ATG9A

Ідентифікатори

Символи

ATG9A, APG9L1, MGD3208, mATG9, autophagy related 9A

Зовнішні ІД

OMIM: 612204 MGI: 2138446 HomoloGene: 34495 GeneCards: ATG9A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • recycling endosome • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • phagophore assembly site • trans-Golgi network • autophagosome membrane • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • autophagosome • внутрішньоклітинна мембранна органела • cytoplasmic vesicle membrane
Біологічний процес	• protein localization to phagophore assembly site • autophagosome assembly • автофагія • autophagy of mitochondrion • late nucleophagy • protein transport • response to nutrient levels • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79065


245860

Ensembl


ENSG00000198925


ENSMUSG00000033124

UniProt


Q7Z3C6


Q68FE2

RefSeq (мРНК)


NM_001077198 NM_024085


NM_001003917 NM_001288612 NM_001288613

RefSeq (білок)


NP_001070666 NP_076990 NP_001070666.1 NP_076990.4

NP_001003917 NP_001275541 NP_001275542 NP_001395154 NP_001395156
NP_001395158 NP_001395159 NP_001395160

Локус (UCSC)

Хр. 2: 219.22 – 219.23 Mb

Хр. 1: 75.16 – 75.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ATG9A (англ. Autophagy related 9A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 447^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQFDTEYQR	LEASYSDSPP	GEEDLLVHVA	EGSKSPWHHI	ENLDLFFSRV
YNLHQKNGFT	CMLIGEIFEL	MQFLFVVAFT	TFLVSCVDYD	ILFANKMVNH
SLHPTEPVKV	TLPDAFLPAQ	VCSARIQENG	SLITILVIAG	VFWIHRLIKF
IYNICCYWEI	HSFYLHALRI	PMSALPYCTW	QEVQARIVQT	QKEHQICIHK
RELTELDIYH	RILRFQNYMV	ALVNKSLLPL	RFRLPGLGEA	VFFTRGLKYN
FELILFWGPG	SLFLNEWSLK	AEYKRGGQRL	ELAQRLSNRI	LWIGIANFLL
CPLILIWQIL	YAFFSYAEVL	KREPGALGAR	CWSLYGRCYL	RHFNELEHEL
QSRLNRGYKP	ASKYMNCFLS	PLLTLLAKNG	AFFAGSILAV	LIALTIYDED
VLAVEHVLTT	VTLLGVTVTV	CRSFIPDQHM	VFCPEQLLRV	ILAHIHYMPD
HWQGNAHRSQ	TRDEFAQLFQ	YKAVFILEEL	LSPIVTPLIL	IFCLRPRALE
IIDFFRNFTV	EVVGVGDTCS	FAQMDVRQHG	HPQWLSAGQT	EASVYQQAED
GKTELSLMHF	AITNPGWQPP	RESTAFLGFL	KEQVQRDGAA	ASLAQGGLLP
ENALFTSIQS	LQSESEPLSL	IANVVAGSSC	RGPPLPRDLQ	GSRHRAEVAS
ALRSFSPLQP	GQAPTGRAHS	TMTGSGVDAR	TASSGSSVWE	GQLQSLVLSE
YASTEMSLHA	LYMHQLHKQQ	AQAEPERHVW	HRRESDESGE	SAPDEGGEGA
RAPQSIPRSA	SYPCAAPRPG	APETTALHGG	FQRRYGGITD	PGTVPRVPSH
FSRLPLGGWA	EDGQSASRHP	EPVPEEGSED	ELPPQVHKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chan E.Y.W., Longatti A., McKnight N.C., Tooze S.A. (2009). Kinase-inactivated ULK proteins inhibit autophagy via their conserved C-terminal domains using an Atg13-independent mechanism. Mol. Cell. Biol. 29: 157—171. PMID 18936157 DOI:10.1128/MCB.01082-08
Webber J.L., Tooze S.A. (2010). Coordinated regulation of autophagy by p38alpha MAPK through mAtg9 and p38IP. EMBO J. 29: 27—40. PMID 19893488 DOI:10.1038/emboj.2009.321
Tamura H., Shibata M., Koike M., Sasaki M., Uchiyama Y. (2010). Atg9A protein, an autophagy-related membrane protein, is localized in the neurons of mouse brains. J. Histochem. Cytochem. 58: 443—453. PMID 20124090 DOI:10.1369/jhc.2010.955690

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22408 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7Z3C6 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.