LIMS2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3IXE

Ідентифікатори

Символи

LIMS2, PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, LIM zinc finger domain containing 2, MDRCMTT

Зовнішні ІД

OMIM: 607908 MGI: 2385067 HomoloGene: 41214 GeneCards: LIMS2

Пов'язані генетичні захворювання

хвороба Альцгеймера, autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2W^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• гіалоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • cell-cell junction
Біологічний процес	• positive regulation of integrin-mediated signaling pathway • negative regulation of neural precursor cell proliferation • cell-cell junction organization • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of hepatocyte proliferation • cell junction assembly • negative regulation of epithelial cell proliferation • cell-cell adhesion • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55679


225341

Ensembl


ENSG00000072163


ENSMUSG00000024395

UniProt


Q7Z4I7


Q91XD2

RefSeq (мРНК)


NM_001136037 NM_001161403 NM_001161404 NM_001256542 NM_017980


NM_144862 NM_001365015 NM_001379137 NM_001379138

RefSeq (білок)


NP_001129509 NP_001154875 NP_001154876 NP_001243471 NP_060450


NP_659111 NP_001351944 NP_001366066 NP_001366067

Локус (UCSC)

Хр. 2: 127.64 – 127.68 Mb

Хр. 18: 32.06 – 32.09 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIMS2 (англ. LIM zinc finger domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 38 916^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGSNMSDAL	ANAVCQRCQA	RFSPAERIVN	SNGELYHEHC	FVCAQCFRPF
PEGLFYEFEG	RKYCEHDFQM	LFAPCCGSCG	EFIIGRVIKA	MNNNWHPGCF
RCELCDVELA	DLGFVKNAGR	HLCRPCHNRE	KAKGLGKYIC	QRCHLVIDEQ
PLMFRSDAYH	PDHFNCTHCG	KELTAEAREL	KGELYCLPCH	DKMGVPICGA
CRRPIEGRVV	NALGKQWHVE	HFVCAKCEKP	FLGHRHYEKK	GLAYCETHYN
QLFGDVCYNC	SHVIEGDVVS	ALNKAWCVSC	FSCSTCNSKL	TLKNKFVEFD
MKPVCKRCYE	KFPLELKKRL	KKLSELTSRK	AQPKATDLNS	A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Zhang Y., Chen K., Guo L., Wu C. (2002). Characterization of PINCH-2, a new focal adhesion protein that regulates the PINCH-1-ILK interaction, cell spreading, and migration. J. Biol. Chem. 277: 38328—38338. PMID 12167643 DOI:10.1074/jbc.M205576200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LIMS2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16084 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7Z4I7 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.