ITGB6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4UM8, 4UM9

Ідентифікатори

Символи

ITGB6, AI1H, Integrin, beta 6, integrin subunit beta 6

Зовнішні ІД

OMIM: 147558 MGI: 96615 HomoloGene: 685 GeneCards: ITGB6

Пов'язані генетичні захворювання

amelogenesis imperfecta type 1H^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• integrin binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integrin complex • receptor complex • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane • focal adhesion • integrin alphav-beta6 complex • нуклеоплазма • центросома • міжклітинні контакти • cell surface
Біологічний процес	• integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • cell-matrix adhesion • inflammatory response • адгезія клітин • extracellular matrix organization • GO:0022415 viral process • cell adhesion mediated by integrin • cell migration • regulation of transforming growth factor beta activation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3694


16420

Ensembl


ENSG00000115221


ENSMUSG00000026971

UniProt


P18564


Q9Z0T9

RefSeq (мРНК)

NM_000888 NM_001282353 NM_001282354 NM_001282355 NM_001282388
NM_001282389 NM_001282390


NM_001159564 NM_021359

RefSeq (білок)

NP_000879 NP_001269282 NP_001269283 NP_001269284 NP_001269317
NP_001269318 NP_001269319


NP_001153036 NP_067334

Локус (UCSC)

Хр. 2: 160.1 – 160.2 Mb

Хр. 2: 60.43 – 60.55 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ITGB6 (англ. Integrin subunit beta 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 85 936^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGIELLCLFF	LFLGRNDHVQ	GGCALGGAET	CEDCLLIGPQ	CAWCAQENFT
HPSGVGERCD	TPANLLAKGC	QLNFIENPVS	QVEILKNKPL	SVGRQKNSSD
IVQIAPQSLI	LKLRPGGAQT	LQVHVRQTED	YPVDLYYLMD	LSASMDDDLN
TIKELGSRLS	KEMSKLTSNF	RLGFGSFVEK	PVSPFVKTTP	EEIANPCSSI
PYFCLPTFGF	KHILPLTNDA	ERFNEIVKNQ	KISANIDTPE	GGFDAIMQAA
VCKEKIGWRN	DSLHLLVFVS	DADSHFGMDS	KLAGIVIPND	GLCHLDSKNE
YSMSTVLEYP	TIGQLIDKLV	QNNVLLIFAV	TQEQVHLYEN	YAKLIPGATV
GLLQKDSGNI	LQLIISAYEE	LRSEVELEVL	GDTEGLNLSF	TAICNNGTLF
QHQKKCSHMK	VGDTASFSVT	VNIPHCERRS	RHIIIKPVGL	GDALELLVSP
ECNCDCQKEV	EVNSSKCHHG	NGSFQCGVCA	CHPGHMGPRC	ECGEDMLSTD
SCKEAPDHPS	CSGRGDCYCG	QCICHLSPYG	NIYGPYCQCD	NFSCVRHKGL
LCGGNGDCDC	GECVCRSGWT	GEYCNCTTST	DSCVSEDGVL	CSGRGDCVCG
KCVCTNPGAS	GPTCERCPTC	GDPCNSKRSC	IECHLSAAGQ	AREECVDKCK
LAGATISEEE	DFSKDGSVSC	SLQGENECLI	TFLITTDNEG	KTIIHSINEK
DCPKPPNIPM	IMLGVSLAIL	LIGVVLLCIW	KLLVSFHDRK	EVAKFEAERS
KAKWQTGTNP	LYRGSTSTFK	NVTYKHREKQ	KVDLSTDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gianni T., Salvioli S., Chesnokova L.S., Hutt-Fletcher L.M., Campadelli-Fiume G. (2013). alphavbeta6- and alphavbeta8-integrins serve as interchangeable receptors for HSV gH/gL to promote endocytosis and activation of membrane fusion. PLoS Pathog. 9: E1003806—E1003806. PMID 24367260 DOI:10.1371/journal.ppat.1003806

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGB6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6161 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P18564 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.