CDC42BPB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QFV, 3TKU, 4UAK, 4UAL

Ідентифікатори

Символи

CDC42BPB, MRCKB, CDC42 binding protein kinase beta, CHOCNS

Зовнішні ІД

OMIM: 614062 MGI: 2136459 HomoloGene: 55945 GeneCards: CDC42BPB

Пов'язані генетичні захворювання

diffuse large B-cell lymphoma^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ATP binding • magnesium ion binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • cell leading edge • actomyosin • цитоскелет • екзосома • lamellipodium • cell projection
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • фосфорилювання • actomyosin structure organization • establishment or maintenance of cell polarity • protein phosphorylation • cytoskeleton organization • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • actin cytoskeleton organization • actin cytoskeleton reorganization • peptidyl-threonine phosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9578


217866

Ensembl


ENSG00000198752


ENSMUSG00000021279

UniProt


Q9Y5S2 Q86XZ8


Q7TT50

RefSeq (мРНК)


NM_006035


NM_183016

RefSeq (білок)


NP_006026 NP_006026.3


NP_898837

Локус (UCSC)

Хр. 14: 102.93 – 103.06 Mb

Хр. 12: 111.26 – 111.34 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC42BPB (англ. CDC42 binding protein kinase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 711 амінокислот, а молекулярна маса — 194 315^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAKVRLKKL	EQLLLDGPWR	NESALSVETL	LDVLVCLYTE	CSHSALRRDK
YVAEFLEWAK	PFTQLVKEMQ	LHREDFEIIK	VIGRGAFGEV	AVVKMKNTER
IYAMKILNKW	EMLKRAETAC	FREERDVLVN	GDCQWITALH	YAFQDENHLY
LVMDYYVGGD	LLTLLSKFED	KLPEDMARFY	IGEMVLAIDS	IHQLHYVHRD
IKPDNVLLDV	NGHIRLADFG	SCLKMNDDGT	VQSSVAVGTP	DYISPEILQA
MEDGMGKYGP	ECDWWSLGVC	MYEMLYGETP	FYAESLVETY	GKIMNHEERF
QFPSHVTDVS	EEAKDLIQRL	ICSRERRLGQ	NGIEDFKKHA	FFEGLNWENI
RNLEAPYIPD	VSSPSDTSNF	DVDDDVLRNT	EILPPGSHTG	FSGLHLPFIG
FTFTTESCFS	DRGSLKSIMQ	SNTLTKDEDV	QRDLEHSLQM	EAYERRIRRL
EQEKLELSRK	LQESTQTVQS	LHGSSRALSN	SNRDKEIKKL	NEEIERLKNK
IADSNRLERQ	LEDTVALRQE	REDSTQRLRG	LEKQHRVVRQ	EKEELHKQLV
EASERLKSQA	KELKDAHQQR	KLALQEFSEL	NERMAELRAQ	KQKVSRQLRD
KEEEMEVATQ	KVDAMRQEMR	RAEKLRKELE	AQLDDAVAEA	SKERKLREHS
ENFCKQMESE	LEALKVKQGG	RGAGATLEHQ	QEISKIKSEL	EKKVLFYEEE
LVRREASHVL	EVKNVKKEVH	DSESHQLALQ	KEILMLKDKL	EKSKRERHNE
MEEAVGTIKD	KYERERAMLF	DENKKLTAEN	EKLCSFVDKL	TAQNRQLEDE
LQDLAAKKES	VAHWEAQIAE	IIQWVSDEKD	ARGYLQALAS	KMTEELEALR
SSSLGSRTLD	PLWKVRRSQK	LDMSARLELQ	SALEAEIRAK	QLVQEELRKV
KDANLTLESK	LKDSEAKNRE	LLEEMEILKK	KMEEKFRADT	GLKLPDFQDS
IFEYFNTAPL	AHDLTFRTSS	ASEQETQAPK	PEASPSMSVA	ASEQQEDMAR
PPQRPSAVPL	PTTQALALAG	PKPKAHQFSI	KSFSSPTQCS	HCTSLMVGLI
RQGYACEVCS	FACHVSCKDG	APQVCPIPPE	QSKRPLGVDV	QRGIGTAYKG
HVKVPKPTGV	KKGWQRAYAV	VCDCKLFLYD	LPEGKSTQPG	VIASQVLDLR
DDEFSVSSVL	ASDVIHATRR	DIPCIFRVTA	SLLGAPSKTS	SLLILTENEN
EKRKWVGILE	GLQSILHKNR	LRNQVVHVPL	EAYDSSLPLI	KAILTAAIVD
ADRIAVGLEE	GLYVIEVTRD	VIVRAADCKK	VHQIELAPRE	KIVILLCGRN
HHVHLYPWSS	LDGAEGSFDI	KLPETKGCQL	MATATLKRNS	GTCLFVAVKR
LILCYEIQRT	KPFHRKFNEI	VAPGSVQCLA	VLRDRLCVGY	PSGFCLLSIQ
GDGQPLNLVN	PNDPSLAFLS	QQSFDALCAV	ELESEEYLLC	FSHMGLYVDP
QGRRARAQEL	MWPAAPVACS	CSPTHVTVYS	EYGVDVFDVR	TMEWVQTIGL
RRIRPLNSEG	TLNLLNCEPP	RLIYFKSKFS	GAVLNVPDTS	DNSKKQMLRT
RSKRRFVFKV	PEEERLQQRR	EMLRDPELRS	KMISNPTNFN	HVAHMGPGDG
MQVLMDLPLS	AVPPSQEERP	GPAPTNLARQ	PPSRNKPYIS	WPSSGGSEPS
VTVPLRSMSD	PDQDFDKEPD	SDSTKHSTPS	NSSNPSGPPS	PNSPHRSQLP
LEGLEQPACD	T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Moncrieff C.L., Bailey M.E., Morrison N., Johnson K.J. (1999). Cloning and chromosomal localization of human Cdc42-binding protein kinase beta. Genomics. 57: 297—300. PMID 10198171 DOI:10.1006/geno.1999.5769
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tan I., Yong J., Dong J.M., Lim L., Leung T. (2008). A tripartite complex containing MRCK modulates lamellar actomyosin retrograde flow. Cell. 135: 123—136. PMID 18854160 DOI:10.1016/j.cell.2008.09.018
Tan I., Lai J., Yong J., Li S.F., Leung T. (2011). Chelerythrine perturbs lamellar actomyosin filaments by selective inhibition of myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase. FEBS Lett. 585: 1260—1268. PMID 21457715 DOI:10.1016/j.febslet.2011.03.054

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDC42BPB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1738 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5S2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.