NUP160

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5A9Q

Ідентифікатори

Символи

NUP160, nucleoporin 160, Nup160, 160kDa, 2810011M03Rik, AA414952, AU020188, Gtl-13, Gtl1-13, Gtl13, mKIAA0197, NPHS19

Зовнішні ІД

OMIM: 607614 HomoloGene: 32509 GeneCards: NUP160

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• гіалоплазма • nuclear envelope • ядерна пора • nuclear pore outer ring • клітинне ядро • кінетохор • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • protein transport • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • nephron development • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23279


311182

Ensembl


ENSG00000030066


ENSRNOG00000028215

UniProt


Q12769


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_015231 NM_001318399


NM_001107744

RefSeq (білок)


NP_001305328 NP_056046


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 11: 47.78 – 47.85 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP160 (англ. Nucleoporin 160) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 436 амінокислот, а молекулярна маса — 162 121^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLHLSAAPPA	PPPEVTATAR	PCLCSVGRRG	DGGKMAAAGA	LERSFVELSG
AERERPRHFR	EFTVCSIGTA	NAVAGAVKYS	ESAGGFYYVE	SGKLFSVTRN
RFIHWKTSGD	TLELMEESLD	INLLNNAIRL	KFQNCSVLPG	GVYVSETQNR
VIILMLTNQT	VHRLLLPHPS	RMYRSELVVD	SQMQSIFTDI	GKVDFTDPCN
YQLIPAVPGI	SPNSTASTAW	LSSDGEALFA	LPCASGGIFV	LKLPPYDIPG
MVSVVELKQS	SVMQRLLTGW	MPTAIRGDQS	PSDRPLSLAV	HCVEHDAFIF
ALCQDHKLRM	WSYKEQMCLM	VADMLEYVPV	KKDLRLTAGT	GHKLRLAYSP
TMGLYLGIYM	HAPKRGQFCI	FQLVSTESNR	YSLDHISSLF	TSQETLIDFA
LTSTDIWALW	HDAENQTVVK	YINFEHNVAG	QWNPVFMQPL	PEEEIVIRDD
QDPREMYLQS	LFTPGQFTNE	ALCKALQIFC	RGTERNLDLS	WSELKKEVTL
AVENELQGSV	TEYEFSQEEF	RNLQQEFWCK	FYACCLQYQE	ALSHPLALHL
NPHTNMVCLL	KKGYLSFLIP	SSLVDHLYLL	PYENLLTEDE	TTISDDVDIA
RDVICLIKCL	RLIEESVTVD	MSVIMEMSCY	NLQSPEKAAE	QILEDMITID
VENVMEDICS	KLQEIRNPIH	AIGLLIREMD	YETEVEMEKG	FNPAQPLNIR
MNLTQLYGSN	TAGYIVCRGV	HKIASTRFLI	CRDLLILQQL	LMRLGDAVIW
GTGQLFQAQQ	DLLHRTAPLL	LSYYLIKWGS	ECLATDVPLD	TLESNLQHLS
VLELTDSGAL	MANRFVSSPQ	TIVELFFQEV	ARKHIISHLF	SQPKAPLSQT
GLNWPEMITA	ITSYLLQLLW	PSNPGCLFLE	CLMGNCQYVQ	LQDYIQLLHP
WCQVNVGSCR	FMLGRCYLVT	GEGQKALECF	CQAASEVGKE	EFLDRLIRSE
DGEIVSTPRL	QYYDKVLRLL	DVIGLPELVI	QLATSAITEA	GDDWKSQATL
RTCIFKHHLD	LGHNSQAYEA	LTQIPDSSRQ	LDCLRQLVVV	LCERSQLQDL
VEFPYVNLHN	EVVGIIESRA	RAVDLMTHNY	YELLYAFHIY	RHNYRKAGTV
MFEYGMRLGR	EVRTLRGLEK	QGNCYLAALN	CLRLIRPEYA	WIVQPVSGAV
YDRPGASPKR	NHDGECTAAP	TNRQIEILEL	EDLEKECSLA	RIRLTLAQHD
PSAVAVAGSS	SAEEMVTLLV	QAGLFDTAIS	LCQTFKLPLT	PVFEGLAFKC
IKLQFGGEAA	QAEAWAWLAA	NQLSSVITTK	ESSATDEAWR	LLSTYLERYK
VQNNLYHHCV	INKLLSHGVP	LPNWLINSYK	KVDAAELLRL	YLNYDLLEEA
VDLVSEYVDA	VLGKGHQYFG	IEFPLSATAP	MVWLPYSSID	QLLQALGENS
ANSHNIALSQ	KILDKLEDYQ	QKVDKATRDL	LYRRTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18017 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12769 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.