NCF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1GD5, 1K4U, 1KQ6, 1NG2, 1O7K, 1OV3, 1UEC, 1W70, 1WLP

Ідентифікатори

Символи

NCF1, NCF1A, NOXO2, SH3PXD1A, p47phox, Neutrophil cytosolic factor 1, CGD1

Зовнішні ІД

OMIM: 608512 MGI: 97283 HomoloGene: 30964 GeneCards: NCF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity • SH3 domain binding • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • electron transfer activity • lipid binding • superoxide-generating NADPH oxidase activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • Фаголізосома • extrinsic component of membrane • дендрит (нейробіологія) • НАДФН-оксидаза • комплекс Ґольджі • rough endoplasmic reticulum • neuronal cell body • podosome • клітинна мембрана
Біологічний процес	• protein targeting to membrane • superoxide anion generation • cellular defense response • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • вроджений імунітет • superoxide metabolic process • GO:0097285 апоптоз • respiratory burst • podosome assembly • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of JNK cascade • cellular response to cadmium ion • positive regulation of p38MAPK cascade • Електронтранспортний ланцюг • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • cellular response to oxidative stress • cell redox homeostasis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


653361


17969

Ensembl


ENSG00000158517


ENSMUSG00000015950

UniProt


P14598


Q09014

RefSeq (мРНК)


NM_000265


NM_001286037 NM_010876

RefSeq (білок)


NP_000256


NP_001272966 NP_035006

Локус (UCSC)

Хр. 7: 74.77 – 74.79 Mb

Хр. 5: 134.25 – 134.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NCF1 (англ. Neutrophil cytosolic factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 44 652^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDTFIRHIA	LLGFEKRFVP	SQHYVYMFLV	KWQDLSEKVV	YRRFTEIYEF
HKTLKEMFPI	EAGAINPENR	IIPHLPAPKW	FDGQRAAENR	QGTLTEYCGT
LMSLPTKISR	CPHLLDFFKV	RPDDLKLPTD	NQTKKPETYL	MPKDGKSTAT
DITGPIILQT	YRAIANYEKT	SGSEMALSTG	DVVEVVEKSE	SGWWFCQMKA
KRGWIPASFL	EPLDSPDETE	DPEPNYAGEP	YVAIKAYTAV	EGDEVSLLEG
EAVEVIHKLL	DGWWVIRKDD	VTGYFPSMYL	QKSGQDVSQA	QRQIKRGAPP
RRSSIRNAHS	IHQRSRKRLS	QDAYRRNSVR	FLQQRRRQAR	PGPQSPGSPL
EEERQTQRSK	PQPAVPPRPS	ADLILNRCSE	STKRKLASAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Volpp B.D., Nauseef W.M., Clark R.A. (1989). Cloning of the cDNA and functional expression of the 47-kilodalton cytosolic component of human neutrophil respiratory burst oxidase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 7195—7199. PMID 2550933 DOI:10.1073/pnas.86.18.7195
Lomax K.J., Leto T.L., Nunoi H., Gallin J.I., Malech H.L. (1989). Recombinant 47-kilodalton cytosol factor restores NADPH oxidase in chronic granulomatous disease. Science. 245: 409—412. PMID 2547247 DOI:10.1126/science.2547247
Rodaway A.R.F., Teahan C.G., Casimir C.M., Segal A.W., Bentley D.L. (1990). Characterization of the 47-kilodalton autosomal chronic granulomatous disease protein: tissue-specific expression and transcriptional control by retinoic acid. Mol. Cell. Biol. 10: 5388—5396. PMID 2398896 DOI:10.1128/MCB.10.10.5388
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
Kleino I., Ortiz R.M., Yritys M., Huovila A.P., Saksela K. (2009). Alternative splicing of ADAM15 regulates its interactions with cellular SH3 proteins. J. Cell. Biochem. 108: 877—885. PMID 19718658 DOI:10.1002/jcb.22317

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7660 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P14598 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.