IRF7

Регуляторный фактор интерферона 7
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2O61

Идентификаторы
Символ IRF7 ; IRF-7H; IRF7A; IRF7B; IRF7C; IRF7H
Внешние ID OMIM: 605047 MGI: 1859212 HomoloGene: 128624 GeneCards: Ген IRF7
Функция • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding

• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• DNA binding

• protein binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• cytoplasm
• cytosol

• endosome membrane
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• toll-like receptor signaling pathway
• MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• regulation of adaptive immune response
• transcription from RNA polymerase II promoter
• cellular response to DNA damage stimulus
• response to virus
• immunoglobulin mediated immune response
• establishment of viral latency
• cytokine-mediated signaling pathway
• regulation of type I interferon production
• positive regulation of type I interferon production
• interferon-alpha production
• interferon-beta production
• positive regulation of interferon-alpha production
• positive regulation of interferon-beta production
• regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
• regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• toll-like receptor 3 signaling pathway
• toll-like receptor 4 signaling pathway
• toll-like receptor 9 signaling pathway
• TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
• MDA-5 signaling pathway
• innate immune response
• type I interferon biosynthetic process
• regulation of monocyte differentiation
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• regulation of immune response
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• type I interferon signaling pathway
• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway

• negative regulation of macrophage apoptotic process
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 3665 54123
Ensembl ENSG00000185507 ENSMUSG00000025498
UniProt Q92985 P70434
RefSeq (мРНК) NM_001572 NM_001252600
RefSeq (белок) NP_001563 NP_001239529
Локус (UCSC) Chr 11:
0.61 – 0.62 Mb		 Chr 7:
141.26 – 141.27 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Регуляторный фактор интерферона 7, также известный под именем IRF7, является членом семейства регуляторных факторов транскрипции интерферона.

Функция

IRF7 кодирует регуляторный фактор интерферона 7, члена семейства регуляторных факторов транскрипции интерферона (IRF). IRF7 как было выявлено, играет важную роль в активации транскрипции вирусноиндуцированных клеточных генов, в том числе генов интерферона типа I. В частности, IRF7 регулирует многие интерферон-альфа гены.[1] Конститутивное выражение IRF7 в основном ограничивается лимфоидной тканью, в основном плазмоцитами дендритных клеток, в то время как IRF7 индуцируется во многие ткани. Были определены несколько вариантов транскриптов IRF7, хотя их функциональные последствия ещё не установлены.[2]

Пути IRF7, как было выявлено, подавлены в некоторых метастатических линиях клеток рака молочной железы, что может помочь клеткам избежать иммунного ответа.[3] Восстановление IRF7 этих клеточных линий приводит к снижению метастазов и увеличению времени выживания на животных моделях.

Ген IRF7 и продукт были дефектными у пациентов с тяжелой восприимчивостью к гриппу H1N1 , в то время как при восприимчивости к других вирусных заболеваниям, таких как CMV, RSV и парагриппу, оставались неизменными.[4]

Взаимодействия

IRF7, как было выявлено, взаимодействует с IRF3.[5]

См. также

Примечания

  1. ↑ Marié I., Durbin J.E., Levy D.E. Differential viral induction of distinct interferon-alpha genes by positive feedback through interferon regulatory factor-7 (англ.) // EMBO J. : journal. — 1998. — November (vol. 17, no. 22). — P. 6660—6669. — doi:10.1093/emboj/17.22.6660. — PMID 9822609. — PMC 1171011.
  2. ↑ Entrez Gene: IRF7 interferon regulatory factor 7  (неопр.).
  3. ↑ Bidwell. Silencing of Irf7 pathways in breast cancer cells promotes bone metastasis through immune escape  (неопр.). Nature Medicine (2012). Дата обращения: 23 июля 2012.
  4. ↑ Jean-Laurent Casanova. Toward a Genetic Theory of Childhood Infectious Diseases  (неопр.). NIH (2013). Дата обращения: 21 марта 2015. Архивировано 2 апреля 2015 года.
  5. ↑ Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — February (vol. 280, no. 2). — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.

