ACKR3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
7SK6, 7SK5

Ідентифікатори

Символи

ACKR3, CMKOR1, CXC-R7, CXCR-7, CXCR7, GPR159, RDC-1, RDC1, atypical chemokine receptor 3

Зовнішні ІД

OMIM: 610376 MGI: 109562 HomoloGene: 22419 GeneCards: ACKR3

Реагує на сполуку

plerixafor^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• C-X-C chemokine receptor activity • G protein-coupled receptor activity • coreceptor activity • C-X-C chemokine binding • signal transducer activity • chemokine binding • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • C-C chemokine receptor activity • C-C chemokine binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • ендосома • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • clathrin-coated pit • клітинне ядро • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• chemokine-mediated signaling pathway • receptor internalization • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • васкулогенез • multicellular organism development • хемотаксис • адгезія клітин • Ангіогенез • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of mesenchymal stem cell migration • G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium-mediated signaling • cell chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57007


12778

Ensembl


ENSG00000144476


ENSMUSG00000044337

UniProt


P25106


P56485

RefSeq (мРНК)


NM_001047841 NM_020311


NM_001271607 NM_007722

RefSeq (білок)


NP_064707


NP_001258536 NP_031748

Локус (UCSC)

Хр. 2: 236.57 – 236.58 Mb

Хр. 1: 90.13 – 90.14 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ACKR3 (англ. Atypical chemokine receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 41 493^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLHLFDYSE	PGNFSDISWP	CNSSDCIVVD	TVMCPNMPNK	SVLLYTLSFI
YIFIFVIGMI	ANSVVVWVNI	QAKTTGYDTH	CYILNLAIAD	LWVVLTIPVW
VVSLVQHNQW	PMGELTCKVT	HLIFSINLFG	SIFFLTCMSV	DRYLSITYFT
NTPSSRKKMV	RRVVCILVWL	LAFCVSLPDT	YYLKTVTSAS	NNETYCRSFY
PEHSIKEWLI	GMELVSVVLG	FAVPFSIIAV	FYFLLARAIS	ASSDQEKHSS
RKIIFSYVVV	FLVCWLPYHV	AVLLDIFSIL	HYIPFTCRLE	HALFTALHVT
QCLSLVHCCV	NPVLYSFINR	NYRYELMKAF	IFKYSAKTGL	TKLIDASRVS
ETEYSALEQS	TK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Sreedharan S.P., Robichon A., Peterson K.E., Goetzl E.J. (1991). Cloning and expression of the human vasoactive intestinal peptide receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4986—4990. PMID 1675791 DOI:10.1073/pnas.88.11.4986
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Infantino S., Moepps B., Thelen M. (2006). Expression and regulation of the orphan receptor RDC1 and its putative ligand in human dendritic and B cells. J. Immunol. 176: 2197—2207. PMID 16455976 DOI:10.4049/jimmunol.176.4.2197
Levoye A., Balabanian K., Baleux F., Bachelerie F., Lagane B. (2009). CXCR7 heterodimerizes with CXCR4 and regulates CXCL12-mediated G protein signaling. Blood. 113: 6085—6093. PMID 19380869 DOI:10.1182/blood-2008-12-196618
Bonecchi R., Savino B., Borroni E.M., Mantovani A., Locati M. (2010). Chemokine decoy receptors: structure-function and biological properties. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 341: 15—36. PMID 20373092 DOI:10.1007/82_2010_19
Shimizu S., Brown M., Sengupta R., Penfold M.E., Meucci O. (2011). CXCR7 protein expression in human adult brain and differentiated neurons. PLoS ONE. 6: E20680—E20680. PMID 21655198 DOI:10.1371/journal.pone.0020680

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ACKR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23692 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, P25106 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.