PCBP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WVN, 1ZTG, 3VKE

Ідентифікатори

Символи

PCBP1, HEL-S-85, HNRPE1, HNRPX, hnRNP-E1, hnRNP-X, poly(rC) binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601209 MGI: 1345635 HomoloGene: 68506 GeneCards: PCBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • single-stranded DNA binding • sequence-specific single stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • екзосома • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • viral RNA genome replication • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5093


23983

Ensembl


ENSG00000169564


ENSMUSG00000051695

UniProt


Q15365


P60335

RefSeq (мРНК)


NM_006196


NM_011865

RefSeq (білок)


NP_006187


NP_035995

Локус (UCSC)

Хр. 2: 70.09 – 70.09 Mb

Хр. 6: 86.5 – 86.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCBP1 (англ. Poly(rC) binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 37 498^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAGVTESGL	NVTLTIRLLM	HGKEVGSIIG	KKGESVKRIR	EESGARINIS
EGNCPERIIT	LTGPTNAIFK	AFAMIIDKLE	EDINSSMTNS	TAASRPPVTL
RLVVPATQCG	SLIGKGGCKI	KEIRESTGAQ	VQVAGDMLPN	STERAITIAG
VPQSVTECVK	QICLVMLETL	SQSPQGRVMT	IPYQPMPASS	PVICAGGQDR
CSDAAGYPHA	THDLEGPPLD	AYSIQGQHTI	SPLDLAKLNQ	VARQQSHFAM
MHGGTGFAGI	DSSSPEVKGY	WASLDASTQT	THELTIPNNL	IGCIIGRQGA
NINEIRQMSG	AQIKIANPVE	GSSGRQVTIT	GSAASISLAQ	YLINARLSSE
KGMGCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як реплікація вірусних РНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Leffers H., Dejgaard K., Celis J.E. (1995). Characterisation of two major cellular poly(rC)-binding human proteins, each containing three K-homologous (KH) domains. Eur. J. Biochem. 230: 447—453. PMID 7607214 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.0447h.x
Aasheim H.-C., Loukianova T., Deggerdal A., Smeland E.B. (1994). Tissue specific expression and cDNA structure of a human transcript encoding a nucleic acid binding [oligo(dC)] protein related to the pre-mRNA binding protein K. Nucleic Acids Res. 22: 959—964. PMID 8152927 DOI:10.1093/nar/22.6.959
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Walter B.L., Parsley T.B., Ehrenfeld E., Semler B.L. (2002). Distinct poly(rC) binding protein KH domain determinants for poliovirus translation initiation and viral RNA replication. J. Virol. 76: 12008—12022. PMID 12414943 DOI:10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Kiledjian M., Wang X., Liebhaber S.A. (1995). Identification of two KH domain proteins in the alpha-globin mRNP stability complex. EMBO J. 14: 4357—4364. PMID 7556077

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8647 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, Q15365 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.