PCDH17

Ідентифікатори

Символи

PCDH17, PCDH68, PCH68, protocadherin 17

Зовнішні ІД

OMIM: 611760 MGI: 2684924 HomoloGene: 8700 GeneCards: PCDH17

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• presynaptic active zone assembly • adult behavior • regulation of synaptic vesicle clustering • negative regulation of synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • synapse assembly • synaptic membrane adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


27253


219228

Ensembl


ENSG00000118946


ENSMUSG00000035566

UniProt


O14917


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001040429 NM_014459


NM_001013753

RefSeq (білок)


NP_001035519


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 13: 57.63 – 57.73 Mb

Хр. 14: 84.68 – 84.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDH17 (англ. Protocadherin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 159 амінокислот, а молекулярна маса — 126 229^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYLSICCCFL	LWAPALTLKN	LNYSVPEEQG	AGTVIGNIGR	DARLQPGLPP
AERGGGGRSK	SGSYRVLENS	APHLLDVDAD	SGLLYTKQRI	DRESLCRHNA
KCQLSLEVFA	NDKEICMIKV	EIQDINDNAP	SFSSDQIEMD	ISENAAPGTR
FPLTSAHDPD	AGENGLRTYL	LTRDDHGLFG	LDVKSRGDGT	KFPELVIQKA
LDREQQNHHT	LVLTALDGGE	PPRSATVQIN	VKVIDSNDNS	PVFEAPSYLV
ELPENAPLGT	VVIDLNATDA	DEGPNGEVLY	SFSSYVPDRV	RELFSIDPKT
GLIRVKGNLD	YEENGMLEID	VQARDLGPNP	IPAHCKVTVK	LIDRNDNAPS
IGFVSVRQGA	LSEAAPPGTV	IALVRVTDRD	SGKNGQLQCR	VLGGGGTGGG
GGLGGPGGSV	PFKLEENYDN	FYTVVTDRPL	DRETQDEYNV	TIVARDGGSP
PLNSTKSFAI	KILDENDNPP	RFTKGLYVLQ	VHENNIPGEY	LGSVLAQDPD
LGQNGTVSYS	ILPSHIGDVS	IYTYVSVNPT	NGAIYALRSF	NFEQTKAFEF
KVLAKDSGAP	AHLESNATVR	VTVLDVNDNA	PVIVLPTLQN	DTAELQVPRN
AGLGYLVSTV	RALDSDFGES	GRLTYEIVDG	NDDHLFEIDP	SSGEIRTLHP
FWEDVTPVVE	LVVKVTDHGK	PTLSAVAKLI	IRSVSGSLPE	GVPRVNGEQH
HWDMSLPLIV	TLSTISIILL	AAMITIAVKC	KRENKEIRTY	NCRIAEYSHP
QLGGGKGKKK	KINKNDIMLV	QSEVEERNAM	NVMNVVSSPS	LATSPMYFDY
QTRLPLSSPR	SEVMYLKPAS	NNLTVPQGHA	GCHTSFTGQG	TNASETPATR
MSIIQTDNFP	AEPNYMGSRQ	QFVQSSSTFK	DPERASLRDS	GHGDSDQADS
DQDTNKGSCC	DMSVREALKM	KTTSTKSQPL	EQEPEECVNC	TDECRVLGHS
DRCWMPQFPA	ANQAENADYR	TNLFVPTVEA	NVETETYETV	NPTGKKTFCT
FGKDKREHTI	LIANVKPYLK	AKRALSPLLQ	EVPSASSSPT	KACIEPCTST
KGSLDGCEAK	PGALAEASSQ	YLPTDSQYLS	PSKQPRDPPF	MASDQMARVF
ADVHSRASRD	SSEMGAVLEQ	LDHPNRDLGR	ESVDAEEVVR	EIDKLLQDCR
GNDPVAVRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14267 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14917 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.