PCDHB14

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WYJ

Ідентифікатори

Символи

PCDHB14, PCDH-BETA14, protocadherin beta 14

Зовнішні ІД

OMIM: 606340 MGI: 2136758 HomoloGene: 134303 GeneCards: PCDHB14

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • synapse assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56122


93891

Ensembl


ENSG00000120327


ENSMUSG00000046191

UniProt


Q9Y5E9


Q91XZ9

RefSeq (мРНК)


NM_018934


NM_053145

RefSeq (білок)


NP_061757


NP_444375

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.22 – 141.23 Mb

Хр. 18: 37.64 – 37.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB14 (англ. Protocadherin beta 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 87 548^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEIRGALDLR	KRQVLIFLVL	LGLSRAGTES	AHYSVAEETE	IGSFVANLAR
DLGLGVEELS	SREARVVSDD	NKKYLHLDLL	TGNLLLNEKL	DRDELCGSTE
PCVLHFQVVL	ENPLQFFRFE	LCVKDINDHS	PTFLDKEILI	KISEGTTVGA
TFLMESAQDL	DVGSNSLQNY	TISPNSHFYI	KIPDSSDRKI	YPELVLDRAL
DYEQEAELRL	TLTAVDGGSP	PKSGTTLVLI	KVLDINDNAP	EFPQSLYEVQ
VPEDRPLGSW	IATISAKDLD	AGNYGKISYT	FFHASEDIRK	TFEINPISGE
VNLRSPLDFE	VIQSYTINIQ	ATDGGGLSGK	CTLLVKVMDI	NDNPPEVTIS
SITKRIPENA	SETLVALFSI	LDQDSGDNGR	MICSIQDNLP	FFLKPTFKNF
FTLVSEKALD	RESQAEYNIT	ITVTDLGTPR	LKTEYNITVL	LSDVNDNAPT
FTQTSYTLFV	RENNSPALHI	GSVSATDRDS	GTNAQVNYSL	LPPQDRHLPL
ASLVSINADN	GHLFALRSLD	YEALQEFEFR	VGATDRGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKHRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLHV	LLVDGFSQPY	LPLPEAAPAQ	AQADSLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVLLFVA	VRLCRRSRAA	SVGRCSVPEG	PFPGHLVDVS	GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSG	TNEFKFLKPI	IPNFQVHDTG	RNMGEIENFR	NSFGLNIQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8685 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y5E9 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.