Цистатин C

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1G96, 1R4C, 1TIJ, 3GAX, 3NX0, 3PS8, 3QRD, 3S67, 3SVA

Ідентифікатори

Символи

CST3, ARMD11, HEL-S-2, cystatin C

Зовнішні ІД

OMIM: 604312 MGI: 102519 HomoloGene: 78 GeneCards: CST3

Пов'язані генетичні захворювання

hereditary cystatin C amyloid angiopathy, age related macular degeneration 11^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • amyloid-beta binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • endopeptidase inhibitor activity • protease binding
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • базальна мембрана • міжклітинний простір • цитоплазма • лізосома • multivesicular body • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum lumen • аксон • ядерна мембрана • везикула • cell projection • neuronal cell body • contractile fiber • perinuclear region of cytoplasm • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана
Біологічний процес	• negative regulation of proteolysis • defense response • negative regulation of peptidase activity • negative regulation of extracellular matrix disassembly • regulation of tissue remodeling • negative regulation of blood vessel remodeling • negative regulation of elastin catabolic process • negative regulation of collagen catabolic process • neutrophil degranulation • supramolecular fiber organization • розвиток ока • response to hypoxia • cell activation • GO:0097285 апоптоз • GO:0001306 response to oxidative stress • brain development • salivary gland development • embryo implantation • positive regulation of cell population proliferation • male gonad development • response to toxic substance • response to carbohydrate • response to inorganic substance • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to nutrient levels • response to estradiol • cellular response to oxidative stress • circadian sleep/wake cycle, REM sleep • regulation of programmed cell death • посттрансляційна модифікація • positive regulation of DNA replication • response to axon injury • Sertoli cell development • negative regulation of cell death • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • negative regulation of endopeptidase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1471


13010

Ensembl


ENSG00000101439


ENSMUSG00000027447

UniProt


P01034


P21460

RefSeq (мРНК)


NM_001288614 NM_000099


NM_009976

RefSeq (білок)


NP_000090 NP_001275543


NP_034106

Локус (UCSC)

Хр. 20: 23.63 – 23.64 Mb

Хр. 2: 148.71 – 148.72 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Цистатин C (англ. Cystatin C, CST3, Cystatin C, Gamma-trace) — білок, який кодується геном CST3, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 15 799^[5]. Належить до 2-ї групи генетичної родини цистатинів.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGPLRAPLL	LLAILAVALA	VSPAAGSSPG	KPPRLVGGPM	DASVEEEGVR
RALDFAVGEY	NKASNDMYHS	RALQVVRARK	QIVAGVNYFL	DVELGRTTCT
KTQPNLDNCP	FHDQPHLKRK	AFCSFQIYAV	PWQGTMTLSK	STCQDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до інгібіторів тіолових протеаз. Цистатин С міститься у плазмі крові людини. З організму виводиться нирками.

Роль у діагностиці

Дослідження вказують, що рівень цистатину С у плазмі крові є більш точним маркером ниркової функції, ніж рівень креатиніну. Цистатин C на сьогодні розглядається як «золотий стандарт» визначення швидкості клубочкової фільтрації як інтегрального показника функції нирок (дослідження з інулином, хоча й ідеальне з точки зору точності, дуже складне у виконанні і не може розглядатися як рутинне дослідження у медичній практиці). На відміну від креатінину, на швидкість синтезу цистатину C не впливають такі чинники, як вік, стать, м'язова маса, характер харчування, наявність запалень в організмі. У людини нормальний рівень цистатину С у плазмі крові у віці 14 — 50 років становить 0,63-1,33 мг/л, у віці понад 50 років — 0,74-1,55 мг/л^[6].

Усі клітини тіла, що містять ядро, продукують цистатин С зі стабільною швидкістю. Концентрація цистатину С у крові корелює зі швидкістю клубочкової фільтрації. Рівень цього білку в крові не залежить від маси тіла й зросту, від м'язової маси й статі. Підвищення рівня цистатину С після інфаркту міокарду є несприятливим прогностичним чинником, який свідчить про порушення фільтраційної функції нирок.

У ході великого тривалого дослідження було показано, що цистатин С є предиктором хронічної ниркової недостатності та серйозних серцево-судинних захворювань в людей похилого віку.^[7]

У захворюваннях

Мутація гену цистатину С асоційована з амілоїдозом VI типу (цереброартеріальним амілоїдозом). Відкладення білку в головному мозку при цьому автосомно-домінантному спадковому захворюванні призводить до мозкових інсультів, внутрішньочерепних крововиливів, деменції.

Підвищена експресія цистатину С була виявлена у молекулярному шарі зубчастої звивини гіпокампу у 61 пацієнта з скроневою епілепсією. Максимальна експресія спостерігалася у 26 пацієнтів зі склерозом гіпокампу та дисперсією гранулярних клітин.^[8]

Див. також

Хромосома 20

Література

Abrahamson M., Grubb A., Olafsson I., Lundwall A. (1987). Molecular cloning and sequence analysis of cDNA coding for the precursor of the human cysteine proteinase inhibitor cystatin C. FEBS Lett. 216: 229—233. PMID 3495457 DOI:10.1016/0014-5793(87)80695-6
Levy E., Lopez-Otin C., Ghiso J., Geltner D., Frangione B. (1989). Stroke in Icelandic patients with hereditary amyloid angiopathy is related to a mutation in the cystatin C gene, an inhibitor of cysteine proteases. J. Exp. Med. 169: 1771—1778. PMID 2541223 DOI:10.1084/jem.169.5.1771
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Grubb A., Loefberg H. (1982). Human gamma-trace, a basic microprotein: amino acid sequence and presence in the adenohypophysis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79: 3024—3027. PMID 6283552 DOI:10.1073/pnas.79.9.3024
Brzin J., Popovic T., Turk V. (1984). Human cystatin, a new protein inhibitor of cysteine proteinases. Biochem. Biophys. Res. Commun. 118: 103—109. PMID 6365094 DOI:10.1016/0006-291X(84)91073-8
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Цистатин C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2475 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
↑ UniProt, P01034 (англ.) . Процитовано 26 квітня 2018.
↑ umed.in.ua [Архівовано 5 лютого 2016 у Wayback Machine.] Цистатин C
↑ Shlipak MG, Katz R, Sarnak MJ, Fried LF, Newman AB, Stehman-Breen C, Seliger SL, Kestenbaum B, Psaty B, Tracy RP, Siscovick DS. (2006) Cystatin C and prognosis for cardiovascular and kidney outcomes in elderly persons without chronic kidney disease. Ann Intern Med. 2006 Aug 15;145(4):237-46. PMID 16908914 повний текст статті (формат PDF)(англ.) Висновки для пацієнтів: Ann Intern Med. 2006 Aug 15;145 4): I22. SUMMARIES FOR PATIENTS: Preclinical Kidney Disease in Elderly People PMID 16908912 повний текст статті [Архівовано 15 травня 2009 у Wayback Machine.](англ.)
↑ Pirttila, T. J.; Manninen, A.; Jutila, L.; Nissinen, J.; Kalviainen, R.; Vapalahti, M.; Immonen, A.; Paljarvi, L.; Karkola, K.; Alafuzoff, I.; Mervaala, E.; Pitkanen, A. Cystatin C expression is associated with granule cell dispersion in epilepsy. Ann. Neurol. 58: 211—223, 2005. PMID 16049933