MAGOH

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1P27, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2XB2, 3EX7

Ідентифікатори

Символи

MAGOH, MAGOH1, MAGOHA, mago homolog, exon junction complex core component, mago homolog, exon junction complex subunit

Зовнішні ІД

OMIM: 602603 MGI: 1330312 HomoloGene: 1776 GeneCards: MAGOH

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • exon-exon junction complex • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA transport • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • mRNA 3'-end processing • regulation of translation • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4116


17149

Ensembl


ENSG00000162385


ENSMUSG00000028609

UniProt


P61326


P61327

RefSeq (мРНК)


NM_002370


NM_001282737

RefSeq (білок)


NP_002361


NP_001269666

Локус (UCSC)

Хр. 1: 53.23 – 53.24 Mb

Хр. 4: 107.74 – 107.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MAGOH (англ. Mago homolog, exon junction complex core component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 17 164^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESDFYLRYY	VGHKGKFGHE	FLEFEFRPDG	KLRYANNSNY	KNDVMIRKEA
YVHKSVMEEL	KRIIDDSEIT	KEDDALWPPP	DRVGRQELEI	VIGDEHISFT
TSKIGSLIDV	NQSKDPEGLR	VFYYLVQDLK	CLVFSLIGLH	FKIKPI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhao X.F., Nowak N.J., Shows T.B., Aplan P.D. (2000). MAGOH interacts with a novel RNA-binding protein. Genomics. 63: 145—148. PMID 10662555 DOI:10.1006/geno.1999.6064
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Fribourg S., Gatfield D., Izaurralde E., Conti E. (2003). A novel mode of RBD-protein recognition in the Y14-Mago complex. Nat. Struct. Biol. 10: 433—439. PMID 12730685 DOI:10.1038/nsb926
Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
Diem M.D., Chan C.C., Younis I., Dreyfuss G. (2007). PYM binds the cytoplasmic exon-junction complex and ribosomes to enhance translation of spliced mRNAs. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 1173—1179. PMID 18026120 DOI:10.1038/nsmb1321

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6815 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P61326 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.