CHN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2OSA, 3CXL

Ідентифікатори

Символи

CHN1, chimerin 1, ARHGAP2, CHN, DURS2, NC, RHOGAP2

Зовнішні ІД

OMIM: 118423 MGI: 1915674 HomoloGene: 31056 GeneCards: CHN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ephrin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of axonogenesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • motor neuron axon guidance • regulation of small GTPase mediated signal transduction • нейробіологія розвитку • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of signal transduction • ephrin receptor signaling pathway • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1123


108699

Ensembl


ENSG00000128656


ENSMUSG00000056486

UniProt


P15882


Q91V57

RefSeq (мРНК)


NM_001025201 NM_001206602 NM_001822 NM_001371513 NM_001371514


NM_001113246 NM_001166603 NM_001166604 NM_029716 NM_175752

RefSeq (білок)


NP_001020372 NP_001193531 NP_001813


NP_001106717 NP_001160075 NP_001160076 NP_083992 NP_786928

Локус (UCSC)

Хр. 2: 174.8 – 175.01 Mb

Хр. 2: 73.61 – 73.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHN1 (англ. Chimerin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 459 амінокислот, а молекулярна маса — 53 172^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALTLFDTDE	YRPPVWKSYL	YQLQQEAPHP	RRITCTCEVE	NRPKYYGREF
HGMISREAAD	QLLIVAEGSY	LIRESQRQPG	TYTLALRFGS	QTRNFRLYYD
GKHFVGEKRF	ESIHDLVTDG	LITLYIETKA	AEYIAKMTIN	PIYEHVGYTT
LNREPAYKKH	MPVLKETHDE	RDSTGQDGVS	EKRLTSLVRR	ATLKENEQIP
KYEKIHNFKV	HTFRGPHWCE	YCANFMWGLI	AQGVKCADCG	LNVHKQCSKM
VPNDCKPDLK	HVKKVYSCDL	TTLVKAHTTK	RPMVVDMCIR	EIESRGLNSE
GLYRVSGFSD	LIEDVKMAFD	RDGEKADISV	NMYEDINIIT	GALKLYFRDL
PIPLITYDAY	PKFIESAKIM	DPDEQLETLH	EALKLLPPAH	CETLRYLMAH
LKRVTLHEKE	NLMNAENLGI	VFGPTLMRSP	ELDAMAALND	IRYQRLVVEL
LIKNEDILF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як нейрогенез, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

Lim H.H., Michael G.J., Smith P., Lim L., Hall C. (1992). Developmental regulation and neuronal expression of the mRNA of rat n-chimaerin, a p21rac GAP:cDNA sequence. Biochem. J. 287: 415—422. PMID 1445199 DOI:10.1042/bj2870415
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dong J.M., Smith P., Hall C., Lim L. (1995). Promoter region of the transcriptional unit for human alpha 1-chimaerin, a neuron-specific GTPase-activating protein for p21rac. Eur. J. Biochem. 227: 636—646. PMID 7867622 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20183.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1943 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P15882 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.