NCAPD2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NCAPD2, CAP-D2, CNAP1, hCAP-D2, non-SMC condensin I complex subunit D2, MCPH21 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615638 MGI: 1915548 HomoloGene: 6497 GeneCards: NCAPD2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • хромосома • нуклеоплазма • Конденсин • nuclear chromosome • condensed chromosome • клітинне ядро • condensed chromosome, centromeric region • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • mitotic chromosome condensation • meiotic chromosome condensation • поділ клітини • chromosome separation • chromosome condensation • клітинний цикл • GO:0007067 мітоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 6.49 – 6.53 Mb | Хр. 6: 125.14 – 125.17 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NCAPD2 (англ. Non-SMC condensin I complex subunit D2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 401 амінокислот, а молекулярна маса — 157 182[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPQMYEFHL | | PLSPEELLKS | | GGVNQYVVQE | | VLSIKHLPPQ | | LRAFQAAFRA |
QGPLAMLQHF | | DTIYSILHHF | | RSIDPGLKED | | TLQFLIKVVS | | RHSQELPAIL |
DDTTLSGSDR | | NAHLNALKMN | | CYALIRLLES | | FETMASQTNL | | VDLDLGGKGK |
KARTKAAHGF | | DWEEERQPIL | | QLLTQLLQLD | | IRHLWNHSII | | EEEFVSLVTG |
CCYRLLENPT | | INHQKNRPTR | | EAITHLLGVA | | LTRYNHMLSA | | TVKIIQMLQH |
FEHLAPVLVA | | AVSLWATDYG | | MKSIVGEIVR | | EIGQKCPQEL | | SRDPSGTKGF |
AAFLTELAER | | VPAILMSSMC | | ILLDHLDGEN | | YMMRNAVLAA | | MAEMVLQVLS |
GDQLEAAARD | | TRDQFLDTLQ | | AHGHDVNSFV | | RSRVLQLFTR | | IVQQKALPLT |
RFQAVVALAV | | GRLADKSVLV | | CKNAIQLLAS | | FLANNPFSCK | | LSDADLAGPL |
QKETQKLQEM | | RAQRRTAAAS | | AVLDPEEEWE | | AMLPELKSTL | | QQLLQLPQGE |
EEIPEQIANT | | ETTEDVKGRI | | YQLLAKASYK | | KAIILTREAT | | GHFQESEPFS |
HIDPEESEET | | RLLNILGLIF | | KGPAASTQEK | | NPRESTGNMV | | TGQTVCKNKP |
NMSDPEESRG | | NDELVKQEML | | VQYLQDAYSF | | SRKITEAIGI | | ISKMMYENTT |
TVVQEVIEFF | | VMVFQFGVPQ | | ALFGVRRMLP | | LIWSKEPGVR | | EAVLNAYRQL |
YLNPKGDSAR | | AKAQALIQNL | | SLLLVDASVG | | TIQCLEEILC | | EFVQKDELKP |
AVTQLLWERA | | TEKVACCPLE | | RCSSVMLLGM | | MARGKPEIVG | | SNLDTLVSIG |
LDEKFPQDYR | | LAQQVCHAIA | | NISDRRKPSL | | GKRHPPFRLP | | QEHRLFERLR |
ETVTKGFVHP | | DPLWIPFKEV | | AVTLIYQLAE | | GPEVICAQIL | | QGCAKQALEK |
LEEKRTSQED | | PKESPAMLPT | | FLLMNLLSLA | | GDVALQQLVH | | LEQAVSGELC |
RRRVLREEQE | | HKTKDPKEKN | | TSSETTMEEE | | LGLVGATADD | | TEAELIRGIC |
EMELLDGKQT | | LAAFVPLLLK | | VCNNPGLYSN | | PDLSAAASLA | | LGKFCMISAT |
FCDSQLRLLF | | TMLEKSPLPI | | VRSNLMVATG | | DLAIRFPNLV | | DPWTPHLYAR |
LRDPAQQVRK | | TAGLVMTHLI | | LKDMVKVKGQ | | VSEMAVLLID | | PEPQIAALAK |
NFFNELSHKG | | NAIYNLLPDI | | ISRLSDPELG | | VEEEPFHTIM | | KQLLSYITKD |
KQTESLVEKL | | CQRFRTSRTE | | RQQRDLAYCV | | SQLPLTERGL | | RKMLDNFDCF |
GDKLSDESIF | | SAFLSVVGKL | | RRGAKPEGKA | | IIDEFEQKLR | | ACHTRGLDGI |
KELEIGQAGS | | QRAPSAKKPS | | TGSRYQPLAS | | TASDNDFVTP | | EPRRTTRRHP |
NTQQRASKKK | | PKVVFSSDES | | SEEDLSAEMT | | EDETPKKTTP | | ILRASARRHR |
S |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
- Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24305 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q15021 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |