LTB : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

LTB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4MXW

Ідентифікатори

Символи

LTB, TNFC, TNFSF3, p33, Lymphotoxin beta, TNLG1C

Зовнішні ІД

OMIM: 600978 MGI: 104796 HomoloGene: 1752 GeneCards: LTB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• tumor necrosis factor receptor binding • cytokine activity • signaling receptor binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір • компонент клітини
Біологічний процес	• cell-cell signaling • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • lymph node development • експресія генів • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • skin development • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4050


16994

Ensembl

ENSG00000223448 ENSG00000238114 ENSG00000236925 ENSG00000231314 ENSG00000204487
ENSG00000236237 ENSG00000227507 ENSG00000206437


ENSMUSG00000024399

UniProt


Q06643


P41155

RefSeq (мРНК)


NM_009588 NM_002341


NM_008518

RefSeq (білок)


NP_002332 NP_033666


NP_032544

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.58 – 31.58 Mb

Хр. 17: 35.41 – 35.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LTB (англ. Lymphotoxin beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот, а молекулярна маса — 25 390^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGALGLEGRG	GRLQGRGSLL	LAVAGATSLV	TLLLAVPITV	LAVLALVPQD
QGGLVTETAD	PGAQAQQGLG	FQKLPEEEPE	TDLSPGLPAA	HLIGAPLKGQ
GLGWETTKEQ	AFLTSGTQFS	DAEGLALPQD	GLYYLYCLVG	YRGRAPPGGG
DPQGRSVTLR	SSLYRAGGAY	GPGTPELLLE	GAETVTPVLD	PARRQGYGPL
WYTSVGFGGL	VQLRRGERVY	VNISHPDMVD	FARGKTFFGA	VMVG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Neville M.J., Campbell R.D. (1999). A new member of the Ig superfamily and a V-ATPase G subunit are among the predicted products of novel genes close to the TNF locus in the human MHC. J. Immunol. 162: 4745—4754. PMID 10202016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6711 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q06643 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.