DHX29

Ідентифікатори

Символи

DHX29, DDX29, DEAH-box helicase 29, DExH-box helicase 29

Зовнішні ІД

OMIM: 612720 HomoloGene: 10387 GeneCards: DHX29

Онтологія гена
Молекулярна функція	• translation initiation factor activity • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • ribosomal small subunit binding • cadherin binding • RNA binding • RNA helicase activity • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • eukaryotic 43S preinitiation complex • мітохондрія
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • translational initiation • Біосинтез білків • positive regulation of translational initiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54505


100362324

Ensembl


ENSG00000067248


ENSRNOG00000010369

UniProt


Q7Z478


D3ZHW0

RefSeq (мРНК)


NM_019030 NM_001345964 NM_001345965


XM_002729007 XM_006231950

RefSeq (білок)


NP_001332893 NP_001332894 NP_061903


XP_002729053 XP_006232012

Локус (UCSC)

Хр. 5: 55.26 – 55.31 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DHX29 (англ. DExH-box helicase 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 369 амінокислот, а молекулярна маса — 155 236^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGKNKKHKA	PAAAVVRAAV	SASRAKSAEA	GIAGEAQSKK	PVSRPATAAA
AAAGSREPRV	KQGPKIYSFN	STNDSSGPAN	LDKSILKVVI	NNKLEQRIIG
VINEHKKQNN	DKGMISGRLT	AKKLQDLYMA	LQAFSFKTKD	IEDAMTNTLL
YGGDLHSALD	WLCLNLSDDA	LPEGFSQEFE	EQQPKSRPKF	QSPQIQATIS
PPLQPKTKTY	EEDPKSKPKK	EEKNMEVNMK	EWILRYAEQQ	NEEEKNENSK
SLEEEEKFDP	NERYLHLAAK	LLDAKEQAAT	FKLEKNKQGQ	KEAQEKIRKF
QREMETLEDH	PVFNPAMKIS	HQQNERKKPP	VATEGESALN	FNLFEKSAAA
TEEEKDKKKE	PHDVRNFDYT	ARSWTGKSPK	QFLIDWVRKN	LPKSPNPSFE
KVPVGRYWKC	RVRVIKSEDD	VLVVCPTILT	EDGMQAQHLG	ATLALYRLVK
GQSVHQLLPP	TYRDVWLEWS	DAEKKREELN	KMETNKPRDL	FIAKLLNKLK
QQQQQQQQHS	ENKRENSEDP	EESWENLVSD	EDFSALSLES	ANVEDLEPVR
NLFRKLQSTP	KYQKLLKERQ	QLPVFKHRDS	IVETLKRHRV	VVVAGETGSG
KSTQVPHFLL	EDLLLNEWEA	SKCNIVCTQP	RRISAVSLAN	RVCDELGCEN
GPGGRNSLCG	YQIRMESRAC	ESTRLLYCTT	GVLLRKLQED	GLLSNVSHVI
VDEVHERSVQ	SDFLLIILKE	ILQKRSDLHL	ILMSATVDSE	KFSTYFTHCP
ILRISGRSYP	VEVFHLEDII	EETGFVLEKD	SEYCQKFLEE	EEEVTINVTS
KAGGIKKYQE	YIPVQTGAHA	DLNPFYQKYS	SRTQHAILYM	NPHKINLDLI
LELLAYLDKS	PQFRNIEGAV	LIFLPGLAHI	QQLYDLLSND	RRFYSERYKV
IALHSILSTQ	DQAAAFTLPP	PGVRKIVLAT	NIAETGITIP	DVVFVIDTGR
TKENKYHESS	QMSSLVETFV	SKASALQRQG	RAGRVRDGFC	FRMYTRERFE
GFMDYSVPEI	LRVPLEELCL	HIMKCNLGSP	EDFLSKALDP	PQLQVISNAM
NLLRKIGACE	LNEPKLTPLG	QHLAALPVNV	KIGKMLIFGA	IFGCLDPVAT
LAAVMTEKSP	FTTPIGRKDE	ADLAKSALAM	ADSDHLTIYN	AYLGWKKARQ
EGGYRSEITY	CRRNFLNRTS	LLTLEDVKQE	LIKLVKAAGF	SSSTTSTSWE
GNRASQTLSF	QEIALLKAVL	VAGLYDNVGK	IIYTKSVDVT	EKLACIVETA
QGKAQVHPSS	VNRDLQTHGW	LLYQEKIRYA	RVYLRETTLI	TPFPVLLFGG
DIEVQHRERL	LSIDGWIYFQ	APVKIAVIFK	QLRVLIDSVL	RKKLENPKMS
LENDKILQII	TELIKTENN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біосинтез білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Pisareva V.P., Pisarev A.V., Komar A.A., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2008). Translation initiation on mammalian mRNAs with structured 5'UTRs requires DExH-box protein DHX29. Cell. 135: 1237—1250. PMID 19109895 DOI:10.1016/j.cell.2008.10.037

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15815 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z478 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2016. Процитовано 18 вересня 2017.