ADAMTS1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JIH, 2V4B, 3Q2G, 3Q2H | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ADAMTS1, C3-C5, METH1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605174 MGI: 109249 HomoloGene: 21381 GeneCards: ADAMTS1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • heparin binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • базальна мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • ovulation from ovarian follicle • heart trabecula formation • розвиток нирки • протеоліз • integrin-mediated signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 21: 26.84 – 26.85 Mb | Хр. 16: 85.59 – 85.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ADAMTS1 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 105 358[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQRAVPEGFG | | RRKLGSDMGN | | AERAPGSRSF | | GPVPTLLLLA | | AALLAVSDAL |
GRPSEEDEEL | | VVPELERAPG | | HGTTRLRLHA | | FDQQLDLELR | | PDSSFLAPGF |
TLQNVGRKSG | | SETPLPETDL | | AHCFYSGTVN | | GDPSSAAALS | | LCEGVRGAFY |
LLGEAYFIQP | | LPAASERLAT | | AAPGEKPPAP | | LQFHLLRRNR | | QGDVGGTCGV |
VDDEPRPTGK | | AETEDEDEGT | | EGEDEGAQWS | | PQDPALQGVG | | QPTGTGSIRK |
KRFVSSHRYV | | ETMLVADQSM | | AEFHGSGLKH | | YLLTLFSVAA | | RLYKHPSIRN |
SVSLVVVKIL | | VIHDEQKGPE | | VTSNAALTLR | | NFCNWQKQHN | | PPSDRDAEHY |
DTAILFTRQD | | LCGSQTCDTL | | GMADVGTVCD | | PSRSCSVIED | | DGLQAAFTTA |
HELGHVFNMP | | HDDAKQCASL | | NGVNQDSHMM | | ASMLSNLDHS | | QPWSPCSAYM |
ITSFLDNGHG | | ECLMDKPQNP | | IQLPGDLPGT | | SYDANRQCQF | | TFGEDSKHCP |
DAASTCSTLW | | CTGTSGGVLV | | CQTKHFPWAD | | GTSCGEGKWC | | INGKCVNKTD |
RKHFDTPFHG | | SWGMWGPWGD | | CSRTCGGGVQ | | YTMRECDNPV | | PKNGGKYCEG |
KRVRYRSCNL | | EDCPDNNGKT | | FREEQCEAHN | | EFSKASFGSG | | PAVEWIPKYA |
GVSPKDRCKL | | ICQAKGIGYF | | FVLQPKVVDG | | TPCSPDSTSV | | CVQGQCVKAG |
CDRIIDSKKK | | FDKCGVCGGN | | GSTCKKISGS | | VTSAKPGYHD | | IITIPTGATN |
IEVKQRNQRG | | SRNNGSFLAI | | KAADGTYILN | | GDYTLSTLEQ | | DIMYKGVVLR |
YSGSSAALER | | IRSFSPLKEP | | LTIQVLTVGN | | ALRPKIKYTY | | FVKKKKESFN |
AIPTFSAWVI | | EEWGECSKSC | | ELGWQRRLVE | | CRDINGQPAS | | ECAKEVKPAS |
TRPCADHPCP | | QWQLGEWSSC | | SKTCGKGYKK | | RSLKCLSHDG | | GVLSHESCDP |
LKKPKHFIDF | | CTMAECS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:217 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UHI8 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM | |
---|
Матриксні металопротеїнази | |
---|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |