PALLD

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DM2, 2DM3

Ідентифікатори

Символи

PALLD, CGI-151, CGI151, MYN, PNCA1, SIH002, palladin, cytoskeletal associated protein

Зовнішні ІД

OMIM: 608092 MGI: 1919583 HomoloGene: 75052 GeneCards: PALLD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• muscle alpha-actinin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cell-cell adhesion mediator activity
Клітинна компонента	• cell projection • focal adhesion • growth cone • ruffle • клітинна мембрана • аксон • міжклітинні контакти • Z disc • мікрофіламент • actin cytoskeleton • podosome • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• epithelial cell morphogenesis • keratinocyte development • cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • cell migration • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • axon guidance • dendrite self-avoidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23022


72333

Ensembl


ENSG00000129116


ENSMUSG00000058056

UniProt


Q8WX93


Q9ET54

RefSeq (мРНК)

NM_001166108 NM_001166109 NM_001166110 NM_016081 NM_001367567
NM_001367568 NM_001367569 NM_001367570


NM_001081390 NM_001293772 NM_001293773 NM_001293774

RefSeq (білок)

NP_001159580 NP_001159581 NP_001159582 NP_057165 NP_001354496
NP_001354497 NP_001354498 NP_001354499


NP_001074859 NP_001280701 NP_001280702 NP_001280703

Локус (UCSC)

Хр. 4: 168.5 – 168.93 Mb

Хр. 8: 61.96 – 62.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PALLD (англ. Palladin, cytoskeletal associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 383 амінокислот, а молекулярна маса — 150 564^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGTSSHESF	YDSLSDMQEE	SKNTDFFPGL	SAFLSQEEIN	KSLDLARRAI
ADSETEDFDS	EKEISQIFST	SPASLCEHPS	HKETKLGEHA	SRRPQDNRST
PVQPLAEKQT	KSISSPVSKR	KPAMSPLLTR	PSYIRSLRKA	EKRGAKTPST
NVKPKTPHQR	KGGPQSQLCD	KAANLIEELT	SIFKAAKPRN	RSPNGESSSP
DSGYLSPKNQ	PSALLSASAS	QSPMEDQGEM	EREVKSPGAR	HCYQDNQDLA
VPHNRKSHPQ	PHSALHFPAA	PRFIQKLRSQ	EVAEGSRVYL	ECRVTGNPTP
RVRWFCEGKE	LHNTPDIQIH	CEGGDLHTLI	IAEAFEDDTG	RYTCLATNPS
GSDTTSAEVF	IEGASSTDSD	SESLAFKSRA	GAMPQAQKKT	TSVSLTIGSS
SPKTGVTTAV	IQPLSVPVQQ	VHSPTSYLCR	PDGTTTAYFP	PVFTKELQNT
AVAEGQVVVL	ECRVRGAPPL	QVQWFRQGSE	IQDSPDFRIL	QKKPRSTAEP
EEICTLVIAE	TFPEDAGIFT	CSARNDYGSA	TSTAQLVVTS	ANTENCSYES
MGESNNDHFQ	HFPPPPPILE	TSSLELASKK	PSEIQQVNNP	ELGLSRAALQ
MQFNAAERET	NGVHPSRGVN	GLINGKANSN	KSLPTPAVLL	SPTKEPPPLL
AKPKLDPLKL	QQLQNQIRLE	QEAGARQPPP	APRSAPPSPP	FPPPPAFPEL
AACTPPASPE	PMSALASRSA	PAMQSSGSFN	YARPKQFIAA	QNLGPASGHG
TPASSPSSSS	LPSPMSPTPR	QFGRAPVPPF	AQPFGAEPEA	PWGSSSPSPP
PPPPPVFSPT	AAFPVPDVFP	LPPPPPPLPS	PGQASHCSSP	ATRFGHSQTP
AAFLSALLPS	QPPPAAVNAL	GLPKGVTPAG	FPKKASRTAR	IASDEEIQGT
KDAVIQDLER	KLRFKEDLLN	NGQPRLTYEE	RMARRLLGAD	SATVFNIQEP
EEETANQEYK	VSSCEQRLIS	EIEYRLERSP	VDESGDEVQY	GDVPVENGMA
PFFEMKLKHY	KIFEGMPVTF	TCRVAGNPKP	KIYWFKDGKQ	ISPKSDHYTI
QRDLDGTCSL	HTTASTLDDD	GNYTIMAANP	QGRISCTGRL	MVQAVNQRGR
SPRSPSGHPH	VRRPRSRSRD	SGDENEPIQE	RFFRPHFLQA	PGDLTVQEGK
LCRMDCKVSG	LPTPDLSWQL	DGKPVRPDSA	HKMLVRENGV	HSLIIEPVTS
RDAGIYTCIA	TNRAGQNSFS	LELVVAAKEA	HKPPVFIEKL	QNTGVADGYP
VRLECRVLGV	PPPQIFWKKE	NESLTHSTDR	VSMHQDNHGY	ICLLIQGATK
EDAGWYTVSA	KNEAGIVSCT	ARLDVYTQWH	QQSQSTKPKK	VRPSASRYAA
LSDQGLDIKA	AFQPEANPSH	LTLNTALVES	EDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Roenty M., Taivainen A., Moza M., Otey C.A., Carpen O. (2004). Molecular analysis of the interaction between palladin and alpha-actinin. FEBS Lett. 566: 30—34. PMID 15147863 DOI:10.1016/j.febslet.2004.04.006
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Jin L., Kern M.J., Otey C.A., Wamhoff B.R., Somlyo A.V. (2007). Angiotensin II, focal adhesion kinase, and PRX1 enhance smooth muscle expression of lipoma preferred partner and its newly identified binding partner palladin to promote cell migration. Circ. Res. 100: 817—825. PMID 17322171 DOI:10.1161/01.RES.0000261351.54147.de
Chin Y.R., Toker A. (2010). The actin-bundling protein palladin is an Akt1-specific substrate that regulates breast cancer cell migration. Mol. Cell. 38: 333—344. PMID 20471940 DOI:10.1016/j.molcel.2010.02.031

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17068 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8WX93 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.