BRF1

BRF1
Ідентифікатори
Символи BRF1, BRF, BRF-1, GTF3B, HEL-S-76p, TAF3B2, TAF3C, TAFIII90, TF3B90, TFIIIB90, hBRF, CFDS, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 kDa subunit, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, BRF1 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit
Зовнішні ІД OMIM: 604902 MGI: 1919558 HomoloGene: 1161 GeneCards: BRF1
Пов'язані генетичні захворювання
cerebellar-facial-dental syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

TBP-class protein binding
зв'язування з іоном металу
RNA polymerase III general transcription initiation factor activity
RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding
transcription factor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
translation initiation factor activity

Клітинна компонента

transcription factor TFIIIB complex
клітинне ядро
нуклеоплазма

Біологічний процес

rRNA transcription
tRNA transcription
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription by RNA polymerase III
transcription by RNA polymerase III
transcription initiation from RNA polymerase III promoter
transcription preinitiation complex assembly
DNA-templated transcription, initiation
RNA polymerase III preinitiation complex assembly
regulation of transcription by RNA polymerase III
translational initiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2972
72308
Ensembl
ENSG00000185024
ENSMUSG00000011158
UniProt
Q92994
Q8CFK2
RefSeq (мРНК)
NM_001242786
NM_001242787
NM_001242788
NM_001242789
NM_001242790
NM_001519
NM_145685
NM_145696
NM_028193
RefSeq (білок)
NP_001229715
NP_001229716
NP_001229717
NP_001229718
NP_001229719
NP_001510
NP_663718
NP_663718.1
NP_082469
Локус (UCSC) Хр. 14: 105.21 – 105.32 Mb Хр. 12: 112.92 – 112.96 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BRF1 (англ. BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 73 840[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTGRVCRGCGGTDIELDAARGDAVCTACGSVLEDNIIVSEVQFVESSGGG
SSAVGQFVSLDGAGKTPTLGGGFHVNLGKESRAQTLQNGRRHIHHLGNQL
QLNQHCLDTAFNFFKMAVSRHLTRGRKMAHVIAACLYLVCRTEGTPHMLL
DLSDLLQVNVYVLGKTFLLLARELCINAPAIDPCLYIPRFAHLLEFGEKN
HEVSMTALRLLQRMKRDWMHTGRRPSGLCGAALLVAARMHDFRRTVKEVI
SVVKVCESTLRKRLTEFEDTPTSQLTIDEFMKIDLEEECDPPSYTAGQRK
LRMKQLEQVLSKKLEEVEGEISSYQDAIEIELENSRPKAKGGLASLAKDG
STEDTASSLCGEEDTEDEELEAAASHLNKDLYRELLGGAPGSSEAAGSPE
WGGRPPALGSLLDPLPTAASLGISDSIRECISSQSSDPKDASGDGELDLS
GIDDLEIDRYILNESEARVKAELWMRENAEYLREQREKEARIAKEKELGI
YKEHKPKKSCKRREPIQASTAREAIEKMLEQKKISSKINYSVLRGLSSAG
GGSPHREDAQPEHSASARKLSRRRTPASRSGADPVTSVGKRLRPLVSTQP
AKKVATGEALLPSSPTLGAEPARPQAVLVESGPVSYHADEEADEEEPDEE
DGEPCVSALQMMGSNDYGCDGDEDDGY

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • Wang Z., Roeder R.G. (1995). Structure and function of a human transcription factor TFIIIB subunit that is evolutionarily conserved and contains both TFIIB- and high-mobility-group protein 2-related domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7026—7030. PMID 7624363 DOI:10.1073/pnas.92.15.7026
  • Mital R., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). RNA polymerase III transcription from the human U6 and adenovirus type 2 VAI promoters has different requirements for human BRF, a subunit of human TFIIIB. Mol. Cell. Biol. 16: 7031—7042. PMID 8943358 DOI:10.1128/MCB.16.12.7031
  • McCulloch V., Hardin P., Peng W., Ruppert J.M., Lobo-Ruppert S.M. (2000). Alternatively spliced hBRF variants function at different RNA polymerase III promoters. EMBO J. 19: 4134—4143. PMID 10921893 DOI:10.1093/emboj/19.15.4134
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fairley J.A., Scott P.H., White R.J. (2003). TFIIIB is phosphorylated, disrupted and selectively released from tRNA promoters during mitosis in vivo. EMBO J. 22: 5841—5850. PMID 14592981 DOI:10.1093/emboj/cdg544

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з BRF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11551 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q92994 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.