CDH13

CDH13
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2V37

Ідентифікатори
Символи CDH13, CDHH, P105, cadherin 13
Зовнішні ІД OMIM: 601364 MGI: 99551 HomoloGene: 20335 GeneCards: CDH13
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит, шизофренія, депресія клінічна, розлад дефіциту уваги та гіперактивності[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• protein homodimerization activity
• adiponectin binding
• cadherin binding
• зв'язування з іоном металу
• low-density lipoprotein particle binding
• lipoprotein particle binding
• cytoskeletal protein binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• мембрана
• focal adhesion
• клітинна мембрана
• perinuclear region of cytoplasm
• caveola
• anchored component of membrane
• neuron projection
• екзосома
• external side of plasma membrane
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• extracellular region
• cell surface
• catenin complex
• синапс
• collagen-containing extracellular matrix
• GABA-ergic synapse

Біологічний процес

• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• regulation of endocytosis
• positive regulation of smooth muscle cell proliferation
• negative regulation of cell adhesion
• positive regulation of calcium-mediated signaling
• positive regulation of endothelial cell proliferation
• positive regulation of cell-matrix adhesion
• positive regulation of cell migration
• low-density lipoprotein particle mediated signaling
• regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
• sprouting angiogenesis
• response to organic substance
• positive regulation of positive chemotaxis
• keratinocyte proliferation
• адгезія клітин
• Rho protein signal transduction
• GO:0007067 мітоз
• Rac protein signal transduction
• localization within membrane
• adherens junction organization
• endothelial cell migration
• negative regulation of cell population proliferation
• lamellipodium assembly
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0000767 cell morphogenesis
• cell-cell junction assembly
• cell-cell adhesion mediated by cadherin
• cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1012
12554
Ensembl
ENSG00000140945
ENSMUSG00000031841
UniProt
P55290
Q9WTR5
RefSeq (мРНК)
NM_001220488
NM_001220489
NM_001220490
NM_001220491
NM_001220492
NM_001257
NM_019707
RefSeq (білок)
NP_001207417
NP_001207418
NP_001207419
NP_001207420
NP_001207421
NP_001248
NP_062681
Локус (UCSC) Хр. 16: 82.63 – 83.8 Mb Хр. 8: 119.01 – 120.05 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH13 (англ. Cadherin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 713 амінокислот, а молекулярна маса — 78 287[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSI
LNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHART
PHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPEN
QRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVT
RTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPY
IGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY
IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATAT
IMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAY
TIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPL
VPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVN
ATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSV
YTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS
VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNL
NKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLP
SVLLLSLFSLACL

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Lee S.W. (1996). H-cadherin, a novel cadherin with growth inhibitory functions and diminished expression in human breast cancer. Nat. Med. 2: 776—782. PMID 8673923 DOI:10.1038/nm0796-776
  • Sato M., Mori Y., Sakurada A., Fujimura S., Horii A. (1998). The H-cadherin (CDH13) gene is inactivated in human lung cancer. Hum. Genet. 103: 96—101. PMID 9737784 DOI:10.1007/s004390050790
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Niermann T., Kern F., Erne P., Resink T. (2000). The glycosyl phosphatidylinositol anchor of human T-cadherin binds lipoproteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276: 1240—1247. PMID 11027617 DOI:10.1006/bbrc.2000.3465
  • Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1753 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P55290 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.