Гістон H1c

Ідентифікатори

Символи

H1-2, H1.2, H1C, H1F2, H1s-1, histone cluster 1, H1c, histone cluster 1 H1 family member c, HIST1H1C, H1.2 linker histone, cluster member

Зовнішні ІД

OMIM: 142710 MGI: 1931526 HomoloGene: 68455 GeneCards: H1-2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding
Клітинна компонента	• Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K4 trimethylation • nucleosome assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K27 trimethylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3006


50708

Ensembl


ENSG00000187837


ENSMUSG00000036181

UniProt


P16403


P15864

RefSeq (мРНК)


NM_005319


NM_015786

RefSeq (білок)


NP_005310


NP_056601

Локус (UCSC)

Хр. 6: 26.06 – 26.06 Mb

Хр. 13: 23.92 – 23.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Гістон H1c (англ. Histone cluster 1 H1 family member c) – білок, який кодується геном HIST1H1C, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 21 365^[4].

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAAPA	AAPPAEKAPV	KKKAAKKAGG	TPRKASGPPV	SELITKAVAA
SKERSGVSLA	ALKKALAAAG	YDVEKNNSRI	KLGLKSLVSK	GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK	AASGEAKPKV	KKAGGTKPKK	PVGAAKKPKK	AAGGATPKKS
AKKTPKKAKK	PAAATVTKKV	AKSPKKAKVA	KPKKAAKSAA	KAVKPKAAKP
KVVKPKKAAP	KKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Henschen A.H., Krieglstein K.G., Hamkalo B.A. (1994). A proposal for a coherent mammalian histone H1 nomenclature correlated with amino acid sequences. Protein Sci. 3: 575—587. PMID 8003976 DOI:10.1002/pro.5560030406
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
Eick S., Nicolai M., Mumberg D., Doenecke D. (1989). Human H1 histones: conserved and varied sequence elements in two H1 subtype genes. Eur. J. Cell Biol. 49: 110—115. PMID 2759094

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4716 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P16403 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.