LHX2

LHX2
Ідентифікатори
Символи LHX2, LH2, hLhx2, LIM homeobox 2
Зовнішні ІД OMIM: 603759 MGI: 96785 HomoloGene: 55848 GeneCards: LHX2
Онтологія гена
Молекулярна функція

зв'язування з іоном металу
sequence-specific DNA binding
chromatin binding
DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
внутрішньоклітинний

Біологічний процес

negative regulation of transcription regulatory region DNA binding
mesoderm development
telencephalon development
neural tube closure
retina development in camera-type eye
cerebral cortex development
transcription, DNA-templated
axon guidance
axon extension
hair follicle development
maintenance of epithelial cell apical/basal polarity
Нейрогенез
brain development
olfactory bulb development
нейробіологія розвитку
dorsal/ventral pattern formation
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
neuron differentiation
anatomical structure formation involved in morphogenesis
telencephalon regionalization
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of gene expression, epigenetic
negative regulation of neurogenesis
positive regulation of neural precursor cell proliferation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9355
16870
Ensembl
ENSG00000106689
ENSMUSG00000000247
UniProt
P50458
Q9Z0S2
RefSeq (мРНК)
NM_004789
NM_001290646
NM_010710
RefSeq (білок)
NP_004780
NP_001277575
NP_034840
Локус (UCSC) Хр. 9: 124 – 124.03 Mb Хр. 2: 38.23 – 38.26 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LHX2 (англ. LIM homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 373[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLFHSLSGPEVHGVIDEMDRRAKSEAPAISSAIDRGDTETTMPSISSDRA
ALCAGCGGKISDRYYLLAVDKQWHMRCLKCCECKLNLESELTCFSKDGSI
YCKEDYYRRFSVQRCARCHLGISASEMVMRARDLVYHLNCFTCTTCNKML
TTGDHFGMKDSLVYCRLHFEALLQGEYPAHFNHADVAAAAAAAAAAKSAG
LGAAGANPLGLPYYNGVGTVQKGRPRKRKSPGPGADLAAYNAALSCNEND
AEHLDRDQPYPSSQKTKRMRTSFKHHQLRTMKSYFAINHNPDAKDLKQLA
QKTGLTKRVLQVWFQNARAKFRRNLLRQENTGVDKSTDAALQTGTPSGPA
SELSNASLSPSSTPTTLTDLTSPTLPTVTSVLTSVPGNLEGHEPHSPSQT
TLTNLF

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6594 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P50458 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 9
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.