAPATLSS |
RA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13992 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96JY6 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |