CAMK1D

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JC6

Ідентифікатори

Символи

CAMK1D, CKLiK, CaM-K1, CaMKID, calcium/calmodulin dependent protein kinase ID

Зовнішні ІД

OMIM: 607957 MGI: 2442190 HomoloGene: 121858 GeneCards: CAMK1D

Пов'язані генетичні захворювання

анорексія, ожиріння^[1]

Реагує на сполуку

бозутиніб^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • каталітична активність • ATP binding • calmodulin-dependent protein kinase activity • calmodulin binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• regulation of granulocyte chemotaxis • positive regulation of phagocytosis • фосфорилювання • negative regulation of apoptotic process • regulation of dendrite development • нейробіологія розвитку • protein phosphorylation • positive regulation of CREB transcription factor activity • positive regulation of apoptotic process • обмін речовин • inflammatory response • positive regulation of respiratory burst • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of neuron projection development • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57118


227541

Ensembl


ENSG00000183049


ENSMUSG00000039145

UniProt


Q8IU85


Q8BW96

RefSeq (мРНК)


NM_020397 NM_153498 NM_001351032


NM_001290374 NM_001290375 NM_001290376 NM_177343

RefSeq (білок)


NP_065130 NP_705718 NP_001337961


NP_001277303 NP_001277304 NP_001277305 NP_796317

Локус (UCSC)

Хр. 10: 12.35 – 12.84 Mb

Хр. 2: 5.3 – 5.72 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAMK1D (англ. Calcium/calmodulin dependent protein kinase ID) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 914^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARENGESSS	SWKKQAEDIK	KIFEFKETLG	TGAFSEVVLA	EEKATGKLFA
VKCIPKKALK	GKESSIENEI	AVLRKIKHEN	IVALEDIYES	PNHLYLVMQL
VSGGELFDRI	VEKGFYTEKD	ASTLIRQVLD	AVYYLHRMGI	VHRDLKPENL
LYYSQDEESK	IMISDFGLSK	MEGKGDVMST	ACGTPGYVAP	EVLAQKPYSK
AVDCWSIGVI	AYILLCGYPP	FYDENDSKLF	EQILKAEYEF	DSPYWDDISD
SAKDFIRNLM	EKDPNKRYTC	EQAARHPWIA	GDTALNKNIH	ESVSAQIRKN
FAKSKWRQAF	NATAVVRHMR	KLHLGSSLDS	SNASVSSSLS	LASQKDCLAP
STLCSFISSS	SGVSGVGAER	RPRPTTVTAV	HSGSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Verploegen S., Lammers J.-W.L., Koenderman L., Coffer P.J. (2000). Identification and characterization of CKLiK, a novel granulocyte Ca++/calmodulin-dependent protein kinase. Blood. 96: 3215—3223. PMID 11050006

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAMK1D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium/calmodulin dependent protein kinase ID переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19341 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IU85 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.