ARFGEF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LTL, 5EE5

Ідентифікатори

Символи

ARFGEF1, ARFGEP1, BIG1, P200, ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604141 MGI: 2442988 HomoloGene: 4687 GeneCards: ARFGEF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • myosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase A regulatory subunit binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • nuclear matrix • Golgi membrane • нуклеоплазма • trans-Golgi network • ядерце • small nuclear ribonucleoprotein complex • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• endomembrane system organization • positive regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of actin filament polymerization • Golgi organization • positive regulation of wound healing • regulation of ARF protein signal transduction • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • protein transport • neuron projection development • regulation of establishment of cell polarity • екзоцитоз • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10565


211673

Ensembl


ENSG00000066777


ENSMUSG00000067851

UniProt


Q9Y6D6


G3X9K3

RefSeq (мРНК)


NM_006421


NM_001102430

RefSeq (білок)


NP_006412


NP_001095900

Локус (UCSC)

Хр. 8: 67.17 – 67.34 Mb

Хр. 1: 10.21 – 10.3 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARFGEF1 (англ. ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 849 амінокислот, а молекулярна маса — 208 767^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYEGKKTKNM	FLTRALEKIL	ADKEVKKAHH	SQLRKACEVA	LEEIKAETEK
QSPPHGEAKA	GSSTLPPVKS	KTNFIEADKY	FLPFELACQS	KCPRIVSTSL
DCLQKLIAYG	HLTGNAPDST	TPGKKLIDRI	IETICGCFQG	PQTDEGVQLQ
IIKALLTAVT	SQHIEIHEGT	VLQAVRTCYN	IYLASKNLIN	QTTAKATLTQ
MLNVIFARME	NQALQEAKQM	EKERHRQHHH	LLQSPVSHHE	PESPQLRYLP
PQTVDHISQE	HEGDLDLHTN	DVDKSLQDDT	EPENGSDISS	AENEQTEADQ
ATAAETLSKN	EVLYDGENHD	CEEKPQDIVQ	NIVEEMVNIV	VGDMGEGTTI
NASADGNIGT	IEDGSDSENI	QANGIPGTPI	SVAYTPSLPD	DRLSVSSNDT
QESGNSSGPS	PGAKFSHILQ	KDAFLVFRSL	CKLSMKPLSD	GPPDPKSHEL
RSKILSLQLL	LSILQNAGPI	FRTNEMFINA	IKQYLCVALS	KNGVSSVPEV
FELSLSIFLT	LLSNFKTHLK	MQIEVFFKEI	FLYILETSTS	SFDHKWMVIQ
TLTRICADAQ	SVVDIYVNYD	CDLNAANIFE	RLVNDLSKIA	QGRGSQELGM
SNVQELSLRK	KGLECLVSIL	KCMVEWSKDQ	YVNPNSQTTL	GQEKPSEQEM
SEIKHPETIN	RYGSLNSLES	TSSSGIGSYS	TQMSGTDNPE	QFEVLKQQKE
IIEQGIDLFN	KKPKRGIQYL	QEQGMLGTTP	EDIAQFLHQE	ERLDSTQVGE
FLGDNDKFNK	EVMYAYVDQH	DFSGKDFVSA	LRMFLEGFRL	PGEAQKIDRL
MEKFAARYLE	CNQGQTLFAS	ADTAYVLAYS	IIMLTTDLHS	PQVKNKMTKE
QYIKMNRGIN	DSKDLPEEYL	SAIYNEIAGK	KISMKETKEL	TIPTKSSKQN
VASEKQRRLL	YNLEMEQMAK	TAKALMEAVS	HVQAPFTSAT	HLEHVRPMFK
LAWTPFLAAF	SVGLQDCDDT	EVASLCLEGI	RCAIRIACIF	SIQLERDAYV
QALARFTLLT	VSSGITEMKQ	KNIDTIKTLI	TVAHTDGNYL	GNSWHEILKC
ISQLELAQLI	GTGVKPRYIS	GTVRGREGSL	TGTKDQAPDE	FVGLGLVGGN
VDWKQIASIQ	ESIGETSSQS	VVVAVDRIFT	GSTRLDGNAI	VDFVRWLCAV
SMDELLSTTH	PRMFSLQKIV	EISYYNMGRI	RLQWSRIWEV	IGDHFNKVGC
NPNEDVAIFA	VDSLRQLSMK	FLEKGELANF	RFQKDFLRPF	EHIMKRNRSP
TIRDMVVRCI	AQMVNSQAAN	IRSGWKNIFS	VFHLAASDQD	ESIVELAFQT
TGHIVTLVFE	KHFPATIDSF	QDAVKCLSEF	ACNAAFPDTS	MEAIRLIRHC
AKYVSDRPQA	FKEYTSDDMN	VAPEDRVWVR	GWFPILFELS	CIINRCKLDV
RTRGLTVMFE	IMKTYGHTYE	KHWWQDLFRI	VFRIFDNMKL	PEQQTEKAEW
MTTTCNHALY	AICDVFTQYL	EVLSDVLLDD	IFAQLYWCVQ	QDNEQLARSG
TNCLENVVIL	NGEKFTLEIW	DKTCNCTLDI	FKTTIPHALL	TWRPNSGETA
PPPPSPVSEK	PLDTISQKSV	DIHDSIQPRS	VDNRPQAPLV	SASAVNEEVS
KIKSTAKFPE	QKLFAALLIK	CVVQLELIQT	IDNIVFFPAT	SKKEDAENLA
AAQRDAVDFD	VRVDTQDQGM	YRFLTSQQLF	KLLDCLLESH	RFAKAFNSNN
EQRTALWKAG	FKGKSKPNLL	KQETSSLACG	LRILFRMYMD	ESRVSAWEEV
QQRLLNVCSE	ALSYFLTLTS	ESHREAWTNL	LLLFLTKVLK	ISDNRFKAHA
SFYYPLLCEI	MQFDLIPELR	AVLRRFFLRI	GVVFQISQPP	EQELGINKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Togawa A., Morinaga N., Ogasawara M., Moss J., Vaughan M. (1999). Purification and cloning of a brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein for ADP-ribosylation factors. J. Biol. Chem. 274: 12308—12315. PMID 10212200 DOI:10.1074/jbc.274.18.12308
Greninger A.L., Knudsen G.M., Betegon M., Burlingame A.L., DeRisi J.L. (2013). ACBD3 interaction with TBC1 domain 22 protein is differentially affected by enteroviral and kobuviral 3A protein binding. MBio. 4: E00098—E00098. PMID 23572552 DOI:10.1128/mBio.00098-13
Li H., Adamik R., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2003). Protein kinase A-anchoring (AKAP) domains in brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 (BIG2). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 1627—1632. PMID 12571360 DOI:10.1073/pnas.0337678100
Padilla P.I., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2004). Nuclear localization and molecular partners of BIG1, a brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein for ADP-ribosylation factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 2752—2757. PMID 14973189 DOI:10.1073/pnas.0307345101
Saeki N., Tokuo H., Ikebe M. (2005). BIG1 is a binding partner of myosin IXb and regulates its Rho-GTPase activating protein activity. J. Biol. Chem. 280: 10128—10134. PMID 15644318 DOI:10.1074/jbc.M413415200
Shen X., Hong M.S., Moss J., Vaughan M. (2007). BIG1, a brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein, is required for correct glycosylation and function of integrin beta1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 1230—1235. PMID 17227842 DOI:10.1073/pnas.0610535104

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15772 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y6D6 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.