DHX58 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2RQA, 2W4R, 3EQT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DHX58, D11LGP2, D11lgp2e, LGP2, RLR-3, DEXH-box helicase 58 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608588 MGI: 1931560 HomoloGene: 69371 GeneCards: DHX58 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • hydrolase activity • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of MDA-5 signaling pathway • regulation of innate immune response • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to virus • negative regulation of innate immune response • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of MDA-5 signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • response to bacterium |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 42.1 – 42.11 Mb | Хр. 11: 100.59 – 100.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DHX58 (англ. DExH-box helicase 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 678 амінокислот, а молекулярна маса — 76 613[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MELRSYQWEV | | IMPALEGKNI | | IIWLPTGAGK | | TRAAAYVAKR | | HLETVDGAKV |
VVLVNRVHLV | | TQHGEEFRRM | | LDGRWTVTTL | | SGDMGPRAGF | | GHLARCHDLL |
ICTAELLQMA | | LTSPEEEEHV | | ELTVFSLIVV | | DECHHTHKDT | | VYNVIMSQYL |
ELKLQRAQPL | | PQVLGLTASP | | GTGGASKLDG | | AINHVLQLCA | | NLDTWCIMSP |
QNCCPQLQEH | | SQQPCKQYNL | | CHRRSQDPFG | | DLLKKLMDQI | | HDHLEMPELS |
RKFGTQMYEQ | | QVVKLSEAAA | | LAGLQEQRVY | | ALHLRRYNDA | | LLIHDTVRAV |
DALAALQDFY | | HREHVTKTQI | | LCAERRLLAL | | FDDRKNELAH | | LATHGPENPK |
LEMLEKILQR | | QFSSSNSPRG | | IIFTRTRQSA | | HSLLLWLQQQ | | QGLQTVDIRA |
QLLIGAGNSS | | QSTHMTQRDQ | | QEVIQKFQDG | | TLNLLVATSV | | AEEGLDIPHC |
NVVVRYGLLT | | NEISMVQARG | | RARADQSVYA | | FVATEGSREL | | KRELINEALE |
TLMEQAVAAV | | QKMDQAEYQA | | KIRDLQQAAL | | TKRAAQAAQR | | ENQRQQFPVE |
HVQLLCINCM | | VAVGHGSDLR | | KVEGTHHVNV | | NPNFSNYYNV | | SRDPVVINKV |
FKDWKPGGVI | | SCRNCGEVWG | | LQMIYKSVKL | | PVLKVRSMLL | | ETPQGRIQAK |
KWSRVPFSVP | | DFDFLQHCAE | | NLSDLSLD |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Komuro A., Horvath C.M. (2006). RNA- and virus-independent inhibition of antiviral signaling by RNA helicase LGP2. J. Virol. 80: 12332—12342. PMID 17020950 DOI:10.1128/JVI.01325-06
- Vitour D., Meurs E.F. (2007). Regulation of interferon production by RIG-I and LGP2: a lesson in self-control. Sci. STKE. 2007: PE20—PE20. PMID 17473309 DOI:10.1126/stke.3842007pe20
- Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
- Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
- Broquet A.H., Hirata Y., McAllister C.S., Kagnoff M.F. (2011). RIG-I/MDA5/MAVS are required to signal a protective IFN response in rotavirus-infected intestinal epithelium. J. Immunol. 186: 1618—1626. PMID 21187438 DOI:10.4049/jimmunol.1002862
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29517 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96C10 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |