CIITA

Ідентифікатори

Символи

CIITA, C2TA, CIITAIV, MHC2TA, NLRA, class II, major histocompatibility complex, transactivator, class II major histocompatibility complex transactivator

Зовнішні ІД

OMIM: 600005 MGI: 108445 HomoloGene: 207 GeneCards: CIITA

Пов'язані генетичні захворювання

неспецифічний виразковий коліт, bare lymphocyte syndrome 2^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • DNA binding • nucleotide binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GTP binding • kinase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • acyltransferase activity • ATP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• PML body • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of MHC class II biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to interferon-gamma • фосфорилювання • interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:1904576 response to antibiotic • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of MHC class I biosynthetic process • negative regulation of collagen biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • inflammatory response
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4261


12265

Ensembl


ENSG00000179583


ENSMUSG00000022504

UniProt


P33076


P79621

RefSeq (мРНК)

NM_000246 NM_001286402 NM_001286403 NM_001379330 NM_001379331
NM_001379332 NM_001379333 NM_001379334


NM_001243760 NM_001243761 NM_007575 NM_001302618 NM_001302619

RefSeq (білок)

NP_000237 NP_001273331 NP_001273332 NP_001366259 NP_001366260
NP_001366261 NP_001366262 NP_001366263


NP_001230689 NP_001230690 NP_001289547 NP_001289548 NP_031601

Локус (UCSC)

Хр. 16: 10.87 – 10.94 Mb

Хр. 16: 10.3 – 10.35 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CIITA (англ. Class II major histocompatibility complex transactivator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 123 514^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRCLAPRPAG	SYLSEPQGSS	QCATMELGPL	EGGYLELLNS	DADPLCLYHF
YDQMDLAGEE	EIELYSEPDT	DTINCDQFSR	LLCDMEGDEE	TREAYANIAE
LDQYVFQDSQ	LEGLSKDIFK	HIGPDEVIGE	SMEMPAEVGQ	KSQKRPFPEE
LPADLKHWKP	AEPPTVVTGS	LLVRPVSDCS	TLPCLPLPAL	FNQEPASGQM
RLEKTDQIPM	PFSSSSLSCL	NLPEGPIQFV	PTISTLPHGL	WQISEAGTGV
SSIFIYHGEV	PQASQVPPPS	GFTVHGLPTS	PDRPGSTSPF	APSATDLPSM
PEPALTSRAN	MTEHKTSPTQ	CPAAGEVSNK	LPKWPEPVEQ	FYRSLQDTYG
AEPAGPDGIL	VEVDLVQARL	ERSSSKSLER	ELATPDWAER	QLAQGGLAEV
LLAAKEHRRP	RETRVIAVLG	KAGQGKSYWA	GAVSRAWACG	RLPQYDFVFS
VPCHCLNRPG	DAYGLQDLLF	SLGPQPLVAA	DEVFSHILKR	PDRVLLILDG
FEELEAQDGF	LHSTCGPAPA	EPCSLRGLLA	GLFQKKLLRG	CTLLLTARPR
GRLVQSLSKA	DALFELSGFS	MEQAQAYVMR	YFESSGMTEH	QDRALTLLRD
RPLLLSHSHS	PTLCRAVCQL	SEALLELGED	AKLPSTLTGL	YVGLLGRAAL
DSPPGALAEL	AKLAWELGRR	HQSTLQEDQF	PSADVRTWAM	AKGLVQHPPR
AAESELAFPS	FLLQCFLGAL	WLALSGEIKD	KELPQYLALT	PRKKRPYDNW
LEGVPRFLAG	LIFQPPARCL	GALLGPSAAA	SVDRKQKVLA	RYLKRLQPGT
LRARQLLELL	HCAHEAEEAG	IWQHVVQELP	GRLSFLGTRL	TPPDAHVLGK
ALEAAGQDFS	LDLRSTGICP	SGLGSLVGLS	CVTRFRAALS	DTVALWESLQ
QHGETKLLQA	AEEKFTIEPF	KAKSLKDVED	LGKLVQTQRT	RSSSEDTAGE
LPAVRDLKKL	EFALGPVSGP	QAFPKLVRIL	TAFSSLQHLD	LDALSENKIG
DEGVSQLSAT	FPQLKSLETL	NLSQNNITDL	GAYKLAEALP	SLAASLLRLS
LYNNCICDVG	AESLARVLPD	MVSLRVMDVQ	YNKFTAAGAQ	QLAASLRRCP
HVETLAMWTP	TIPFSVQEHL	QQQDSRISLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, активаторів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

Steimle V., Otten L.A., Zufferey M., Mach B. (1993). Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency (or bare lymphocyte syndrome). Cell. 75: 135—146. PMID 8402893 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80090-X
Riley J.L., Westerheide S.D., Price J.A., Brown J.A., Boss J.M. (1995). Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator (CIITA). Immunity. 2: 533—543. PMID 7749984 DOI:10.1016/1074-7613(95)90033-0
Day N.E., Ugai H., Yokoyama K.K., Ichiki A.T. (2003). K-562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region. Leuk. Res. 27: 1027—1038. PMID 12859996 DOI:10.1016/S0145-2126(03)00072-9
Harton J.A., Cressman D.E., Chin K.C., Der C.J., Ting J.P. (1999). GTP binding by class II transactivator: role in nuclear import. Science. 285: 1402—1405. PMID 10464099 DOI:10.1126/science.285.5432.1402
Soe K.C., Devaiah B.N., Singer D.S. (2013). Transcriptional coactivator CIITA, a functional homolog of TAF1, has kinase activity. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 1184—1190. PMID 24036077 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.09.001
Quan V., Towey M., Sacks S., Kelly A.P. (1999). Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA. Immunogenetics. 49: 957—963. PMID 10501838 DOI:10.1007/s002510050579

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7067 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P33076 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.