BAZ1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1F62

Ідентифікатори

Символи

BAZ1B, WBSCR10, WBSCR9, WSTF, bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B

Зовнішні ІД

OMIM: 605681 MGI: 1353499 HomoloGene: 22651 GeneCards: BAZ1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • histone kinase activity • GO:0031493 histone binding • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • zinc ion binding
Клітинна компонента	• pericentric heterochromatin • nuclear replication fork • нуклеоплазма • condensed chromosome • клітинне ядро • ядерні тільця
Біологічний процес	• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • ремоделювання хроматину • фосфорилювання • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9031


22385

Ensembl


ENSG00000009954


ENSMUSG00000002748

UniProt


Q9UIG0


Q9Z277

RefSeq (мРНК)


NM_023005 NM_032408 NM_001370402


NM_011714

RefSeq (білок)


NP_115784 NP_001357331


NP_035844

Локус (UCSC)

Хр. 7: 73.44 – 73.52 Mb

Хр. 5: 135.22 – 135.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BAZ1B (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 483 амінокислот, а молекулярна маса — 170 903^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPLLGRKPF	PLVKPLPGEE	PLFTIPHTQE	AFRTREEYEA	RLERYSERIW
TCKSTGSSQL	THKEAWEEEQ	EVAELLKEEF	PAWYEKLVLE	MVHHNTASLE
KLVDTAWLEI	MTKYAVGEEC	DFEVGKEKML	KVKIVKIHPL	EKVDEEATEK
KSDGACDSPS	SDKENSSQIA	QDHQKKETVV	KEDEGRRESI	NDRARRSPRK
LPTSLKKGER	KWAPPKFLPH	KYDVKLQNED	KIISNVPADS	LIRTERPPNK
EIVRYFIRHN	ALRAGTGENA	PWVVEDELVK	KYSLPSKFSD	FLLDPYKYMT
LNPSTKRKNT	GSPDRKPSKK	SKTDNSSLSS	PLNPKLWCHV	HLKKSLSGSP
LKVKNSKNSK	SPEEHLEEMM	KMMSPNKLHT	NFHIPKKGPP	AKKPGKHSDK
PLKAKGRSKG	ILNGQKSTGN	SKSPKKGLKT	PKTKMKQMTL	LDMAKGTQKM
TRAPRNSGGT	PRTSSKPHKH	LPPAALHLIA	YYKENKDRED	KRSALSCVIS
KTARLLSSED	RARLPEELRS	LVQKRYELLE	HKKRWASMSE	EQRKEYLKKK
REELKKKLKE	KAKERREKEM	LERLEKQKRY	EDQELTGKNL	PAFRLVDTPE
GLPNTLFGDV	AMVVEFLSCY	SGLLLPDAQY	PITAVSLMEA	LSADKGGFLY
LNRVLVILLQ	TLLQDEIAED	YGELGMKLSE	IPLTLHSVSE	LVRLCLRRSD
VQEESEGSDT	DDNKDSAAFE	DNEVQDEFLE	KLETSEFFEL	TSEEKLQILT
ALCHRILMTY	SVQDHMETRQ	QMSAELWKER	LAVLKEENDK	KRAEKQKRKE
MEAKNKENGK	VENGLGKTDR	KKEIVKFEPQ	VDTEAEDMIS	AVKSRRLLAI
QAKKEREIQE	REMKVKLERQ	AEEERIRKHK	AAAEKAFQEG	IAKAKLVMRR
TPIGTDRNHN	RYWLFSDEVP	GLFIEKGWVH	DSIDYRFNHH	CKDHTVSGDE
DYCPRSKKAN	LGKNASMNTQ	HGTATEVAVE	TTTPKQGQNL	WFLCDSQKEL
DELLNCLHPQ	GIRESQLKER	LEKRYQDIIH	SIHLARKPNL	GLKSCDGNQE
LLNFLRSDLI	EVATRLQKGG	LGYVEETSEF	EARVISLEKL	KDFGECVIAL
QASVIKKFLQ	GFMAPKQKRR	KLQSEDSAKT	EEVDEEKKMV	EEAKVASALE
KWKTAIREAQ	TFSRMHVLLG	MLDACIKWDM	SAENARCKVC	RKKGEDDKLI
LCDECNKAFH	LFCLRPALYE	VPDGEWQCPA	CQPATARRNS	RGRNYTEESA
SEDSEDDESD	EEEEEEEEEE	EEEDYEVAGL	RLRPRKTIRG	KHSVIPPAAR
SGRRPGKKPH	STRRSQPKAP	PVDDAEVDEL	VLQTKRSSRR	QSLELQKCEE
ILHKIVKYRF	SWPFREPVTR	DEAEDYYDVI	THPMDFQTVQ	NKCSCGSYRS
VQEFLTDMKQ	VFTNAEVYNC	RGSHVLSCMV	KTEQCLVALL	HKHLPGHPYV
RRKRKKFPDR	LAEDEGDSEP	EAVGQSRGRR	QKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Lu X., Meng X., Morris C.A., Keating M.T. (1998). A novel human gene, WSTF, is deleted in Williams Syndrome. Genomics. 54: 241—249. PMID 9828126 DOI:10.1006/geno.1998.5578
Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J. 21: 2231—2241. PMID 11980720 DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:961 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UIG0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.