GTF3C5

Ідентифікатори

Символи

GTF3C5, TFIIIC63, TFIIICepsilon, TFiiiC2-63, general transcription factor IIIC subunit 5

Зовнішні ІД

OMIM: 604890 MGI: 1917489 HomoloGene: 40806 GeneCards: GTF3C5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III type 1 promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III type 2 promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента	• transcription factor TFIIIC complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• skeletal muscle cell differentiation • tRNA transcription by RNA polymerase III • 5S class rRNA transcription by RNA polymerase III • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • RNA polymerase III preinitiation complex assembly • transcription initiation from RNA polymerase III promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9328


70239

Ensembl


ENSG00000148308


ENSMUSG00000026816

UniProt


Q9Y5Q8


Q8R2T8

RefSeq (мРНК)


NM_001122823 NM_001286709 NM_012087


NM_001290484 NM_148928

RefSeq (білок)


NP_001116295 NP_001273638 NP_036219


NP_001277413 NP_683730

Локус (UCSC)

Хр. 9: 133.03 – 133.06 Mb

Хр. 2: 28.46 – 28.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GTF3C5 (англ. General transcription factor IIIC subunit 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 59 571^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAEAADLGL	GAAVPVELRR	ERRMVCVEYP	GVVRDVAKML	PTLGGEEGVS
RIYADPTKRL	ELYFRPKDPY	CHPVCANRFS	TSSLLLRIRK	RTRRQKGVLG
TEAHSEVTFD	MEILGIISTI	YKFQGMSDFQ	YLAVHTEAGG	KHTSMYDKVL
MLRPEKEAFF	HQELPLYIPP	PIFSRLDAPV	DYFYRPETQH	REGYNNPPIS
GENLIGLSRA	RRPHNAIFVN	FEDEEVPKQP	LEAAAQTWRR	VCTNPVDRKV
EEELRKLFDI	RPIWSRNAVK	ANISVHPDKL	KVLLPFIAYY	MITGPWRSLW
IRFGYDPRKN	PDAKIYQVLD	FRIRCGMKHG	YAPSDLPVKA	KRSTYNYSLP
ITVKKTSSQL	VTMHDLKQGL	GPSGTSGARK	PASSKYKLKD	SVYIFREGAL
PPYRQMFYQL	CDLNVEELQK	IIHRNDGAEN	SCTERDGWCL	PKTSDELRDT
MSLMIRQTIR	SKRPALFSSS	AKADGGKEQL	TYESGEDEED	EEEEEEEEED
FKPSDGSENE	METEILDYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hsieh Y.-J., Wang Z., Kovelman R., Roeder R.G. (1999). Cloning and characterization of two evolutionarily conserved subunits (TFIIIC102 and TFIIIC63) of human TFIIIC and their involvement in functional interactions with TFIIIB and RNA polymerase III. Mol. Cell. Biol. 19: 4944—4952. PMID 10373544 DOI:10.1128/MCB.19.7.4944
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4668 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5Q8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.