ITGB5

Ідентифікатори

Символи

ITGB5, Integrin, beta 5, integrin subunit beta 5

Зовнішні ІД

OMIM: 147561 MGI: 96614 HomoloGene: 20511 GeneCards: ITGB5

Реагує на сполуку

cilengitide^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • integrin binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • receptor complex • клітинна мембрана • cell surface • integrin complex • phagocytic vesicle • integrin alphav-beta5 complex • екзосома
Біологічний процес	• м'язове скорочення • endodermal cell differentiation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • extracellular matrix organization • epithelial cell-cell adhesion • stress fiber assembly • адгезія клітин • integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • cell-matrix adhesion • GO:0022415 viral process • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • cell migration • cell adhesion mediated by integrin
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3693


16419

Ensembl


ENSG00000082781


ENSMUSG00000022817

UniProt


P18084


O70309

RefSeq (мРНК)


NM_002213 NM_001354764 NM_001354765 NM_001354766


NM_001145884 NM_010580

RefSeq (білок)


NP_002204 NP_001341693 NP_001341694 NP_001341695


NP_001139356 NP_034710 NP_001391992

Локус (UCSC)

Хр. 3: 124.76 – 124.9 Mb

Хр. 16: 33.65 – 33.77 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ITGB5 (англ. Integrin subunit beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 799 амінокислот, а молекулярна маса — 88 054^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRAPAPLYA	CLLGLCALLP	RLAGLNICTS	GSATSCEECL	LIHPKCAWCS
KEDFGSPRSI	TSRCDLRANL	VKNGCGGEIE	SPASSFHVLR	SLPLSSKGSG
SAGWDVIQMT	PQEIAVNLRP	GDKTTFQLQV	RQVEDYPVDL	YYLMDLSLSM
KDDLDNIRSL	GTKLAEEMRK	LTSNFRLGFG	SFVDKDISPF	SYTAPRYQTN
PCIGYKLFPN	CVPSFGFRHL	LPLTDRVDSF	NEEVRKQRVS	RNRDAPEGGF
DAVLQAAVCK	EKIGWRKDAL	HLLVFTTDDV	PHIALDGKLG	GLVQPHDGQC
HLNEANEYTA	SNQMDYPSLA	LLGEKLAENN	INLIFAVTKN	HYMLYKNFTA
LIPGTTVEIL	DGDSKNIIQL	IINAYNSIRS	KVELSVWDQP	EDLNLFFTAT
CQDGVSYPGQ	RKCEGLKIGD	TASFEVSLEA	RSCPSRHTEH	VFALRPVGFR
DSLEVGVTYN	CTCGCSVGLE	PNSARCNGSG	TYVCGLCECS	PGYLGTRCEC
QDGENQSVYQ	NLCREAEGKP	LCSGRGDCSC	NQCSCFESEF	GKIYGPFCEC
DNFSCARNKG	VLCSGHGECH	CGECKCHAGY	IGDNCNCSTD	ISTCRGRDGQ
ICSERGHCLC	GQCQCTEPGA	FGEMCEKCPT	CPDACSTKRD	CVECLLLHSG
KPDNQTCHSL	CRDEVITWVD	TIVKDDQEAV	LCFYKTAKDC	VMMFTYVELP
SGKSNLTVLR	EPECGNTPNA	MTILLAVVGS	ILLVGLALLA	IWKLLVTIHD
RREFAKFQSE	RSRARYEMAS	NPLYRKPIST	HTVDFTFNKF	NKSYNGTVD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

Suzuki S., Huang Z.S., Tanihara H. (1990). Cloning of an integrin beta subunit exhibiting high homology with integrin beta 3 subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 5354—5358. PMID 2371275 DOI:10.1073/pnas.87.14.5354
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lin C.G., Chen C.C., Leu S.J., Grzeszkiewicz T.M., Lau L.F. (2005). Integrin-dependent functions of the angiogenic inducer NOV (CCN3): implication in wound healing. J. Biol. Chem. 280: 8229—8237. PMID 15611078 DOI:10.1074/jbc.M404903200
Lyle C., McCormick F. (2010). Integrin alphavbeta5 is a primary receptor for adenovirus in CAR-negative cells. Virol. J. 7: 148—148. PMID 20615244 DOI:10.1186/1743-422X-7-148
Ramaswamy H., Hemler M.E. (1990). Cloning, primary structure and properties of a novel human integrin beta subunit. EMBO J. 9: 1561—1568. PMID 2328726
McLean J.W., Vestal D.J., Cheresh D.A., Bodary S.C. (1990). cDNA sequence of the human integrin beta 5 subunit. J. Biol. Chem. 265: 17126—17131. PMID 2211615

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Integrin subunit beta 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6160 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P18084 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.