FGD3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FGD3, ZFYVE5, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617554 MGI: 1353657 HomoloGene: 22925 GeneCards: FGD3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • small GTPase binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • ruffle • цитоскелет • lamellipodium |
---|
Біологічний процес | • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • filopodium assembly • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • actin cytoskeleton organization • G protein-coupled receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001083536 NM_001286993 NM_033086 NM_001369951 NM_001369952 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001077005 NP_001273922 NP_149077 NP_001356880 NP_001356881
| NP_001077005.1 NP_149077.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 92.95 – 93.04 Mb | Хр. 13: 49.42 – 49.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FGD3 (англ. FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 725 амінокислот, а молекулярна маса — 79 401[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESGRGSSTP | | PGPIAALGMP | | DTGPGSSSLG | | KLQALPVGPR | | AHCGDPVSLA |
AAGDGSPDIG | | PTGELSGSLK | | IPNRDSGIDS | | PSSSVAGENF | | PCEEGLEAGP |
SPTVLGAHAE | | MALDSQVPKV | | TPQEEADSDV | | GEEPDSENTP | | QKADKDAGLA |
QHSGPQKLLH | | IAQELLHTEE | | TYVKRLHLLD | | QVFCTRLTDA | | GIPPEVIMGI |
FSNISSIHRF | | HGQFLLPELK | | TRITEEWDTN | | PRLGDILQKL | | APFLKMYGEY |
VKNFDRAVGL | | VSTWTQRSPL | | FKDVVHSIQK | | QEVCGNLTLQ | | HHMLEPVQRV |
PRYELLLKDY | | LKRLPQDAPD | | RKDAERSLEL | | ISTAANHSNA | | AIRKVEKMHK |
LLEVYEQLGG | | EEDIVNPANE | | LIKEGQIQKL | | SAKNGTPQDR | | HLFLFNSMIL |
YCVPKLRLMG | | QKFSVREKMD | | ISGLQVQDIV | | KPNTAHTFII | | TGRKRSLELQ |
TRTEEEKKEW | | IQIIQATIEK | | HKQNSETFKA | | FGGAFSQDED | | PSLSPDMPIT |
STSPVEPVVT | | TEGSSGAAGL | | EPRKLSSKTR | | RDKEKQSCKS | | CGETFNSITK |
RRHHCKLCGA | | VICGKCSEFK | | AENSRQSRVC | | RDCFLTQPVA | | PESTEKTPTA |
DPQPSLLCGP | | LRLSESGETW | | SEVWAAIPMS | | DPQVLHLQGG | | SQDGRLPRTI |
PLPSCKLSVP | | DPEERLDSGH | | VWKLQWAKQS | | WYLSASSAEL | | QQQWLETLST |
AAHGDTAQDS | | PGALQLQVPM | | GAAAP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16027 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q5JSP0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |