CTBP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MX3, 4LCE, 4U6Q

Ідентифікатори

Символи

CTBP1, C-terminal binding protein 1, BARS, HADDTS

Зовнішні ІД

OMIM: 602618 MGI: 1201685 HomoloGene: 1015 GeneCards: CTBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • NAD binding • transcription factor binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • identical protein binding • hydroxypyruvate reductase activity • glyoxylate reductase (NADP+) activity • protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription regulator complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • presynaptic active zone cytoplasmic component • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse
Біологічний процес	• positive regulation of histone deacetylation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral genome replication • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • negative regulation of histone H4 acetylation • protein phosphorylation • white fat cell differentiation • обмін речовин • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of histone acetylation • negative regulation of cell population proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1487


13016

Ensembl


ENSG00000159692


ENSMUSG00000037373

UniProt


Q13363


O88712

RefSeq (мРНК)

NM_001012614 NM_001328 NM_001377186 NM_001377187 NM_001377188
NM_001377189 NM_001377190 NM_001377191 NM_001377192 NM_001377193


NM_001198859 NM_001198860 NM_001198861 NM_013502 NM_001310535

RefSeq (білок)

NP_001012632 NP_001319 NP_001364115 NP_001364116 NP_001364117
NP_001364118 NP_001364119 NP_001364120 NP_001364121 NP_001364122


NP_001185788 NP_001185789 NP_001185790 NP_001297464 NP_038530

Локус (UCSC)

Хр. 4: 1.21 – 1.25 Mb

Хр. 5: 33.41 – 33.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTBP1 (англ. C-terminal binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 47 535^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSSHLLNKG	LPLGVRPPIM	NGPLHPRPLV	ALLDGRDCTV	EMPILKDVAT
VAFCDAQSTQ	EIHEKVLNEA	VGALMYHTIT	LTREDLEKFK	ALRIIVRIGS
GFDNIDIKSA	GDLGIAVCNV	PAASVEETAD	STLCHILNLY	RRATWLHQAL
REGTRVQSVE	QIREVASGAA	RIRGETLGII	GLGRVGQAVA	LRAKAFGFNV
LFYDPYLSDG	VERALGLQRV	STLQDLLFHS	DCVTLHCGLN	EHNHHLINDF
TVKQMRQGAF	LVNTARGGLV	DEKALAQALK	EGRIRGAALD	VHESEPFSFS
QGPLKDAPNL	ICTPHAAWYS	EQASIEMREE	AAREIRRAIT	GRIPDSLKNC
VNKDHLTAAT	HWASMDPAVV	HPELNGAAYR	YPPGVVGVAP	TGIPAAVEGI
VPSAMSLSHG	LPPVAHPPHA	PSPGQTVKPE	ADRDHASDQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Sewalt R.G.A.B., Gunster M.J., van der Vlag J., Satijn D.P.E., Otte A.P. (1999). C-terminal binding protein is a transcriptional repressor that interacts with a specific class of vertebrate polycomb proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 777—787. PMID 9858600 DOI:10.1128/MCB.19.1.777
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. (2001). Interaction of EVI1 with cAMP-responsive element-binding protein-binding protein (CBP) and p300/CBP-associated factor (P/CAF) results in reversible acetylation of EVI1 and in co-localization in nuclear speckles. J. Biol. Chem. 276: 44936—44943. PMID 11568182 DOI:10.1074/jbc.M106733200
Touitou R., Hickabottom M., Parker G., Crook T., Allday M.J. (2001). Physical and functional interactions between the corepressor CtBP and the Epstein-Barr virus nuclear antigen EBNA3C. J. Virol. 75: 7749—7755. PMID 11462050 DOI:10.1128/JVI.75.16.7749-7755.2001
Vo N., Fjeld C., Goodman R.H. (2001). Acetylation of nuclear hormone receptor-interacting protein RIP140 regulates binding of the transcriptional corepressor CtBP. Mol. Cell. Biol. 21: 6181—6188. PMID 11509661 DOI:10.1128/MCB.21.18.6181-6188.2001
Hickabottom M., Parker G.A., Freemont P., Crook T., Allday M.J. (2002). Two nonconsensus sites in the Epstein-Barr virus oncoprotein EBNA3A cooperate to bind the co-repressor carboxyl-terminal-binding protein (CtBP). J. Biol. Chem. 277: 47197—47204. PMID 12372828 DOI:10.1074/jbc.M208116200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2494 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13363 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.