PADI2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4N20, 4N22, 4N24, 4N25, 4N26, 4N28, 4N2A, 4N2B, 4N2C, 4N2D, 4N2E, 4N2F, 4N2G, 4N2H, 4N2I, 4N2K, 4N2L, 4N2M, 4N2N

Ідентифікатори

Символи

PADI2, PAD-H19, PAD2, PDI2, peptidyl arginine deiminase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607935 MGI: 1338892 HomoloGene: 7214 GeneCards: PADI2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • estrogen receptor binding • hydrolase activity • protein-arginine deiminase activity • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• екзосома • цитоплазма • гіалоплазма • extracellular region • клітинне ядро • azurophil granule lumen
Біологічний процес	• negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • substantia nigra development • intracellular estrogen receptor signaling pathway • negative regulation of lymphocyte chemotaxis • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • neutrophil degranulation • cellular response to leukemia inhibitory factor
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11240


18600

Ensembl


ENSG00000117115


ENSMUSG00000028927

UniProt


Q9Y2J8


Q08642

RefSeq (мРНК)


NM_007365


NM_008812

RefSeq (білок)


NP_031391


NP_032838

Локус (UCSC)

Хр. 1: 17.07 – 17.12 Mb

Хр. 4: 140.63 – 140.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PADI2 (англ. Peptidyl arginine deiminase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 665 амінокислот, а молекулярна маса — 75 564^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRERTVRLQ	YGSRVEAVYV	LGTYLWTDVY	SAAPAGAQTF	SLKHSEHVWV
EVVRDGEAEE	VATNGKQRWL	LSPSTTLRVT	MSQASTEASS	DKVTVNYYDE
EGSIPIDQAG	LFLTAIEISL	DVDADRDGVV	EKNNPKKASW	TWGPEGQGAI
LLVNCDRETP	WLPKEDCRDE	KVYSKEDLKD	MSQMILRTKG	PDRLPAGYEI
VLYISMSDSD	KVGVFYVENP	FFGQRYIHIL	GRRKLYHVVK	YTGGSAELLF
FVEGLCFPDE	GFSGLVSIHV	SLLEYMAQDI	PLTPIFTDTV	IFRIAPWIMT
PNILPPVSVF	VCCMKDNYLF	LKEVKNLVEK	TNCELKVCFQ	YLNRGDRWIQ
DEIEFGYIEA	PHKGFPVVLD	SPRDGNLKDF	PVKELLGPDF	GYVTREPLFE
SVTSLDSFGN	LEVSPPVTVN	GKTYPLGRIL	IGSSFPLSGG	RRMTKVVRDF
LKAQQVQAPV	ELYSDWLTVG	HVDEFMSFVP	IPGTKKFLLL	MASTSACYKL
FREKQKDGHG	EAIMFKGLGG	MSSKRITINK	ILSNESLVQE	NLYFQRCLDW
NRDILKKELG	LTEQDIIDLP	ALFKMDEDHR	ARAFFPNMVN	MIVLDKDLGI
PKPFGPQVEE	ECCLEMHVRG	LLEPLGLECT	FIDDISAYHK	FLGEVHCGTN
VRRKPFTFKW	WHMVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18341 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y2J8 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.