Литература

  • Ning S., Pagano J.S., Barber G.N. IRF7: activation, regulation, modification and function (англ.) // Genes Immun.[англ.] : journal. — 2011. — Vol. 12, no. 6. — P. 399—414. — doi:10.1038/gene.2011.21. — PMID 21490621.
  • Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., Juang Y.T., Schafer S.L., Burysek L., Hiscott J., Moore P.A. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // Biochimie[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 651—658. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80018-2. — PMID 9865487.
  • Zhang L., Pagano J.S. Structure and function of IRF-7 (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 95—101. — doi:10.1089/107999002753452700. — PMID 11846980.
  • Zhang L., Pagano J.S. IRF-7, a new interferon regulatory factor associated with Epstein-Barr virus latency (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 10. — P. 5748—5757. — PMID 9315633. — PMC 232423.
  • Wathelet M.G., Lin C.H., Parekh B.S., Ronco L.V., Howley P.M., Maniatis T. Virus infection induces the assembly of coordinately activated transcription factors on the IFN-beta enhancer in vivo (англ.) // Mol. Cell[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 1, no. 4. — P. 507—518. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80051-9. — PMID 9660935.
  • Au W.C., Moore P.A., LaFleur D.W., Tombal B., Pitha P.M. Characterization of the interferon regulatory factor-7 and its potential role in the transcription activation of interferon A genes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 44. — P. 29210—29217. — doi:10.1074/jbc.273.44.29210. — PMID 9786932.
  • Lu R., Au W.C., Yeow W.S., Hageman N., Pitha P.M. Regulation of the promoter activity of interferon regulatory factor-7 gene. Activation by interferon snd silencing by hypermethylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 41. — P. 31805—31812. — doi:10.1074/jbc.M005288200. — PMID 10924517.
  • Paris M.J., Williams B.R. Characterization of a 500-kb contig spanning the region between c-Ha-Ras and MUC2 on chromosome 11p15.5 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2001. — Vol. 69, no. 2. — P. 196—202. — doi:10.1006/geno.2000.6339. — PMID 11031102.
  • Marié I., Smith E., Prakash A., Levy D.E. Phosphorylation-Induced Dimerization of Interferon Regulatory Factor 7 Unmasks DNA Binding and a Bipartite Transactivation Domain (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 23. — P. 8803—8814. — doi:10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000. — PMID 11073981. — PMC 86519.
  • Smith E.J., Marié I., Prakash A., García-Sastre A., Levy D.E. IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 12. — P. 8951—8957. — doi:10.1074/jbc.M008717200. — PMID 11124948.
  • Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — Vol. 280, no. 2. — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.
  • Lu R., Moore P.A., Pitha P.M. Stimulation of IRF-7 gene expression by tumor necrosis factor alpha: requirement for NFkappa B transcription factor and gene accessibility (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 19. — P. 16592—16598. — doi:10.1074/jbc.M111440200. — PMID 11877397.
  • Morin P., Bragança J., Bandu M.T., Lin R., Hiscott J., Doly J., Civas A. Preferential binding sites for interferon regulatory factors 3 and 7 involved in interferon-A gene transcription (англ.) // J. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 316, no. 5. — P. 1009—1022. — doi:10.1006/jmbi.2001.5401. — PMID 11884139.
  • Caillaud A., Prakash A., Smith E., Masumi A., Hovanessian A.G., Levy D.E., Marié I. Acetylation of interferon regulatory factor-7 by p300/CREB-binding protein (CBP)-associated factor (PCAF) impairs its DNA binding (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 277, no. 51. — P. 49417—49421. — doi:10.1074/jbc.M207484200. — PMID 12374802.
  • Izmailova E., Bertley F.M., Huang Q., Makori N., Miller C.J., Young R.A., Aldovini A. HIV-1 Tat reprograms immature dendritic cells to express chemoattractants for activated T cells and macrophages (англ.) // Nat. Med. : journal. — 2003. — Vol. 9, no. 2. — P. 191—197. — doi:10.1038/nm822. — PMID 12539042.
  • Yang H., Lin C.H., Ma G., Baffi M.O., Wathelet M.G. Interferon regulatory factor-7 synergizes with other transcription factors through multiple interactions with p300/CBP coactivators (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 18. — P. 15495—15504. — doi:10.1074/jbc.M212940200. — PMID 12604599.
  • Ning S., Hahn A.M., Huye L.E., Pagano J.S. Interferon Regulatory Factor 7 Regulates Expression of Epstein-Barr Virus Latent Membrane Protein 1: a Regulatory Circuit (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 77, no. 17. — P. 9359—9368. — doi:10.1128/JVI.77.17.9359-9368.2003. — PMID 12915551. — PMC 187426.
  • Fitzgerald K.A., Rowe D.C., Barnes B.J., Caffrey D.R., Visintin A., Latz E., Monks B., Pitha P.M., Golenbock D.T. LPS-TLR4 Signaling to IRF-3/7 and NF-κB Involves the Toll Adapters TRAM and TRIF (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2003. — Vol. 198, no. 7. — P. 1043—1055. — doi:10.1084/jem.20031023. — PMID 14517278. — PMC 2194210.
  • Lin R., Noyce R.S., Collins S.E., Everett R.D., Mossman K.L. The Herpes Simplex Virus ICP0 RING Finger Domain Inhibits IRF3- and IRF7-Mediated Activation of Interferon-Stimulated Genes (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 78, no. 4. — P. 1675—1684. — doi:10.1128/JVI.78.4.1675-1684.2004. — PMID 14747533. — PMC 369457.