ERLIN2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ERLIN2, C8orf2, Erlin-2, NET32, SPFH2, SPG18, ER lipid raft associated 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611605 MGI: 2387215 HomoloGene: 5193 GeneCards: ERLIN2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hereditary spastic paraplegia 18[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ubiquitin protein ligase binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • membrane raft • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • SREBP signaling pathway • steroid metabolic process • cholesterol metabolic process • negative regulation of cholesterol biosynthetic process • negative regulation of fatty acid biosynthetic process • lipid metabolism • ubiquitin-dependent ERAD pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001003790 NM_001003791 NM_007175 NM_001362878 NM_001362880 |
| NM_153592 NM_001364476 NM_001364477 NM_001379175 NM_001379176
| NM_001379177 NM_001379178 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001003790 NP_001003791 NP_009106 NP_001349807 NP_001349809 |
| NP_705820 NP_001351405 NP_001351406 NP_001366104 NP_001366105
| NP_001366106 NP_001366107 NP_001391043 NP_001391044 NP_001391045 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 37.74 – 37.76 Mb | Хр. 8: 27.51 – 27.53 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ERLIN2 (англ. ER lipid raft associated 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 840[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQLGAVVAV | | ASSFFCASLF | | SAVHKIEEGH | | IGVYYRGGAL | | LTSTSGPGFH |
LMLPFITSYK | | SVQTTLQTDE | | VKNVPCGTSG | | GVMIYFDRIE | | VVNFLVPNAV |
YDIVKNYTAD | | YDKALIFNKI | | HHELNQFCSV | | HTLQEVYIEL | | FDQIDENLKL |
ALQQDLTSMA | | PGLVIQAVRV | | TKPNIPEAIR | | RNYELMESEK | | TKLLIAAQKQ |
KVVEKEAETE | | RKKALIEAEK | | VAQVAEITYG | | QKVMEKETEK | | KISEIEDAAF |
LAREKAKADA | | ECYTAMKIAE | | ANKLKLTPEY | | LQLMKYKAIA | | SNSKIYFGKD |
IPNMFMDSAG | | SVSKQFEGLA | | DKLSFGLEDE | | PLETATKEN |
Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pearce M.M.P., Wormer D.B., Wilkens S., Wojcikiewicz R.J.H. (2009). An endoplasmic reticulum (ER) membrane complex composed of SPFH1 and SPFH2 mediates the ER-associated degradation of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. J. Biol. Chem. 284: 10433—10445. PMID 19240031 DOI:10.1074/jbc.M809801200
- Browman D.T., Resek M.E., Zajchowski L.D., Robbins S.M. (2006). Erlin-1 and erlin-2 are novel members of the prohibitin family of proteins that define lipid-raft-like domains of the ER. J. Cell Sci. 119: 3149—3160. PMID 16835267 DOI:10.1242/jcs.03060
- Pearce M.M., Wang Y., Kelley G.G., Wojcikiewicz R.J.H. (2007). SPFH2 mediates the endoplasmic reticulum-associated degradation of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors and other substrates in mammalian cells. J. Biol. Chem. 282: 20104—20115. PMID 17502376 DOI:10.1074/jbc.M701862200
- Jo Y., Sguigna P.V., DeBose-Boyd R.A. (2011). Membrane-associated ubiquitin ligase complex containing gp78 mediates sterol-accelerated degradation of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase. J. Biol. Chem. 286: 15022—15031. PMID 21343306 DOI:10.1074/jbc.M110.211326
- Lu J.P., Wang Y., Sliter D.A., Pearce M.M., Wojcikiewicz R.J. (2011). RNF170 protein, an endoplasmic reticulum membrane ubiquitin ligase, mediates inositol 1,4,5-trisphosphate receptor ubiquitination and degradation. J. Biol. Chem. 286: 24426—24433. PMID 21610068 DOI:10.1074/jbc.M111.251983
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ERLIN2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1356 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O94905 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |