NCOR2
NCOR2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, nuclear receptor corepressor 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 GeneCards: NCOR2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 124.32 – 124.57 Mb | Хр. 5: 125.02 – 125.18 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
NCOR2 (англ. Nuclear receptor corepressor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 525 амінокислот, а молекулярна маса — 274 804[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSGSTQPVAQ | TWRATEPRYP | PHSLSYPVQI | ARTHTDVGLL | EYQHHSRDYA | ||||
SHLSPGSIIQ | PQRRRPSLLS | EFQPGNERSQ | ELHLRPESHS | YLPELGKSEM | ||||
EFIESKRPRL | ELLPDPLLRP | SPLLATGQPA | GSEDLTKDRS | LTGKLEPVSP | ||||
PSPPHTDPEL | ELVPPRLSKE | ELIQNMDRVD | REITMVEQQI | SKLKKKQQQL | ||||
EEEAAKPPEP | EKPVSPPPIE | SKHRSLVQII | YDENRKKAEA | AHRILEGLGP | ||||
QVELPLYNQP | SDTRQYHENI | KINQAMRKKL | ILYFKRRNHA | RKQWEQKFCQ | ||||
RYDQLMEAWE | KKVERIENNP | RRRAKESKVR | EYYEKQFPEI | RKQRELQERM | ||||
QSRVGQRGSG | LSMSAARSEH | EVSEIIDGLS | EQENLEKQMR | QLAVIPPMLY | ||||
DADQQRIKFI | NMNGLMADPM | KVYKDRQVMN | MWSEQEKETF | REKFMQHPKN | ||||
FGLIASFLER | KTVAECVLYY | YLTKKNENYK | SLVRRSYRRR | GKSQQQQQQQ | ||||
QQQQQQQQQQ | PMPRSSQEEK | DEKEKEKEAE | KEEEKPEVEN | DKEDLLKEKT | ||||
DDTSGEDNDE | KEAVASKGRK | TANSQGRRKG | RITRSMANEA | NSEEAITPQQ | ||||
SAELASMELN | ESSRWTEEEM | ETAKKGLLEH | GRNWSAIARM | VGSKTVSQCK | ||||
NFYFNYKKRQ | NLDEILQQHK | LKMEKERNAR | RKKKKAPAAA | SEEAAFPPVV | ||||
EDEEMEASGV | SGNEEEMVEE | AEALHASGNE | VPRGECSGPA | TVNNSSDTES | ||||
IPSPHTEAAK | DTGQNGPKPP | ATLGADGPPP | GPPTPPPEDI | PAPTEPTPAS | ||||
EATGAPTPPP | APPSPSAPPP | VVPKEEKEEE | TAAAPPVEEG | EEQKPPAAEE | ||||
LAVDTGKAEE | PVKSECTEEA | EEGPAKGKDA | EAAEATAEGA | LKAEKKEGGS | ||||
GRATTAKSSG | APQDSDSSAT | CSADEVDEAE | GGDKNRLLSP | RPSLLTPTGD | ||||
PRANASPQKP | LDLKQLKQRA | AAIPPIQVTK | VHEPPREDAA | PTKPAPPAPP | ||||
PPQNLQPESD | APQQPGSSPR | GKSRSPAPPA | DKEAEKPVFF | PAFAAEAQKL | ||||
PGDPPCWTSG | LPFPVPPREV | IKASPHAPDP | SAFSYAPPGH | PLPLGLHDTA | ||||
RPVLPRPPTI | SNPPPLISSA | KHPSVLERQI | GAISQGMSVQ | LHVPYSEHAK | ||||
APVGPVTMGL | PLPMDPKKLA | PFSGVKQEQL | SPRGQAGPPE | SLGVPTAQEA | ||||
SVLRGTALGS | VPGGSITKGI | PSTRVPSDSA | ITYRGSITHG | TPADVLYKGT | ||||
ITRIIGEDSP | SRLDRGREDS | LPKGHVIYEG | KKGHVLSYEG | GMSVTQCSKE | ||||
DGRSSSGPPH | ETAAPKRTYD | MMEGRVGRAI | SSASIEGLMG | RAIPPERHSP | ||||
HHLKEQHHIR | GSITQGIPRS | YVEAQEDYLR | REAKLLKREG | TPPPPPPSRD | ||||
LTEAYKTQAL | GPLKLKPAHE | GLVATVKEAG | RSIHEIPREE | LRHTPELPLA | ||||
PRPLKEGSIT | QGTPLKYDTG | ASTTGSKKHD | VRSLIGSPGR | TFPPVHPLDV | ||||
MADARALERA | CYEESLKSRP | GTASSSGGSI | ARGAPVIVPE | LGKPRQSPLT | ||||
YEDHGAPFAG | HLPRGSPVTT | REPTPRLQEG | SLSSSKASQD | RKLTSTPREI | ||||
AKSPHSTVPE | HHPHPISPYE | HLLRGVSGVD | LYRSHIPLAF | DPTSIPRGIP | ||||
LDAAAAYYLP | RHLAPNPTYP | HLYPPYLIRG | YPDTAALENR | QTIINDYITS | ||||
QQMHHNAATA | MAQRADMLRG | LSPRESSLAL | NYAAGPRGII | DLSQVPHLPV | ||||
LVPPTPGTPA | TAMDRLAYLP | TAPQPFSSRH | SSSPLSPGGP | THLTKPTTTS | ||||
SSERERDRDR | ERDRDREREK | SILTSTTTVE | HAPIWRPGTE | QSSGSSGSSG | ||||
GGGGSSSRPA | SHSHAHQHSP | ISPRTQDALQ | QRPSVLHNTG | MKGIITAVEP | ||||
STPTVLRSTS | TSSPVRPAAT | FPPATHCPLG | GTLDGVYPTL | MEPVLLPKEA | ||||
PRVARPERPR | ADTGHAFLAK | PPARSGLEPA | SSPSKGSEPR | PLVPPVSGHA | ||||
TIARTPAKNL | APHHASPDPP | APPASASDPH | REKTQSKPFS | IQELELRSLG | ||||
YHGSSYSPEG | VEPVSPVSSP | SLTHDKGLPK | HLEELDKSHL | EGELRPKQPG | ||||
PVKLGGEAAH | LPHLRPLPES | QPSSSPLLQT | APGVKGHQRV | VTLAQHISEV | ||||
ITQDYTRHHP | QQLSAPLPAP | LYSFPGASCP | VLDLRRPPSD | LYLPPPDHGA | ||||
PARGSPHSEG | GKRSPEPNKT | SVLGGGEDGI | EPVSPPEGMT | EPGHSRSAVY | ||||
PLLYRDGEQT | EPSRMGSKSP | GNTSQPPAFF | SKLTESNSAM | VKSKKQEINK | ||||
KLNTHNRNEP | EYNISQPGTE | IFNMPAITGT | GLMTYRSQAV | QEHASTNMGL | ||||
EAIIRKALMG | KYDQWEESPP | LSANAFNPLN | ASASLPAAMP | ITAADGRSDH | ||||
TLTSPGGGGK | AKVSGRPSSR | KAKSPAPGLA | SGDRPPSVSS | VHSEGDCNRR | ||||
TPLTNRVWED | RPSSAGSTPF | PYNPLIMRLQ | AGVMASPPPP | GLPAGSGPLA | ||||
GPHHAWDEEP | KPLLCSQYET | LSDSE |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Sande S., Privalsky M.L. (1996). Identification of TRACs (T3 receptor-associating cofactors), a family of cofactors that associate with, and modulate the activity of, nuclear hormone receptors. Mol. Endocrinol. 10: 813—825. PMID 8813722 DOI:10.1210/mend.10.7.8813722
- Chen J.D., Evans R.M. (1995). A transcriptional co-repressor that interacts with nuclear hormone receptors. Nature. 377: 454—457. PMID 7566127 DOI:10.1038/377454a0
- Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
- Hauksdottir H., Farboud B., Privalsky M.L. (2003). Retinoic acid receptors beta and gamma do not repress, but instead activate target gene transcription in both the absence and presence of hormone ligand. Mol. Endocrinol. 17: 373—385. PMID 12554770 DOI:10.1210/me.2002-0340
- Goodson M.L., Jonas B.A., Privalsky M.L. (2005). Alternative mRNA splicing of SMRT creates functional diversity by generating corepressor isoforms with different affinities for different nuclear receptors. J. Biol. Chem. 280: 7493—7503. PMID 15632172 DOI:10.1074/jbc.M411514200
Примітки
Див. також
- Хромосома 12
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |