PCOLCE : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PCOLCE

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UAP

Ідентифікатори

Символи

PCOLCE, PCPE, PCPE-1, PCPE1, procollagen C-endopeptidase enhancer

Зовнішні ІД

OMIM: 600270 MGI: 105099 HomoloGene: 1946 GeneCards: PCOLCE

Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidase activator activity • collagen binding • extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• multicellular organism development • протеоліз • positive regulation of peptidase activity • cellular response to leukemia inhibitory factor
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5118


18542

Ensembl


ENSG00000106333


ENSMUSG00000029718

UniProt


Q15113


Q61398

RefSeq (мРНК)


NM_002593


NM_008788

RefSeq (білок)


NP_002584


NP_032814

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.6 – 100.61 Mb

Хр. 5: 137.6 – 137.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCOLCE (англ. Procollagen C-endopeptidase enhancer) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 449 амінокислот, а молекулярна маса — 47 972^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPAATASLL	GPLLTACALL	PFAQGQTPNY	TRPVFLCGGD	VKGESGYVAS
EGFPNLYPPN	KECIWTITVP	EGQTVSLSFR	VFDLELHPAC	RYDALEVFAG
SGTSGQRLGR	FCGTFRPAPL	VAPGNQVTLR	MTTDEGTGGR	GFLLWYSGRA
TSGTEHQFCG	GRLEKAQGTL	TTPNWPESDY	PPGISCSWHI	IAPPDQVIAL
TFEKFDLEPD	TYCRYDSVSV	FNGAVSDDSR	RLGKFCGDAV	PGSISSEGNE
LLVQFVSDLS	VTADGFSASY	KTLPRGTAKE	GQGPGPKRGT	EPKVKLPPKS
QPPEKTEESP	SAPDAPTCPK	QCRRTGTLQS	NFCASSLVVT	ATVKSMVREP
GEGLAVTVSL	IGAYKTGGLD	LPSPPTGASL	KFYVPCKQCP	PMKKGVSYLL
MGQVEENRGP	VLPPESFVVL	HRPNQDQILT	NLSKRKCPSQ	PVRAAASQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Секретований назовні.

Література

Scott I.C., Clark T.G., Takahara K., Hoffman G.G., Greenspan D.S. (1999). Structural organization and expression patterns of the human and mouse genes for the type I procollagen COOH-terminal proteinase enhancer protein. Genomics. 55: 229—234. PMID 9933570 DOI:10.1006/geno.1998.5663
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8738 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15113 (англ.) . Архів оригіналу за 11 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.