NCF1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/Protein_NCF1_PDB_1gd5.png/250px-Protein_NCF1_PDB_1gd5.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1GD5, 1K4U, 1KQ6, 1NG2, 1O7K, 1OV3, 1UEC, 1W70, 1WLP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NCF1, NCF1A, NOXO2, SH3PXD1A, p47phox, Neutrophil cytosolic factor 1, CGD1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608512 MGI: 97283 HomoloGene: 30964 GeneCards: NCF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity • SH3 domain binding • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • electron transfer activity • lipid binding • superoxide-generating NADPH oxidase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • Фаголізосома • extrinsic component of membrane • дендрит (нейробіологія) • НАДФН-оксидаза • комплекс Ґольджі • rough endoplasmic reticulum • neuronal cell body • podosome • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • protein targeting to membrane • superoxide anion generation • cellular defense response • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • вроджений імунітет • superoxide metabolic process • GO:0097285 апоптоз • respiratory burst • podosome assembly • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of JNK cascade • cellular response to cadmium ion • positive regulation of p38MAPK cascade • Електронтранспортний ланцюг • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • cellular response to oxidative stress • cell redox homeostasis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 74.77 – 74.79 Mb | Хр. 5: 134.25 – 134.26 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NCF1 (англ. Neutrophil cytosolic factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 44 652[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGDTFIRHIA | | LLGFEKRFVP | | SQHYVYMFLV | | KWQDLSEKVV | | YRRFTEIYEF |
HKTLKEMFPI | | EAGAINPENR | | IIPHLPAPKW | | FDGQRAAENR | | QGTLTEYCGT |
LMSLPTKISR | | CPHLLDFFKV | | RPDDLKLPTD | | NQTKKPETYL | | MPKDGKSTAT |
DITGPIILQT | | YRAIANYEKT | | SGSEMALSTG | | DVVEVVEKSE | | SGWWFCQMKA |
KRGWIPASFL | | EPLDSPDETE | | DPEPNYAGEP | | YVAIKAYTAV | | EGDEVSLLEG |
EAVEVIHKLL | | DGWWVIRKDD | | VTGYFPSMYL | | QKSGQDVSQA | | QRQIKRGAPP |
RRSSIRNAHS | | IHQRSRKRLS | | QDAYRRNSVR | | FLQQRRRQAR | | PGPQSPGSPL |
EEERQTQRSK | | PQPAVPPRPS | | ADLILNRCSE | | STKRKLASAV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Volpp B.D., Nauseef W.M., Clark R.A. (1989). Cloning of the cDNA and functional expression of the 47-kilodalton cytosolic component of human neutrophil respiratory burst oxidase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 7195—7199. PMID 2550933 DOI:10.1073/pnas.86.18.7195
- Lomax K.J., Leto T.L., Nunoi H., Gallin J.I., Malech H.L. (1989). Recombinant 47-kilodalton cytosol factor restores NADPH oxidase in chronic granulomatous disease. Science. 245: 409—412. PMID 2547247 DOI:10.1126/science.2547247
- Rodaway A.R.F., Teahan C.G., Casimir C.M., Segal A.W., Bentley D.L. (1990). Characterization of the 47-kilodalton autosomal chronic granulomatous disease protein: tissue-specific expression and transcriptional control by retinoic acid. Mol. Cell. Biol. 10: 5388—5396. PMID 2398896 DOI:10.1128/MCB.10.10.5388
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
- Kleino I., Ortiz R.M., Yritys M., Huovila A.P., Saksela K. (2009). Alternative splicing of ADAM15 regulates its interactions with cellular SH3 proteins. J. Cell. Biochem. 108: 877—885. PMID 19718658 DOI:10.1002/jcb.22317
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7660 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P14598 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |