HIST1H1E

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3TZD, 5JJZ

Ідентифікатори

Символи

H1-4, histone cluster 1, H1e, H1.4, H1E, H1F4, H1s-4, dJ221C16.5, histone cluster 1 H1 family member e, RMNS, HIST1H1E, H1.4 linker histone, cluster member

Зовнішні ІД

OMIM: 142220 MGI: 1931527 HomoloGene: 130534 GeneCards: H1-4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotide binding • double-stranded DNA binding • calcium ion binding • ATP binding • GTP binding • AMP binding • dATP binding • ADP binding • nucleosomal DNA binding
Клітинна компонента	• Нуклеосома • екзосома • клітинне ядро • хромосома
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K4 trimethylation • nucleosome assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K27 trimethylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3008


50709

Ensembl


ENSG00000168298


ENSMUSG00000051627

UniProt


P10412


P43274

RefSeq (мРНК)


NM_005321


NM_015787

RefSeq (білок)


NP_005312 NP_005312.1


NP_056602

Локус (UCSC)

Хр. 6: 26.16 – 26.16 Mb

Хр. 13: 23.8 – 23.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIST1H1E (англ. Histone cluster 1 H1 family member e) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 21 865^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAAPA	APAPAEKTPV	KKKARKSAGA	AKRKASGPPV	SELITKAVAA
SKERSGVSLA	ALKKALAAAG	YDVEKNNSRI	KLGLKSLVSK	GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK	AASGEAKPKA	KKAGAAKAKK	PAGAAKKPKK	ATGAATPKKS
AKKTPKKAKK	PAAAAGAKKA	KSPKKAKAAK	PKKAPKSPAK	AKAVKPKAAK
PKTAKPKAAK	PKKAAAKKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
Ohe Y., Hayashi H., Iwai K. (1986). Human spleen histone H1. Isolation and amino acid sequence of a main variant, H1b. J. Biochem. 100: 359—368. PMID 3782055

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4718 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.
↑ UniProt, P10412 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.