Replikacioni protein A
Replikacioni protein A (heterotrimer) | ||
 | ||
| Prikaz ljudskog replikacionog proteina A, baziran na PDB: 1L1O | ||
| Ime podjedinice | Gen | Hromozomni lokus |
| Replication protein A1 | RPA1 | hr. 17 p13.3 |
| Replication protein A2 | RPA2 | hr. 1 p35.3 |
| Replication protein A3 | RPA3 | hr. 7 p21.3 |
| Replikacioni protein A, C terminal | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | RPA_C | ||||||||
| Pfam | PF08784 | ||||||||
| InterPro | IPR014892 | ||||||||
| |||||||||
Replikacioni protein A (RPA) je protein koji se vezuje za jednolačanu DNK u ćelijama eukariota.[1] Tokom DNK replikacije, RPA sprečava jednolančanu DNK (ssDNA) da se uvije oko same sebe i formira sekundarne strukture. Time se DNK održava u odmotanom stanju tako da polimeraze mogu da je replikuju. RPA se takođe vezuje za ssDNK tokom inicijalne faze homologne rekombinacije, važnog procesa tokom DNK popravke i mejozne profaze I. Slično njenoj ulozi u DNK replikaciji, ona sprečava da se ssDNA veže za samu sebe (samokomplementuje), tako da se na rezultirajući nukleoproteinski filament mogu vezati Rad51 i njegovi kofaktori.[2]
RPA se takođe vezuju za DNK tokom procesa popravke iscesanjem nukleotida. Ovo vezivanje stabilizuje kompleks tokom procesa popravke.
Bakterijski homolog se naziva protein jednolančanog vezivanja (енгл. single-strand binding protein - SSB).
Reference
- ^ Wold, MS (1997). „Replication protein A: heterotrimeric, single-stranded DNA-binding protein required for eukaryotic DNA metabolism”. Annual Review of Biochemistry. 66 (1): 61—92. PMID 9242902. doi:10.1146/annurev.biochem.66.1.61.
- ^ Xuan, L; Wolf-Dietrich, H (2008). „Homologous recombination in DNA repair and DNA damage tolerance”. Cell Research. 18 (99): 99—113. PMID 18166982. doi:10.1038/cr.2008.1.
- p
- r
- u
i inicijacija
| Prokariotska (inicijacija) | |
|---|---|
| Eukariotska (priprema u G1 fazi) | Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) · Održavanje minihromozoma (MCM2 · MCM3 · MCM4 · MCM5 · MCM6 · MCM7) · CDC6 Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3, SSBP4) Primaza: PRIM1 · PRIM2 |
| Oba | Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) · Okazakijev fragment · Prajmer |
| Prokariotska (elongacija) | DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) · Replizom · DNK ligaza · DNK stega · Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment) |
|---|---|
| Eukariotska (sinteza u S fazi) | Replikacioni faktor C (RFC1) · Endonukleaza prepusta (FEN1) · Topoizomeraza · Replikacioni protein A (RPA1) Eukariotska DNK polimeraza: delta (POLD1, POLD2, POLD3, POLD4) DNK stega (PCNA) |
| Oba | Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza |
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
