SUDS3

Гомолог супрессора дефектного сайленсинга 3 (S. cerevisiae)
Идентификаторы
Символ SUDS3 ; SAP45; SDS3
Внешние ID OMIM: 608250 MGI: 1919204 HomoloGene: 15906 GeneCards: Ген SUDS3
Функция • histone deacetylase activity

• protein binding
• enzyme binding
• protein homodimerization activity

• histone deacetylase binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleolus
• cytoplasm
• plasma membrane

• Sin3 complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• transcription, DNA-templated
• apoptotic process
• histone deacetylation
• substantia nigra development
• positive regulation of apoptotic process

• negative regulation of transcription, DNA-templated
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 64426 71954
Ensembl ENSG00000111707 ENSMUSG00000066900
UniProt Q9H7L9 Q8BR65
RefSeq (мРНК) NM_022491 NM_001122666
RefSeq (белок) NP_071936 NP_001116138
Локус (UCSC) Chr 12:
118.81 – 118.86 Mb		 Chr 5:
117.09 – 117.12 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Компонент комплексного корепрессора Sin3 гистондеацетилазы SDS3  — фермент, кодируемый у человека геном SUDS3 .[1][2]

SDS3 является субъединицей гистондеацетилазы (см HDAC1; MIM 601241), зависимой от комплексного корепрессора SIN3A (MIM 607776)[2]

Взаимодействия

SUDS3, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[3][4] HCFC1,[5] SIN3B[1] и SIN3A.[1][4]

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 Alland L., David G., Shen-Li H., Potes J., Muhle R., Lee H.C., Hou H Jr, Chen K., DePinho R.A. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — March (vol. 22, no. 8). — P. 2743—2750. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966. — PMC 133736.
  2. ↑ 1 2 Entrez Gene: SUDS3 suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae)  (неопр.).
  3. ↑ Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2002. — April (vol. 22, no. 8). — P. 2743—2750. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966. — PMC 133736.
  4. ↑ 1 2 Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identification and Characterization of Three New Components of the mSin3A Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2003. — May (vol. 23, no. 10). — P. 3456—3467. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404. — PMC 164750.
  5. ↑ Wysocka, Joanna; Myers Michael P; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Herr Winship. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes & Development : journal. — United States, 2003. — April (vol. 17, no. 7). — P. 896—911. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.

Литература

  • Olsen JV; Blagoev B; Gnad F; Macek, Boris; Kumar, Chanchal; Mortensen, Peter; Mann, Matthias. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 127, no. 3. — P. 635—648. — doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. — PMID 17081983.
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. Identification and Characterization of Three New Components of the mSin3A Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2003. — Vol. 23, no. 10. — P. 3456—3467. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404. — PMC 164750.
  • Wysocka J; Myers MP; Laherty CD; Eisenman, RN; Herr, W. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes & Development : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868. — PMC 196026.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Hattori A; Okumura K; Nagase T; Kikuno, R; Hirosawa, M; Ohara, O. Characterization of long cDNA clones from human adult spleen (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 7, no. 6. — P. 357—366. — doi:10.1093/dnares/7.6.357. — PMID 11214971.