CIITA |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CIITA, C2TA, CIITAIV, MHC2TA, NLRA, class II, major histocompatibility complex, transactivator, class II major histocompatibility complex transactivator |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600005 MGI: 108445 HomoloGene: 207 GeneCards: CIITA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
неспецифічний виразковий коліт, bare lymphocyte syndrome 2[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • DNA binding • nucleotide binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GTP binding • kinase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • acyltransferase activity • ATP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • PML body • нуклеоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of MHC class II biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to interferon-gamma • фосфорилювання • interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:1904576 response to antibiotic • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of MHC class I biosynthetic process • negative regulation of collagen biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • inflammatory response |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e4/PBB_GE_CIITA_210925_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIITA_210925_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b5/PBB_GE_CIITA_211884_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CIITA_211884_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_000246 NM_001286402 NM_001286403 NM_001379330 NM_001379331
| NM_001379332 NM_001379333 NM_001379334 |
| | NM_001243760 NM_001243761 NM_007575 NM_001302618 NM_001302619 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_000237 NP_001273331 NP_001273332 NP_001366259 NP_001366260
| NP_001366261 NP_001366262 NP_001366263 |
| | NP_001230689 NP_001230690 NP_001289547 NP_001289548 NP_031601 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 10.87 – 10.94 Mb | Хр. 16: 10.3 – 10.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CIITA (англ. Class II major histocompatibility complex transactivator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 123 514[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRCLAPRPAG | | SYLSEPQGSS | | QCATMELGPL | | EGGYLELLNS | | DADPLCLYHF |
YDQMDLAGEE | | EIELYSEPDT | | DTINCDQFSR | | LLCDMEGDEE | | TREAYANIAE |
LDQYVFQDSQ | | LEGLSKDIFK | | HIGPDEVIGE | | SMEMPAEVGQ | | KSQKRPFPEE |
LPADLKHWKP | | AEPPTVVTGS | | LLVRPVSDCS | | TLPCLPLPAL | | FNQEPASGQM |
RLEKTDQIPM | | PFSSSSLSCL | | NLPEGPIQFV | | PTISTLPHGL | | WQISEAGTGV |
SSIFIYHGEV | | PQASQVPPPS | | GFTVHGLPTS | | PDRPGSTSPF | | APSATDLPSM |
PEPALTSRAN | | MTEHKTSPTQ | | CPAAGEVSNK | | LPKWPEPVEQ | | FYRSLQDTYG |
AEPAGPDGIL | | VEVDLVQARL | | ERSSSKSLER | | ELATPDWAER | | QLAQGGLAEV |
LLAAKEHRRP | | RETRVIAVLG | | KAGQGKSYWA | | GAVSRAWACG | | RLPQYDFVFS |
VPCHCLNRPG | | DAYGLQDLLF | | SLGPQPLVAA | | DEVFSHILKR | | PDRVLLILDG |
FEELEAQDGF | | LHSTCGPAPA | | EPCSLRGLLA | | GLFQKKLLRG | | CTLLLTARPR |
GRLVQSLSKA | | DALFELSGFS | | MEQAQAYVMR | | YFESSGMTEH | | QDRALTLLRD |
RPLLLSHSHS | | PTLCRAVCQL | | SEALLELGED | | AKLPSTLTGL | | YVGLLGRAAL |
DSPPGALAEL | | AKLAWELGRR | | HQSTLQEDQF | | PSADVRTWAM | | AKGLVQHPPR |
AAESELAFPS | | FLLQCFLGAL | | WLALSGEIKD | | KELPQYLALT | | PRKKRPYDNW |
LEGVPRFLAG | | LIFQPPARCL | | GALLGPSAAA | | SVDRKQKVLA | | RYLKRLQPGT |
LRARQLLELL | | HCAHEAEEAG | | IWQHVVQELP | | GRLSFLGTRL | | TPPDAHVLGK |
ALEAAGQDFS | | LDLRSTGICP | | SGLGSLVGLS | | CVTRFRAALS | | DTVALWESLQ |
QHGETKLLQA | | AEEKFTIEPF | | KAKSLKDVED | | LGKLVQTQRT | | RSSSEDTAGE |
LPAVRDLKKL | | EFALGPVSGP | | QAFPKLVRIL | | TAFSSLQHLD | | LDALSENKIG |
DEGVSQLSAT | | FPQLKSLETL | | NLSQNNITDL | | GAYKLAEALP | | SLAASLLRLS |
LYNNCICDVG | | AESLARVLPD | | MVSLRVMDVQ | | YNKFTAAGAQ | | QLAASLRRCP |
HVETLAMWTP | | TIPFSVQEHL | | QQQDSRISLR |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, активаторів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.
Література
- Steimle V., Otten L.A., Zufferey M., Mach B. (1993). Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency (or bare lymphocyte syndrome). Cell. 75: 135—146. PMID 8402893 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80090-X
- Riley J.L., Westerheide S.D., Price J.A., Brown J.A., Boss J.M. (1995). Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator (CIITA). Immunity. 2: 533—543. PMID 7749984 DOI:10.1016/1074-7613(95)90033-0
- Day N.E., Ugai H., Yokoyama K.K., Ichiki A.T. (2003). K-562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region. Leuk. Res. 27: 1027—1038. PMID 12859996 DOI:10.1016/S0145-2126(03)00072-9
- Harton J.A., Cressman D.E., Chin K.C., Der C.J., Ting J.P. (1999). GTP binding by class II transactivator: role in nuclear import. Science. 285: 1402—1405. PMID 10464099 DOI:10.1126/science.285.5432.1402
- Soe K.C., Devaiah B.N., Singer D.S. (2013). Transcriptional coactivator CIITA, a functional homolog of TAF1, has kinase activity. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 1184—1190. PMID 24036077 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.09.001
- Quan V., Towey M., Sacks S., Kelly A.P. (1999). Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA. Immunogenetics. 49: 957—963. PMID 10501838 DOI:10.1007/s002510050579
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7067 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P33076 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |